MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97 chromosome

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017351	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017351	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017351	TAAATC	2	12	17163	17174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017351	AAAAAT	2	12	38345	38356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017351	ATATAC	2	12	49176	49187	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017351	CTAATT	2	12	70087	70098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017351	AAGATA	2	12	70155	70166	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017351	TTTGAT	2	12	88316	88327	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017351	TTAGCT	2	12	88962	88973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017351	TAAAAA	2	12	89126	89137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017351	TAAAAA	2	12	89593	89604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017351	AACAAA	2	12	98045	98056	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017351	AATATA	2	12	108007	108018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017351	TAACAA	2	12	118650	118661	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017351	AATGTA	2	12	142188	142199	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017351	GATTTT	2	12	172852	172863	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017351	ATTAAT	2	12	181291	181302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017351	TCCCAC	2	12	182664	182675	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017351	TTTATA	2	12	204519	204530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017351	ATTAAT	2	12	204542	204553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017351	GATTTT	2	12	230727	230738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017351	CTTCAA	2	12	256511	256522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017351	GGAATA	2	12	266335	266346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017351	ATATAG	2	12	288102	288113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017351	ATTTTC	2	12	293419	293430	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017351	ATAATT	2	12	294368	294379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017351	AACGAT	2	12	301713	301724	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017351	TAACTT	2	12	310634	310645	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017351	ATATGA	2	12	361351	361362	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017351	TTCATT	2	12	365806	365817	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017351	TTGTAA	2	12	371108	371119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017351	TAATAT	2	12	379523	379534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017351	AATGTA	2	12	409057	409068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017351	AATTTG	2	12	409164	409175	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017351	TAAAGA	2	12	411139	411150	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017351	ATTAAT	2	12	426264	426275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017351	ATTAAT	2	12	430816	430827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017351	ATTGTT	2	12	430971	430982	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017351	TGAAAT	2	12	440963	440974	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017351	TGTATA	2	12	455209	455220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017351	TTTTTA	2	12	468283	468294	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017351	AAAATG	2	12	473716	473727	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017351	ACGTTG	2	12	494215	494226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017351	AAAATA	2	12	494938	494949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017351	TATGGT	2	12	503080	503091	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017351	TTATAA	2	12	514217	514228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017351	AAATTT	2	12	520978	520989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017351	TTATAA	2	12	576823	576834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017351	GTTATA	2	12	577494	577505	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017351	CTTAAA	2	12	585926	585937	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017351	ACATGT	2	12	595895	595906	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017351	ATTGCG	2	12	625272	625283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017351	AATGAT	2	12	629190	629201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017351	TAGATG	2	12	629263	629274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017351	TAAAAG	2	12	664231	664242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017351	GTAAAT	2	12	680337	680348	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017351	TAAAAT	2	12	687834	687845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017351	TTATTT	2	12	694568	694579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017351	CATTAT	2	12	710771	710782	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017351	CATCAA	2	12	721435	721446	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017351	TAATTT	2	12	725675	725686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017351	ATAAAA	2	12	726582	726593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017351	TGAATA	2	12	742186	742197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017351	TTAAAA	2	12	768333	768344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017351	TAGTTA	2	12	772768	772779	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017351	TTTTTA	2	12	791043	791054	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017351	TGAAAA	2	12	799285	799296	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017351	AATGAT	2	12	827597	827608	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017351	ACAAAA	2	12	867601	867612	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017351	TAAAAA	2	12	886813	886824	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017351	TATCAA	2	12	893442	893453	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017351	TTTTGA	2	12	897214	897225	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017351	TCATTT	2	12	903207	903218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017351	AAATTA	2	12	912993	913004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017351	TAACTA	2	12	919449	919460	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017351	AAGCAC	2	12	921729	921740	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017351	TAAAAT	2	12	929479	929490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017351	TTTAAT	2	12	1002637	1002648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017351	AACGGA	2	12	1034558	1034569	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017351	AAAAGC	2	12	1039157	1039168	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017351	CTAAAT	2	12	1055330	1055341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017351	CATTTA	2	12	1064489	1064500	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017351	ATCATA	2	12	1066393	1066404	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017351	TCAAAA	2	12	1072901	1072912	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017351	ATTGCA	2	12	1074213	1074224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017351	TTTTCT	2	12	1086941	1086952	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017351	TTTATA	2	12	1122959	1122970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017351	GAATTA	2	12	1129532	1129543	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017351	ATTTTT	2	12	1146915	1146926	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017351	ATAATT	2	12	1147712	1147723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017351	TCATTA	2	12	1152729	1152740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017351	TAATGA	2	12	1160820	1160831	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017351	ATTTAT	2	12	1179995	1180006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017351	AAATTT	2	12	1184715	1184726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017351	AAGTAA	2	12	1206411	1206422	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017351	TCGTTT	2	12	1209555	1209566	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017351	TTAATT	2	12	1220271	1220282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017351	AATTAA	2	12	1223007	1223018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017351	AGCTAA	2	12	1247674	1247685	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017351	GAAATT	2	12	1268317	1268328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017351	AATGAT	2	12	1281092	1281103	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017351	TAAAGA	2	12	1295569	1295580	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017351	TTTCAT	2	12	1311376	1311387	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017351	TATATT	2	12	1316035	1316046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017351	CATATT	2	12	1341104	1341115	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017351	ATGTAT	2	12	1341725	1341736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017351	AAAGAA	2	12	1341957	1341968	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017351	TTAAAG	2	12	1345540	1345551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017351	TTAAAG	2	12	1347471	1347482	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017351	AGATAA	2	12	1348231	1348242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017351	ATTAAA	2	12	1372292	1372303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017351	ATATAA	2	12	1380212	1380223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017351	AAAATA	2	12	1394280	1394291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017351	GTTTTA	2	12	1410026	1410037	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017351	TAAAAT	2	12	1426185	1426196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017351	TATCTT	2	12	1448082	1448093	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017351	TTGATT	2	12	1448145	1448156	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017351	ATTCTA	2	12	1455486	1455497	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017351	AATAAA	2	12	1458338	1458349	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017351	TTTTAA	2	12	1503183	1503194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017351	TATTCT	2	12	1506991	1507002	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017351	TACTTG	2	12	1517239	1517250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017351	AAAAAT	2	12	1517255	1517266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017351	TTAATC	2	12	1530761	1530772	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017351	TATGAT	2	12	1616009	1616020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017351	AATAAA	2	12	1621124	1621135	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017351	ATAAAA	2	12	1624911	1624922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017351	ACAAGA	2	12	1630488	1630499	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017351	TAAAAA	2	12	1643389	1643400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_017351	AATTTA	2	12	1660556	1660567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017351	TTGACT	2	12	1688480	1688491	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.