MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	TCCG	2	8	80	87	0 %	25 %	25 %	50 %	387144421
2	NC_017352	GTCC	2	8	375	382	0 %	25 %	25 %	50 %	387144421
3	NC_017352	TACT	2	8	1282	1289	25 %	50 %	0 %	25 %	387144422
4	NC_017352	TCTT	2	8	1623	1630	0 %	75 %	0 %	25 %	387144423
5	NC_017352	ATGT	2	8	1857	1864	25 %	50 %	25 %	0 %	387144423
6	NC_017352	TCTT	2	8	3089	3096	0 %	75 %	0 %	25 %	387144424
7	NC_017352	ATTT	2	8	3890	3897	25 %	75 %	0 %	0 %	387144425
8	NC_017352	TTTA	2	8	4082	4089	25 %	75 %	0 %	0 %	387144425
9	NC_017352	CTAG	2	8	5240	5247	25 %	25 %	25 %	25 %	387144426
10	NC_017352	ATAA	2	8	5643	5650	75 %	25 %	0 %	0 %	387144426
11	NC_017352	GCTT	2	8	5705	5712	0 %	50 %	25 %	25 %	387144426
12	NC_017352	AGTA	2	8	8762	8769	50 %	25 %	25 %	0 %	387144428
13	NC_017352	TTCA	2	8	8885	8892	25 %	50 %	0 %	25 %	387144429
14	NC_017352	ACTA	2	8	9028	9035	50 %	25 %	0 %	25 %	387144429
15	NC_017352	CATA	2	8	9187	9194	50 %	25 %	0 %	25 %	387144429
16	NC_017352	TCAT	2	8	11225	11232	25 %	50 %	0 %	25 %	387144430
17	NC_017352	TCTA	2	8	11578	11585	25 %	50 %	0 %	25 %	387144430
18	NC_017352	CATT	2	8	11588	11595	25 %	50 %	0 %	25 %	387144430
19	NC_017352	TGGA	2	8	11597	11604	25 %	25 %	50 %	0 %	387144430
20	NC_017352	CATA	2	8	11631	11638	50 %	25 %	0 %	25 %	387144430
21	NC_017352	AAAC	2	8	12240	12247	75 %	0 %	0 %	25 %	387144431
22	NC_017352	AATT	2	8	12299	12306	50 %	50 %	0 %	0 %	387144431
23	NC_017352	AAGA	2	8	12351	12358	75 %	0 %	25 %	0 %	387144431
24	NC_017352	TAAA	2	8	12589	12596	75 %	25 %	0 %	0 %	387144431
25	NC_017352	CAAC	2	8	12767	12774	50 %	0 %	0 %	50 %	387144431
26	NC_017352	GTTT	2	8	12952	12959	0 %	75 %	25 %	0 %	387144431
27	NC_017352	TAAT	2	8	13721	13728	50 %	50 %	0 %	0 %	387144432
28	NC_017352	CATA	2	8	14363	14370	50 %	25 %	0 %	25 %	387144433
29	NC_017352	ATTA	2	8	15054	15061	50 %	50 %	0 %	0 %	387144433
30	NC_017352	CTTT	2	8	15169	15176	0 %	75 %	0 %	25 %	387144433
31	NC_017352	TAAT	2	8	15476	15483	50 %	50 %	0 %	0 %	387144433
32	NC_017352	AAAC	2	8	15507	15514	75 %	0 %	0 %	25 %	387144433
33	NC_017352	GTTA	2	8	16936	16943	25 %	50 %	25 %	0 %	387144435
34	NC_017352	TTCA	2	8	17559	17566	25 %	50 %	0 %	25 %	387144436
35	NC_017352	TCAT	2	8	17849	17856	25 %	50 %	0 %	25 %	387144436
36	NC_017352	TCTA	2	8	18088	18095	25 %	50 %	0 %	25 %	387144437
37	NC_017352	AATA	2	8	18334	18341	75 %	25 %	0 %	0 %	387144437
38	NC_017352	TTGT	2	8	18552	18559	0 %	75 %	25 %	0 %	387144437
39	NC_017352	CTAG	2	8	18620	18627	25 %	25 %	25 %	25 %	387144437
40	NC_017352	TTAA	2	8	18891	18898	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
41	NC_017352	CGTG	2	8	18954	18961	0 %	25 %	50 %	25 %	387144438
42	NC_017352	ATAC	2	8	19081	19088	50 %	25 %	0 %	25 %	387144438
43	NC_017352	TGAA	2	8	19151	19158	50 %	25 %	25 %	0 %	387144438
44	NC_017352	TTGC	2	8	20153	20160	0 %	50 %	25 %	25 %	387144438
45	NC_017352	TTAG	2	8	20226	20233	25 %	50 %	25 %	0 %	387144438
46	NC_017352	TAAG	2	8	20360	20367	50 %	25 %	25 %	0 %	387144439
47	NC_017352	TCGT	2	8	20571	20578	0 %	50 %	25 %	25 %	387144439
48	NC_017352	AAAG	2	8	21196	21203	75 %	0 %	25 %	0 %	387144440
49	NC_017352	TTAC	2	8	21330	21337	25 %	50 %	0 %	25 %	387144440
50	NC_017352	TACG	2	8	21420	21427	25 %	25 %	25 %	25 %	387144440
51	NC_017352	AAGA	2	8	21533	21540	75 %	0 %	25 %	0 %	387144440
52	NC_017352	ATGG	2	8	22299	22306	25 %	25 %	50 %	0 %	387144441
53	NC_017352	TCTA	2	8	22753	22760	25 %	50 %	0 %	25 %	387144441
54	NC_017352	TAAG	2	8	23524	23531	50 %	25 %	25 %	0 %	387144441
55	NC_017352	TCTT	2	8	24113	24120	0 %	75 %	0 %	25 %	387144442
56	NC_017352	ATGT	2	8	24347	24354	25 %	50 %	25 %	0 %	387144442
57	NC_017352	ATAA	2	8	26143	26150	75 %	25 %	0 %	0 %	387144443
58	NC_017352	TGAA	2	8	26164	26171	50 %	25 %	25 %	0 %	387144444
59	NC_017352	GAAT	2	8	26250	26257	50 %	25 %	25 %	0 %	387144444
60	NC_017352	CCTA	2	8	26292	26299	25 %	25 %	0 %	50 %	387144444
61	NC_017352	ATTT	2	8	26317	26324	25 %	75 %	0 %	0 %	387144444
62	NC_017352	AGTT	2	8	26415	26422	25 %	50 %	25 %	0 %	387144444
63	NC_017352	AAAG	2	8	26443	26450	75 %	0 %	25 %	0 %	387144444
64	NC_017352	CTTC	2	8	26721	26728	0 %	50 %	0 %	50 %	387144445
65	NC_017352	TCTA	2	8	27009	27016	25 %	50 %	0 %	25 %	387144445
66	NC_017352	ATGT	2	8	27413	27420	25 %	50 %	25 %	0 %	387144446
67	NC_017352	AGCC	2	8	28071	28078	25 %	0 %	25 %	50 %	387144447
68	NC_017352	AGTC	2	8	28373	28380	25 %	25 %	25 %	25 %	387144447
69	NC_017352	GAAT	2	8	28552	28559	50 %	25 %	25 %	0 %	387144447
70	NC_017352	AGCG	2	8	28704	28711	25 %	0 %	50 %	25 %	387144447
71	NC_017352	ATCG	2	8	29153	29160	25 %	25 %	25 %	25 %	387144447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.