MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	TCCG	2	8	80	87	0 %	25 %	25 %	50 %	387144421
2	NC_017352	GTCC	2	8	375	382	0 %	25 %	25 %	50 %	387144421
3	NC_017352	AAAT	2	8	743	750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017352	TACT	2	8	1282	1289	25 %	50 %	0 %	25 %	387144422
5	NC_017352	TCTT	2	8	1623	1630	0 %	75 %	0 %	25 %	387144423
6	NC_017352	ATGT	2	8	1857	1864	25 %	50 %	25 %	0 %	387144423
7	NC_017352	TCTT	2	8	3089	3096	0 %	75 %	0 %	25 %	387144424
8	NC_017352	ATTT	2	8	3890	3897	25 %	75 %	0 %	0 %	387144425
9	NC_017352	TTTA	2	8	4082	4089	25 %	75 %	0 %	0 %	387144425
10	NC_017352	TACA	2	8	4355	4362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017352	ACCT	2	8	4682	4689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017352	AAAT	2	8	4973	4980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017352	AAAT	2	8	4988	4995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017352	CTAG	2	8	5240	5247	25 %	25 %	25 %	25 %	387144426
15	NC_017352	ATAA	2	8	5643	5650	75 %	25 %	0 %	0 %	387144426
16	NC_017352	GCTT	2	8	5705	5712	0 %	50 %	25 %	25 %	387144426
17	NC_017352	CCGA	2	8	6058	6065	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017352	GTTG	2	8	6206	6213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017352	CTAA	2	8	6277	6284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017352	TGTA	2	8	6925	6932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017352	TTTG	2	8	7219	7226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017352	TTTA	2	8	7416	7423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017352	GCTA	2	8	7829	7836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017352	AGTA	2	8	8762	8769	50 %	25 %	25 %	0 %	387144428
25	NC_017352	TTCA	2	8	8885	8892	25 %	50 %	0 %	25 %	387144429
26	NC_017352	ACTA	2	8	9028	9035	50 %	25 %	0 %	25 %	387144429
27	NC_017352	CATA	2	8	9187	9194	50 %	25 %	0 %	25 %	387144429
28	NC_017352	AAAT	2	8	9610	9617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017352	TCTA	2	8	9875	9882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017352	TAAA	2	8	9953	9960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017352	TCAT	2	8	11225	11232	25 %	50 %	0 %	25 %	387144430
32	NC_017352	TCTA	2	8	11578	11585	25 %	50 %	0 %	25 %	387144430
33	NC_017352	CATT	2	8	11588	11595	25 %	50 %	0 %	25 %	387144430
34	NC_017352	TGGA	2	8	11597	11604	25 %	25 %	50 %	0 %	387144430
35	NC_017352	CATA	2	8	11631	11638	50 %	25 %	0 %	25 %	387144430
36	NC_017352	AAAC	2	8	12240	12247	75 %	0 %	0 %	25 %	387144431
37	NC_017352	AATT	2	8	12299	12306	50 %	50 %	0 %	0 %	387144431
38	NC_017352	AAGA	2	8	12351	12358	75 %	0 %	25 %	0 %	387144431
39	NC_017352	TAAA	2	8	12589	12596	75 %	25 %	0 %	0 %	387144431
40	NC_017352	CAAC	2	8	12767	12774	50 %	0 %	0 %	50 %	387144431
41	NC_017352	GTTT	2	8	12952	12959	0 %	75 %	25 %	0 %	387144431
42	NC_017352	TAAT	2	8	12971	12978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017352	GTTT	2	8	13226	13233	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017352	TAAT	2	8	13721	13728	50 %	50 %	0 %	0 %	387144432
45	NC_017352	CATA	2	8	14363	14370	50 %	25 %	0 %	25 %	387144433
46	NC_017352	ATTA	2	8	15054	15061	50 %	50 %	0 %	0 %	387144433
47	NC_017352	CTTT	2	8	15169	15176	0 %	75 %	0 %	25 %	387144433
48	NC_017352	TAAT	2	8	15476	15483	50 %	50 %	0 %	0 %	387144433
49	NC_017352	AAAC	2	8	15507	15514	75 %	0 %	0 %	25 %	387144433
50	NC_017352	AATA	2	8	16362	16369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017352	CGTT	2	8	16384	16391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017352	AATG	2	8	16461	16468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017352	GTTA	2	8	16936	16943	25 %	50 %	25 %	0 %	387144435
54	NC_017352	CAAT	2	8	17233	17240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017352	TTCA	2	8	17559	17566	25 %	50 %	0 %	25 %	387144436
56	NC_017352	TCAT	2	8	17849	17856	25 %	50 %	0 %	25 %	387144436
57	NC_017352	TCTA	2	8	18088	18095	25 %	50 %	0 %	25 %	387144437
58	NC_017352	AATA	2	8	18334	18341	75 %	25 %	0 %	0 %	387144437
59	NC_017352	TTGT	2	8	18552	18559	0 %	75 %	25 %	0 %	387144437
60	NC_017352	CTAG	2	8	18620	18627	25 %	25 %	25 %	25 %	387144437
61	NC_017352	TTAA	2	8	18891	18898	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
62	NC_017352	CGTG	2	8	18954	18961	0 %	25 %	50 %	25 %	387144438
63	NC_017352	ATAC	2	8	19081	19088	50 %	25 %	0 %	25 %	387144438
64	NC_017352	TGAA	2	8	19151	19158	50 %	25 %	25 %	0 %	387144438
65	NC_017352	TTGC	2	8	20153	20160	0 %	50 %	25 %	25 %	387144438
66	NC_017352	TTAG	2	8	20226	20233	25 %	50 %	25 %	0 %	387144438
67	NC_017352	TAAG	2	8	20360	20367	50 %	25 %	25 %	0 %	387144439
68	NC_017352	TCGT	2	8	20571	20578	0 %	50 %	25 %	25 %	387144439
69	NC_017352	CGTT	2	8	21058	21065	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017352	TACT	2	8	21089	21096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017352	TTCA	2	8	21106	21113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017352	AAAT	2	8	21158	21165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017352	TGAA	2	8	21169	21176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017352	AAAG	2	8	21196	21203	75 %	0 %	25 %	0 %	387144440
75	NC_017352	TTAC	2	8	21330	21337	25 %	50 %	0 %	25 %	387144440
76	NC_017352	TACG	2	8	21420	21427	25 %	25 %	25 %	25 %	387144440
77	NC_017352	AAGA	2	8	21533	21540	75 %	0 %	25 %	0 %	387144440
78	NC_017352	ATGG	2	8	22299	22306	25 %	25 %	50 %	0 %	387144441
79	NC_017352	TCTA	2	8	22753	22760	25 %	50 %	0 %	25 %	387144441
80	NC_017352	TAAG	2	8	23524	23531	50 %	25 %	25 %	0 %	387144441
81	NC_017352	TCTT	2	8	24113	24120	0 %	75 %	0 %	25 %	387144442
82	NC_017352	ATGT	2	8	24347	24354	25 %	50 %	25 %	0 %	387144442
83	NC_017352	GTAA	2	8	24970	24977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017352	GGTA	2	8	25149	25156	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017352	ATAA	2	8	25626	25633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017352	ATAA	2	8	26143	26150	75 %	25 %	0 %	0 %	387144443
87	NC_017352	TGAA	2	8	26164	26171	50 %	25 %	25 %	0 %	387144444
88	NC_017352	GAAT	2	8	26250	26257	50 %	25 %	25 %	0 %	387144444
89	NC_017352	CCTA	2	8	26292	26299	25 %	25 %	0 %	50 %	387144444
90	NC_017352	ATTT	2	8	26317	26324	25 %	75 %	0 %	0 %	387144444
91	NC_017352	AGTT	2	8	26415	26422	25 %	50 %	25 %	0 %	387144444
92	NC_017352	AAAG	2	8	26443	26450	75 %	0 %	25 %	0 %	387144444
93	NC_017352	CTTC	2	8	26721	26728	0 %	50 %	0 %	50 %	387144445
94	NC_017352	TCTA	2	8	27009	27016	25 %	50 %	0 %	25 %	387144445
95	NC_017352	ATGT	2	8	27413	27420	25 %	50 %	25 %	0 %	387144446
96	NC_017352	AGCC	2	8	28071	28078	25 %	0 %	25 %	50 %	387144447
97	NC_017352	AGTC	2	8	28373	28380	25 %	25 %	25 %	25 %	387144447
98	NC_017352	GAAT	2	8	28552	28559	50 %	25 %	25 %	0 %	387144447
99	NC_017352	AGCG	2	8	28704	28711	25 %	0 %	50 %	25 %	387144447
100	NC_017352	ATCG	2	8	29153	29160	25 %	25 %	25 %	25 %	387144447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.