MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97 chromosome

Total Repeats: 1541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017351	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780300
2	NC_017351	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017351	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017351	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385780304
5	NC_017351	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780304
6	NC_017351	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385780304
7	NC_017351	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780304
8	NC_017351	ACAATT	2	12	11252	11263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780306
9	NC_017351	TTAGCA	2	12	11346	11357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780306
10	NC_017351	TAAATC	2	12	17163	17174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017351	GCTTTA	2	12	17441	17452	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385780311
12	NC_017351	TTTGAA	2	12	18262	18273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780311
13	NC_017351	TAAAGG	2	12	20309	20320	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385780313
14	NC_017351	TTGAAG	2	12	20506	20517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780313
15	NC_017351	TGATTG	2	12	21710	21721	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780314
16	NC_017351	AAGGAA	2	12	22480	22491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385780315
17	NC_017351	TGAATT	2	12	25409	25420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780316
18	NC_017351	ATTTCA	2	12	27893	27904	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780318
19	NC_017351	GTTCTG	2	12	29192	29203	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385780319
20	NC_017351	AAAAGA	2	12	33832	33843	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385780322
21	NC_017351	ACATCT	2	12	35486	35497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385780323
22	NC_017351	GTTTAA	2	12	36629	36640	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780325
23	NC_017351	AAAAAT	2	12	38345	38356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017351	AATGAA	2	12	39581	39592	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780328
25	NC_017351	ACAACT	2	12	41646	41657	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385780329
26	NC_017351	GCTAAA	2	12	42885	42896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780331
27	NC_017351	ATATAC	2	12	49176	49187	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017351	TACCTG	2	12	49962	49973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385780340
29	NC_017351	TATAAT	2	12	50535	50546	50 %	50 %	0 %	0 %	385780340
30	NC_017351	AATTGC	2	12	51679	51690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780341
31	NC_017351	TTAAAC	2	12	56553	56564	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780344
32	NC_017351	CAATAA	2	12	57343	57354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385780346
33	NC_017351	TTAAAC	2	12	61037	61048	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780349
34	NC_017351	CTACAT	2	12	62909	62920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385780352
35	NC_017351	TATCAG	2	12	63771	63782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780353
36	NC_017351	TTAAAC	2	12	65425	65436	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780356
37	NC_017351	CTAATT	2	12	70087	70098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017351	AAGATA	2	12	70155	70166	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017351	TTTTAT	2	12	70800	70811	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385780362
40	NC_017351	TTGGAT	2	12	71237	71248	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780362
41	NC_017351	GTATGA	2	12	76843	76854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780367
42	NC_017351	ATAAAG	2	12	80215	80226	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780370
43	NC_017351	TGAAAA	2	12	82284	82295	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780372
44	NC_017351	AAAACA	2	12	82304	82315	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385780372
45	NC_017351	TTTGAT	2	12	88316	88327	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017351	TTAGCT	2	12	88962	88973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017351	TAAAAA	2	12	89126	89137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017351	TAAAAA	2	12	89593	89604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017351	ACCCTT	2	12	90703	90714	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385780377
50	NC_017351	TTTAGC	2	12	92613	92624	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385780379
51	NC_017351	AAATAA	2	12	92664	92675	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385780379
52	NC_017351	GTTAGA	2	12	94787	94798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780380
53	NC_017351	AAAAGA	2	12	94841	94852	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385780380
54	NC_017351	GCTAAA	2	12	97629	97640	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780382
55	NC_017351	AACAAA	2	12	98045	98056	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017351	AACCAC	2	12	106305	106316	50 %	0 %	0 %	50 %	385780390
57	NC_017351	AATATA	2	12	108007	108018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017351	AACCGA	2	12	110229	110240	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385780393
59	NC_017351	TATCAT	2	12	113499	113510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780395
60	NC_017351	TTTATT	2	12	113907	113918	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385780396
61	NC_017351	TATTTG	2	12	113993	114004	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385780396
62	NC_017351	TAAATA	2	12	115426	115437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385780396
63	NC_017351	TTTTTC	2	12	117198	117209	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385780397
64	NC_017351	TAACAA	2	12	118650	118661	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017351	TAAGCC	2	12	119059	119070	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385780399
66	NC_017351	ATCGCA	2	12	120274	120285	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385780400
67	NC_017351	TTTGAA	2	12	121305	121316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780401
68	NC_017351	CAATGG	2	12	130263	130274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385780407
69	NC_017351	TGAAGA	2	12	131097	131108	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385780408
70	NC_017351	TTTCAT	2	12	131778	131789	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385780409
71	NC_017351	TGTATA	2	12	135996	136007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780413
72	NC_017351	TCGAAA	2	12	137497	137508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780415
73	NC_017351	CTATTG	2	12	140083	140094	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385780417
74	NC_017351	CATATG	2	12	141286	141297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780418
75	NC_017351	AATGTA	2	12	142188	142199	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017351	GGTATG	2	12	144331	144342	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385780421
77	NC_017351	CAGATT	2	12	146929	146940	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780423
78	NC_017351	AGATAT	2	12	154309	154320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780430
79	NC_017351	TAAAGC	2	12	155913	155924	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780432
80	NC_017351	TTTTGA	2	12	156099	156110	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385780432
81	NC_017351	GATATG	2	12	164253	164264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780440
82	NC_017351	ATTTGA	2	12	168159	168170	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780443
83	NC_017351	TATAAA	2	12	168690	168701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385780444
84	NC_017351	GATTTT	2	12	172852	172863	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017351	ACAAAG	2	12	177372	177383	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385780452
86	NC_017351	TGTAAT	2	12	178396	178407	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780453
87	NC_017351	AAAGAT	2	12	179385	179396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780455
88	NC_017351	ATTAAT	2	12	181291	181302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017351	CAATAT	2	12	181857	181868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780456
90	NC_017351	TCCCAC	2	12	182664	182675	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017351	TTGGTA	2	12	186001	186012	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780461
92	NC_017351	GCGATT	2	12	186021	186032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385780461
93	NC_017351	AAATTT	2	12	186119	186130	50 %	50 %	0 %	0 %	385780461
94	NC_017351	ACCTGC	2	12	189022	189033	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385780464
95	NC_017351	AAGATA	2	12	189168	189179	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780464
96	NC_017351	CTATTA	2	12	193953	193964	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780466
97	NC_017351	TATGAT	2	12	195487	195498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780466
98	NC_017351	TTGAAA	2	12	195939	195950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780466
99	NC_017351	AACATT	2	12	198379	198390	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780466
100	NC_017351	AGCAAC	2	12	201866	201877	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385780470
101	NC_017351	TGTTTG	2	12	201914	201925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385780470
102	NC_017351	CACCTT	2	12	203918	203929	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385780472
103	NC_017351	ACCTTT	2	12	204423	204434	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385780472
104	NC_017351	TTTATA	2	12	204519	204530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017351	ATTAAT	2	12	204542	204553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017351	GTAAAT	2	12	208159	208170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780475
107	NC_017351	ATTTTA	2	12	209754	209765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385780476
108	NC_017351	TATCTT	2	12	214369	214380	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385780479
109	NC_017351	ATTTGG	2	12	215382	215393	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780480
110	NC_017351	GAGTTT	2	12	218725	218736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780481
111	NC_017351	CCCTGA	2	12	223301	223312	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385780485
112	NC_017351	TCCTGA	2	12	224120	224131	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385780485
113	NC_017351	TCAATT	2	12	226271	226282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780487
114	NC_017351	AATATG	2	12	227571	227582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780488
115	NC_017351	GATTTT	2	12	230727	230738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017351	AAAAAT	2	12	231063	231074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385780490
117	NC_017351	AGGACA	2	12	232923	232934	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385780492
118	NC_017351	ACATTT	2	12	233259	233270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780492
119	NC_017351	TTCTTG	2	12	238188	238199	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385780496
120	NC_017351	GGACGT	2	12	248690	248701	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385780505
121	NC_017351	ATATGA	2	12	251427	251438	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780507
122	NC_017351	CTTCAA	2	12	256511	256522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017351	GGAATA	2	12	266335	266346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017351	TGGTAT	2	12	277915	277926	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780528
125	NC_017351	TATAGA	2	12	281269	281280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780532
126	NC_017351	ATATAG	2	12	288102	288113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017351	ACGATG	2	12	288438	288449	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385780539
128	NC_017351	ATTTTC	2	12	293419	293430	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017351	ATAATT	2	12	294368	294379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017351	AAGTAA	2	12	299419	299430	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780549
131	NC_017351	ATAAAG	2	12	300400	300411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780550
132	NC_017351	AACGAT	2	12	301713	301724	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017351	GACATT	2	12	302066	302077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780551
134	NC_017351	TTCATA	2	12	304455	304466	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780554
135	NC_017351	GATTAT	2	12	309408	309419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780560
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137	NC_017351	CAGCAA	2	12	309928	309939	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385780560
138	NC_017351	TAACTT	2	12	310634	310645	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017351	TCTTCA	2	12	315507	315518	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385780565
140	NC_017351	TTATCT	2	12	315603	315614	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385780565
141	NC_017351	GAAAAA	2	12	317865	317876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385780568
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143	NC_017351	TAATTA	2	12	321357	321368	50 %	50 %	0 %	0 %	385780570
144	NC_017351	ACAAGA	2	12	322197	322208	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385780571
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150	NC_017351	TAAAAC	2	12	335237	335248	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385780584
151	NC_017351	CTGAAT	2	12	340082	340093	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780590
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159	NC_017351	AATGAC	2	12	362939	362950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780609
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167	NC_017351	GATGCT	2	12	383215	383226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385780629
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188	NC_017351	TGCAGG	2	12	430117	430128	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385780680
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190	NC_017351	ATTGTT	2	12	430971	430982	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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223	NC_017351	AAAATA	2	12	494938	494949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
224	NC_017351	GTTGGT	2	12	496292	496303	0 %	50 %	50 %	0 %	385780739
225	NC_017351	GCTATT	2	12	496364	496375	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385780739
226	NC_017351	GATCAT	2	12	497960	497971	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780740
227	NC_017351	AATTTA	2	12	498867	498878	50 %	50 %	0 %	0 %	385780741
228	NC_017351	CAAGAA	2	12	501996	502007	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385780744
229	NC_017351	TATGGT	2	12	503080	503091	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
230	NC_017351	AAAATG	2	12	511556	511567	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780748
231	NC_017351	CAAGAT	2	12	511583	511594	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780748
232	NC_017351	AGTTGA	2	12	511822	511833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780748
233	NC_017351	TAAAAA	2	12	512770	512781	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385780749
234	NC_017351	TTATAA	2	12	514217	514228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_017351	TTTATA	2	12	515134	515145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385780752
236	NC_017351	AACCTA	2	12	518102	518113	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385780755
237	NC_017351	ATTGGT	2	12	518827	518838	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780756
238	NC_017351	AAATTT	2	12	520978	520989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_017351	GCAAGA	2	12	525732	525743	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385780764
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346	NC_017351	TAGATG	2	12	629263	629274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
347	NC_017351	CATGAC	2	12	631213	631224	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385780847
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