MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	AC	3	6	305	310	50 %	0 %	0 %	50 %	387144421
2	NC_017352	TA	3	6	1205	1210	50 %	50 %	0 %	0 %	387144422
3	NC_017352	TA	3	6	1554	1559	50 %	50 %	0 %	0 %	387144423
4	NC_017352	AT	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	387144423
5	NC_017352	CT	3	6	2499	2504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017352	GA	3	6	2524	2529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017352	TA	3	6	2599	2604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017352	AT	3	6	2774	2779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017352	TC	3	6	2814	2819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017352	AT	3	6	3400	3405	50 %	50 %	0 %	0 %	387144424
11	NC_017352	TA	3	6	3624	3629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017352	TC	3	6	4157	4162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017352	TA	3	6	4387	4392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017352	AT	4	8	4454	4461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017352	TA	3	6	5310	5315	50 %	50 %	0 %	0 %	387144426
16	NC_017352	TC	3	6	5801	5806	0 %	50 %	0 %	50 %	387144426
17	NC_017352	AT	3	6	5817	5822	50 %	50 %	0 %	0 %	387144426
18	NC_017352	TA	3	6	6445	6450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017352	AT	3	6	7237	7242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017352	TA	3	6	7762	7767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017352	TC	3	6	7922	7927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017352	TA	3	6	8167	8172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017352	CT	3	6	8237	8242	0 %	50 %	0 %	50 %	387144427
24	NC_017352	TA	3	6	8311	8316	50 %	50 %	0 %	0 %	387144427
25	NC_017352	AC	3	6	8379	8384	50 %	0 %	0 %	50 %	387144427
26	NC_017352	TA	3	6	8639	8644	50 %	50 %	0 %	0 %	387144428
27	NC_017352	CT	3	6	8905	8910	0 %	50 %	0 %	50 %	387144429
28	NC_017352	AT	4	8	9653	9660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017352	AT	3	6	9925	9930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017352	AT	3	6	10246	10251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017352	TA	3	6	11260	11265	50 %	50 %	0 %	0 %	387144430
32	NC_017352	AT	4	8	11845	11852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017352	TA	3	6	11872	11877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017352	TA	3	6	11979	11984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017352	AT	3	6	12274	12279	50 %	50 %	0 %	0 %	387144431
36	NC_017352	AT	3	6	12430	12435	50 %	50 %	0 %	0 %	387144431
37	NC_017352	AT	3	6	12533	12538	50 %	50 %	0 %	0 %	387144431
38	NC_017352	AG	3	6	12868	12873	50 %	0 %	50 %	0 %	387144431
39	NC_017352	AG	3	6	12896	12901	50 %	0 %	50 %	0 %	387144431
40	NC_017352	TA	3	6	13013	13018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017352	TA	3	6	13268	13273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017352	TC	3	6	13589	13594	0 %	50 %	0 %	50 %	387144432
43	NC_017352	AT	3	6	14035	14040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017352	AG	3	6	15400	15405	50 %	0 %	50 %	0 %	387144433
45	NC_017352	TA	3	6	15406	15411	50 %	50 %	0 %	0 %	387144433
46	NC_017352	CT	3	6	15450	15455	0 %	50 %	0 %	50 %	387144433
47	NC_017352	TA	3	6	16012	16017	50 %	50 %	0 %	0 %	387144434
48	NC_017352	AT	3	6	16136	16141	50 %	50 %	0 %	0 %	387144434
49	NC_017352	TC	3	6	16303	16308	0 %	50 %	0 %	50 %	387144434
50	NC_017352	TA	5	10	16339	16348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017352	AG	3	6	16427	16432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017352	CT	3	6	16445	16450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017352	AT	3	6	17085	17090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017352	TA	3	6	17121	17126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017352	GA	3	6	17211	17216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017352	TA	3	6	17417	17422	50 %	50 %	0 %	0 %	387144436
57	NC_017352	TC	3	6	17478	17483	0 %	50 %	0 %	50 %	387144436
58	NC_017352	AT	3	6	17933	17938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017352	AT	3	6	18225	18230	50 %	50 %	0 %	0 %	387144437
60	NC_017352	AT	3	6	18434	18439	50 %	50 %	0 %	0 %	387144437
61	NC_017352	TA	3	6	18531	18536	50 %	50 %	0 %	0 %	387144437
62	NC_017352	AT	3	6	18734	18739	50 %	50 %	0 %	0 %	387144437
63	NC_017352	TA	3	6	19373	19378	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
64	NC_017352	AT	3	6	19732	19737	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
65	NC_017352	GA	3	6	19843	19848	50 %	0 %	50 %	0 %	387144438
66	NC_017352	TA	3	6	20083	20088	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
67	NC_017352	AT	3	6	20915	20920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017352	AG	3	6	20948	20953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017352	TG	3	6	21360	21365	0 %	50 %	50 %	0 %	387144440
70	NC_017352	GT	3	6	22321	22326	0 %	50 %	50 %	0 %	387144441
71	NC_017352	GC	3	6	22505	22510	0 %	0 %	50 %	50 %	387144441
72	NC_017352	GT	3	6	22732	22737	0 %	50 %	50 %	0 %	387144441
73	NC_017352	TA	3	6	24044	24049	50 %	50 %	0 %	0 %	387144442
74	NC_017352	AT	3	6	24551	24556	50 %	50 %	0 %	0 %	387144442
75	NC_017352	CA	3	6	25430	25435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017352	AT	3	6	25860	25865	50 %	50 %	0 %	0 %	387144443
77	NC_017352	GA	3	6	25971	25976	50 %	0 %	50 %	0 %	387144443
78	NC_017352	TA	3	6	26349	26354	50 %	50 %	0 %	0 %	387144444
79	NC_017352	AG	3	6	27770	27775	50 %	0 %	50 %	0 %	387144446
80	NC_017352	AT	3	6	28397	28402	50 %	50 %	0 %	0 %	387144447
81	NC_017352	AT	3	6	29007	29012	50 %	50 %	0 %	0 %	387144447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.