MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	CGG	2	6	137	142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387144421
2	NC_017352	TGA	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144421
3	NC_017352	GTC	2	6	220	225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387144421
4	NC_017352	ACG	2	6	488	493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144421
5	NC_017352	GAG	2	6	610	615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387144421
6	NC_017352	CTA	2	6	623	628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144421
7	NC_017352	TGT	2	6	637	642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144421
8	NC_017352	TAT	2	6	878	883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144422
9	NC_017352	CAT	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144422
10	NC_017352	TTG	2	6	1259	1264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144422
11	NC_017352	GGT	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144422
12	NC_017352	CCT	2	6	1369	1374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387144422
13	NC_017352	ATG	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
14	NC_017352	TCA	2	6	1925	1930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144423
15	NC_017352	TAA	2	6	1943	1948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144423
16	NC_017352	TTC	2	6	1964	1969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144423
17	NC_017352	ATG	2	6	2023	2028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
18	NC_017352	TAG	2	6	2093	2098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
19	NC_017352	CTT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
20	NC_017352	CCA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387144424
21	NC_017352	AAG	2	6	3176	3181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144424
22	NC_017352	ATT	2	6	3261	3266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144424
23	NC_017352	GAA	2	6	3277	3282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144424
24	NC_017352	CTT	2	6	3293	3298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
25	NC_017352	CAT	2	6	3314	3319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144424
26	NC_017352	TCA	2	6	3373	3378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144424
27	NC_017352	AAC	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144424
28	NC_017352	GCA	2	6	3478	3483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144424
29	NC_017352	ATA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144424
30	NC_017352	TAA	2	6	3545	3550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144424
31	NC_017352	TTC	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
32	NC_017352	AAT	3	9	3710	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
33	NC_017352	ATA	2	6	3762	3767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
34	NC_017352	TAA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
35	NC_017352	ATA	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
36	NC_017352	ATT	2	6	3863	3868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144425
37	NC_017352	TAA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
38	NC_017352	TAT	2	6	3953	3958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144425
39	NC_017352	TAA	2	6	4003	4008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
40	NC_017352	ACA	2	6	4024	4029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144425
41	NC_017352	GAA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144425
42	NC_017352	ATG	2	6	5249	5254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
43	NC_017352	GAA	2	6	5289	5294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144426
44	NC_017352	GAT	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
45	NC_017352	ATT	2	6	5419	5424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144426
46	NC_017352	TAA	2	6	5547	5552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
47	NC_017352	TAA	2	6	5559	5564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
48	NC_017352	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
49	NC_017352	TTG	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144426
50	NC_017352	ATG	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
51	NC_017352	TAG	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
52	NC_017352	AAT	2	6	5901	5906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
53	NC_017352	TAA	2	6	8257	8262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144427
54	NC_017352	AAT	2	6	8263	8268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144427
55	NC_017352	ATG	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144427
56	NC_017352	TCT	2	6	8391	8396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144427
57	NC_017352	ATA	2	6	8407	8412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144427
58	NC_017352	TCT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144427
59	NC_017352	ATC	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144427
60	NC_017352	AAT	3	9	8615	8623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144428
61	NC_017352	AAT	2	6	8645	8650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144428
62	NC_017352	CAA	2	6	8677	8682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144428
63	NC_017352	AAG	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144428
64	NC_017352	ATA	2	6	9044	9049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144429
65	NC_017352	TAA	2	6	9118	9123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144429
66	NC_017352	TAA	2	6	9130	9135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144429
67	NC_017352	AGC	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144429
68	NC_017352	ATT	2	6	10809	10814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
69	NC_017352	TTC	2	6	10870	10875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144430
70	NC_017352	TCT	2	6	10991	10996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144430
71	NC_017352	ATA	2	6	11002	11007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
72	NC_017352	TAA	2	6	11058	11063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
73	NC_017352	GTT	2	6	11106	11111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144430
74	NC_017352	TTC	2	6	11119	11124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144430
75	NC_017352	ATT	2	6	11149	11154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
76	NC_017352	GAT	2	6	11169	11174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144430
77	NC_017352	ATG	2	6	11188	11193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144430
78	NC_017352	ATT	3	9	11194	11202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
79	NC_017352	ATA	2	6	11219	11224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
80	NC_017352	TAT	2	6	11271	11276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
81	NC_017352	TAA	2	6	11419	11424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
82	NC_017352	TTA	2	6	11441	11446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
83	NC_017352	TAA	2	6	11467	11472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
84	NC_017352	TTA	2	6	11546	11551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
85	NC_017352	TTA	2	6	11570	11575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
86	NC_017352	TAA	2	6	11623	11628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
87	NC_017352	CTG	2	6	11649	11654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387144430
88	NC_017352	ATA	2	6	11753	11758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
89	NC_017352	TAA	2	6	11789	11794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
90	NC_017352	TGA	2	6	12221	12226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144431
91	NC_017352	TAA	2	6	12254	12259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144431
92	NC_017352	AAT	2	6	12438	12443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144431
93	NC_017352	AAC	2	6	12553	12558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144431
94	NC_017352	CAA	2	6	12564	12569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144431
95	NC_017352	CAA	2	6	12609	12614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144431
96	NC_017352	TAA	2	6	12632	12637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144431
97	NC_017352	AGA	3	9	12665	12673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144431
98	NC_017352	AAG	2	6	12733	12738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144431
99	NC_017352	GAA	2	6	12750	12755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144431
100	NC_017352	GAA	2	6	12888	12893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144431
101	NC_017352	AAT	2	6	13279	13284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144432
102	NC_017352	TCA	2	6	13294	13299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144432
103	NC_017352	AGT	2	6	13477	13482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144432
104	NC_017352	AAT	3	9	13488	13496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144432
105	NC_017352	TAA	2	6	13650	13655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144432
106	NC_017352	TAA	2	6	13683	13688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144432
107	NC_017352	CTA	2	6	13772	13777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144432
108	NC_017352	TCA	2	6	13841	13846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144432
109	NC_017352	CTA	2	6	14129	14134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144433
110	NC_017352	CAT	2	6	14153	14158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144433
111	NC_017352	ATG	2	6	14162	14167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144433
112	NC_017352	TTC	2	6	14235	14240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144433
113	NC_017352	TGA	2	6	14274	14279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144433
114	NC_017352	AGA	2	6	14316	14321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144433
115	NC_017352	CAG	2	6	14381	14386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144433
116	NC_017352	ATT	2	6	14422	14427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144433
117	NC_017352	ATA	2	6	14524	14529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144433
118	NC_017352	CGC	2	6	14589	14594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387144433
119	NC_017352	TTC	2	6	14676	14681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144433
120	NC_017352	TAA	2	6	14706	14711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144433
121	NC_017352	GCA	2	6	14746	14751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144433
122	NC_017352	AAT	2	6	14877	14882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144433
123	NC_017352	CTT	2	6	14894	14899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144433
124	NC_017352	TAA	2	6	15009	15014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144433
125	NC_017352	TAT	2	6	15036	15041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144433
126	NC_017352	CTC	2	6	15098	15103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387144433
127	NC_017352	AGT	2	6	15210	15215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144433
128	NC_017352	ATT	2	6	15220	15225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144433
129	NC_017352	TAA	2	6	15330	15335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144433
130	NC_017352	AAC	2	6	15501	15506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144433
131	NC_017352	TAC	2	6	15525	15530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144433
132	NC_017352	TCA	2	6	15557	15562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144433
133	NC_017352	AGT	2	6	15567	15572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144433
134	NC_017352	TGA	2	6	15769	15774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144434
135	NC_017352	ATT	2	6	15809	15814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144434
136	NC_017352	ACT	3	9	15837	15845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144434
137	NC_017352	AGT	2	6	15870	15875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144434
138	NC_017352	TAT	2	6	15888	15893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144434
139	NC_017352	AGA	2	6	15938	15943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144434
140	NC_017352	AAC	2	6	16031	16036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144434
141	NC_017352	TAT	2	6	16044	16049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144434
142	NC_017352	AAT	2	6	16064	16069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144434
143	NC_017352	AGG	2	6	16165	16170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387144434
144	NC_017352	ATG	2	6	16198	16203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144434
145	NC_017352	AGC	2	6	16223	16228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144434
146	NC_017352	GTA	2	6	16688	16693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144435
147	NC_017352	TTG	2	6	16894	16899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144435
148	NC_017352	ATA	3	9	16973	16981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144435
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150	NC_017352	CTT	2	6	17330	17335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144436
151	NC_017352	CCA	2	6	17345	17350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387144436
152	NC_017352	GAT	2	6	17354	17359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144436
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154	NC_017352	AAT	2	6	17628	17633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144436
155	NC_017352	TCA	2	6	17635	17640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144436
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159	NC_017352	TCG	2	6	18150	18155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387144437
160	NC_017352	TCA	2	6	18359	18364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144437
161	NC_017352	CTA	2	6	18417	18422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144437
162	NC_017352	ATA	2	6	18597	18602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144437
163	NC_017352	ATC	2	6	18604	18609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144437
164	NC_017352	AGA	2	6	18688	18693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144437
165	NC_017352	GTG	2	6	18903	18908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144438
166	NC_017352	TCT	2	6	18941	18946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144438
167	NC_017352	AAT	2	6	18985	18990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
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171	NC_017352	ATT	2	6	19364	19369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
172	NC_017352	GTT	2	6	19387	19392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144438
173	NC_017352	TAT	2	6	19579	19584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
174	NC_017352	ATA	2	6	19686	19691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
175	NC_017352	TAA	2	6	19876	19881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
176	NC_017352	ATT	2	6	19916	19921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
177	NC_017352	AAT	2	6	19930	19935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
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179	NC_017352	TAT	2	6	20050	20055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
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250	NC_017352	TTG	2	6	27554	27559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144446
251	NC_017352	TTG	2	6	27577	27582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144446
252	NC_017352	TGG	2	6	27633	27638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144446
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.