MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	AAAT	2	8	743	750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017352	TACA	2	8	4355	4362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017352	ACCT	2	8	4682	4689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017352	AAAT	2	8	4973	4980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017352	AAAT	2	8	4988	4995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017352	CCGA	2	8	6058	6065	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017352	GTTG	2	8	6206	6213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017352	CTAA	2	8	6277	6284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017352	TGTA	2	8	6925	6932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017352	TTTG	2	8	7219	7226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017352	TTTA	2	8	7416	7423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017352	GCTA	2	8	7829	7836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017352	AAAT	2	8	9610	9617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017352	TCTA	2	8	9875	9882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017352	TAAA	2	8	9953	9960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017352	TAAT	2	8	12971	12978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017352	GTTT	2	8	13226	13233	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017352	AATA	2	8	16362	16369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017352	CGTT	2	8	16384	16391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017352	AATG	2	8	16461	16468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017352	CAAT	2	8	17233	17240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017352	CGTT	2	8	21058	21065	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017352	TACT	2	8	21089	21096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017352	TTCA	2	8	21106	21113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017352	AAAT	2	8	21158	21165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017352	TGAA	2	8	21169	21176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017352	GTAA	2	8	24970	24977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017352	GGTA	2	8	25149	25156	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017352	ATAA	2	8	25626	25633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.