MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	GAT	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017352	TAA	2	6	786	791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017352	AGA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017352	TAA	2	6	2232	2237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017352	CTA	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017352	CAA	2	6	2432	2437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017352	TGA	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017352	CCT	2	6	2495	2500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017352	TAT	3	9	2540	2548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017352	GTC	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017352	AGA	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017352	ATC	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017352	TAA	2	6	2691	2696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017352	ATT	2	6	2830	2835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017352	ATC	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017352	TAC	2	6	2884	2889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017352	TCC	2	6	3583	3588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017352	ATT	2	6	3612	3617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017352	CCA	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017352	GTG	2	6	4263	4268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017352	CAT	2	6	4413	4418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017352	CGT	2	6	4627	4632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017352	TAA	2	6	4895	4900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017352	TCA	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017352	AAC	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017352	ACC	2	6	5007	5012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017352	GGT	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017352	TTC	3	9	5078	5086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017352	ATA	2	6	5135	5140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017352	ATA	2	6	5223	5228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017352	TAT	2	6	5936	5941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017352	GAA	2	6	6175	6180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017352	CAA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017352	TTG	2	6	6329	6334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017352	TAA	2	6	6363	6368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017352	AAG	2	6	6455	6460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017352	TGT	2	6	6507	6512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017352	TGG	2	6	6690	6695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017352	TGA	2	6	6765	6770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017352	GAA	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017352	ATT	3	9	6839	6847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017352	TGA	2	6	6859	6864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017352	TAT	2	6	7019	7024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017352	AGA	2	6	7291	7296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017352	ATT	2	6	7432	7437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017352	GAC	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017352	GAA	2	6	7607	7612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017352	CAT	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017352	GTT	2	6	7935	7940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017352	TAT	2	6	7971	7976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017352	TAG	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017352	TAT	2	6	8004	8009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017352	TAT	2	6	9222	9227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017352	AAT	2	6	9242	9247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017352	TTC	2	6	9377	9382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017352	CGT	2	6	9414	9419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017352	TTC	2	6	9451	9456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017352	ATC	3	9	9469	9477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017352	CAA	2	6	9501	9506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017352	AAG	2	6	9538	9543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017352	ATT	2	6	9576	9581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017352	AAC	2	6	9603	9608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017352	CAA	2	6	10189	10194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017352	TCA	2	6	10314	10319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017352	ATT	2	6	10340	10345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017352	AAT	2	6	10350	10355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017352	TAA	2	6	10421	10426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017352	ATT	2	6	10428	10433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017352	ATA	2	6	10513	10518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017352	TCT	2	6	10565	10570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017352	TCA	2	6	10589	10594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017352	CCA	2	6	10664	10669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017352	CGT	2	6	10733	10738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017352	GAT	2	6	10756	10761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017352	TTA	2	6	11899	11904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017352	CAC	2	6	12038	12043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017352	AGT	2	6	12098	12103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017352	GTA	2	6	12111	12116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017352	GGT	2	6	12152	12157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017352	ATC	2	6	13035	13040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017352	AGA	2	6	13075	13080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017352	CAT	2	6	13136	13141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017352	ATC	2	6	13851	13856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017352	TTA	2	6	13867	13872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017352	TAA	2	6	13877	13882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017352	ATT	2	6	13883	13888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017352	ATT	2	6	13906	13911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017352	TAA	3	9	13943	13951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017352	ACA	2	6	15665	15670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017352	ATT	2	6	15712	15717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017352	TAC	3	9	16412	16420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017352	AAT	2	6	16477	16482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017352	TTA	2	6	17102	17107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017352	ATT	2	6	17162	17167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017352	ATA	2	6	17866	17871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017352	CAA	2	6	17911	17916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017352	CCT	2	6	20828	20833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017352	ATT	2	6	21002	21007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017352	ATG	2	6	21127	21132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017352	GAT	2	6	21182	21187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017352	GAA	2	6	23794	23799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017352	CAG	2	6	23859	23864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017352	AGA	2	6	24647	24652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017352	TGC	2	6	25002	25007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017352	CTG	2	6	25118	25123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017352	GAG	2	6	25162	25167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017352	TGC	2	6	25254	25259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017352	TTG	2	6	25295	25300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017352	TGT	2	6	25436	25441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017352	GAA	2	6	25550	25555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017352	CTT	2	6	25561	25566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017352	ATT	2	6	25661	25666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017352	AGG	2	6	29535	29540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017352	AGG	2	6	29571	29576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.