MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97 chromosome

Total Repeats: 1315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017351	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780300
2	NC_017351	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385780304
3	NC_017351	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780304
4	NC_017351	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385780304
5	NC_017351	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780304
6	NC_017351	ACAATT	2	12	11252	11263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780306
7	NC_017351	TTAGCA	2	12	11346	11357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780306
8	NC_017351	GCTTTA	2	12	17441	17452	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385780311
9	NC_017351	TTTGAA	2	12	18262	18273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780311
10	NC_017351	TAAAGG	2	12	20309	20320	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385780313
11	NC_017351	TTGAAG	2	12	20506	20517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780313
12	NC_017351	TGATTG	2	12	21710	21721	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780314
13	NC_017351	AAGGAA	2	12	22480	22491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385780315
14	NC_017351	TGAATT	2	12	25409	25420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780316
15	NC_017351	ATTTCA	2	12	27893	27904	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780318
16	NC_017351	GTTCTG	2	12	29192	29203	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385780319
17	NC_017351	AAAAGA	2	12	33832	33843	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385780322
18	NC_017351	ACATCT	2	12	35486	35497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385780323
19	NC_017351	GTTTAA	2	12	36629	36640	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780325
20	NC_017351	AATGAA	2	12	39581	39592	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780328
21	NC_017351	ACAACT	2	12	41646	41657	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385780329
22	NC_017351	GCTAAA	2	12	42885	42896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780331
23	NC_017351	TACCTG	2	12	49962	49973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385780340
24	NC_017351	TATAAT	2	12	50535	50546	50 %	50 %	0 %	0 %	385780340
25	NC_017351	AATTGC	2	12	51679	51690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780341
26	NC_017351	TTAAAC	2	12	56553	56564	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780344
27	NC_017351	CAATAA	2	12	57343	57354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385780346
28	NC_017351	TTAAAC	2	12	61037	61048	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780349
29	NC_017351	CTACAT	2	12	62909	62920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385780352
30	NC_017351	TATCAG	2	12	63771	63782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780353
31	NC_017351	TTAAAC	2	12	65425	65436	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780356
32	NC_017351	TTTTAT	2	12	70800	70811	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385780362
33	NC_017351	TTGGAT	2	12	71237	71248	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780362
34	NC_017351	GTATGA	2	12	76843	76854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780367
35	NC_017351	ATAAAG	2	12	80215	80226	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780370
36	NC_017351	TGAAAA	2	12	82284	82295	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780372
37	NC_017351	AAAACA	2	12	82304	82315	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385780372
38	NC_017351	ACCCTT	2	12	90703	90714	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385780377
39	NC_017351	TTTAGC	2	12	92613	92624	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385780379
40	NC_017351	AAATAA	2	12	92664	92675	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385780379
41	NC_017351	GTTAGA	2	12	94787	94798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780380
42	NC_017351	AAAAGA	2	12	94841	94852	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385780380
43	NC_017351	GCTAAA	2	12	97629	97640	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780382
44	NC_017351	AACCAC	2	12	106305	106316	50 %	0 %	0 %	50 %	385780390
45	NC_017351	AACCGA	2	12	110229	110240	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385780393
46	NC_017351	TATCAT	2	12	113499	113510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780395
47	NC_017351	TTTATT	2	12	113907	113918	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385780396
48	NC_017351	TATTTG	2	12	113993	114004	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385780396
49	NC_017351	TAAATA	2	12	115426	115437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385780396
50	NC_017351	TTTTTC	2	12	117198	117209	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385780397
51	NC_017351	TAAGCC	2	12	119059	119070	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385780399
52	NC_017351	ATCGCA	2	12	120274	120285	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385780400
53	NC_017351	TTTGAA	2	12	121305	121316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780401
54	NC_017351	CAATGG	2	12	130263	130274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385780407
55	NC_017351	TGAAGA	2	12	131097	131108	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385780408
56	NC_017351	TTTCAT	2	12	131778	131789	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385780409
57	NC_017351	TGTATA	2	12	135996	136007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780413
58	NC_017351	TCGAAA	2	12	137497	137508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780415
59	NC_017351	CTATTG	2	12	140083	140094	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385780417
60	NC_017351	CATATG	2	12	141286	141297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780418
61	NC_017351	GGTATG	2	12	144331	144342	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385780421
62	NC_017351	CAGATT	2	12	146929	146940	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780423
63	NC_017351	AGATAT	2	12	154309	154320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780430
64	NC_017351	TAAAGC	2	12	155913	155924	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780432
65	NC_017351	TTTTGA	2	12	156099	156110	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385780432
66	NC_017351	GATATG	2	12	164253	164264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780440
67	NC_017351	ATTTGA	2	12	168159	168170	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780443
68	NC_017351	TATAAA	2	12	168690	168701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385780444
69	NC_017351	ACAAAG	2	12	177372	177383	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385780452
70	NC_017351	TGTAAT	2	12	178396	178407	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780453
71	NC_017351	AAAGAT	2	12	179385	179396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780455
72	NC_017351	CAATAT	2	12	181857	181868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780456
73	NC_017351	TTGGTA	2	12	186001	186012	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780461
74	NC_017351	GCGATT	2	12	186021	186032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385780461
75	NC_017351	AAATTT	2	12	186119	186130	50 %	50 %	0 %	0 %	385780461
76	NC_017351	ACCTGC	2	12	189022	189033	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385780464
77	NC_017351	AAGATA	2	12	189168	189179	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780464
78	NC_017351	CTATTA	2	12	193953	193964	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780466
79	NC_017351	TATGAT	2	12	195487	195498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780466
80	NC_017351	TTGAAA	2	12	195939	195950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780466
81	NC_017351	AACATT	2	12	198379	198390	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385780466
82	NC_017351	AGCAAC	2	12	201866	201877	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385780470
83	NC_017351	TGTTTG	2	12	201914	201925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385780470
84	NC_017351	CACCTT	2	12	203918	203929	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385780472
85	NC_017351	ACCTTT	2	12	204423	204434	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385780472
86	NC_017351	GTAAAT	2	12	208159	208170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780475
87	NC_017351	ATTTTA	2	12	209754	209765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385780476
88	NC_017351	TATCTT	2	12	214369	214380	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385780479
89	NC_017351	ATTTGG	2	12	215382	215393	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780480
90	NC_017351	GAGTTT	2	12	218725	218736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780481
91	NC_017351	CCCTGA	2	12	223301	223312	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385780485
92	NC_017351	TCCTGA	2	12	224120	224131	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385780485
93	NC_017351	TCAATT	2	12	226271	226282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780487
94	NC_017351	AATATG	2	12	227571	227582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780488
95	NC_017351	AAAAAT	2	12	231063	231074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385780490
96	NC_017351	AGGACA	2	12	232923	232934	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385780492
97	NC_017351	ACATTT	2	12	233259	233270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780492
98	NC_017351	TTCTTG	2	12	238188	238199	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385780496
99	NC_017351	GGACGT	2	12	248690	248701	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385780505
100	NC_017351	ATATGA	2	12	251427	251438	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780507
101	NC_017351	TGGTAT	2	12	277915	277926	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385780528
102	NC_017351	TATAGA	2	12	281269	281280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385780532
103	NC_017351	ACGATG	2	12	288438	288449	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385780539
104	NC_017351	AAGTAA	2	12	299419	299430	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780549
105	NC_017351	ATAAAG	2	12	300400	300411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385780550
106	NC_017351	GACATT	2	12	302066	302077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385780551
107	NC_017351	TTCATA	2	12	304455	304466	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385780554
108	NC_017351	GATTAT	2	12	309408	309419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780560
109	NC_017351	ATGGTG	2	12	309541	309552	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385780560
110	NC_017351	CAGCAA	2	12	309928	309939	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385780560
111	NC_017351	TCTTCA	2	12	315507	315518	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385780565
112	NC_017351	TTATCT	2	12	315603	315614	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385780565
113	NC_017351	GAAAAA	2	12	317865	317876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385780568
114	NC_017351	GATACA	2	12	319030	319041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385780568
115	NC_017351	TAATTA	2	12	321357	321368	50 %	50 %	0 %	0 %	385780570
116	NC_017351	ACAAGA	2	12	322197	322208	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385780571
117	NC_017351	AGGACA	2	12	322575	322586	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385780571
118	NC_017351	AAAGCA	2	12	322798	322809	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385780571
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227	NC_017351	TTGCTA	2	12	590653	590664	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385780815
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229	NC_017351	TTATGA	2	12	597415	597426	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385780820
230	NC_017351	TTTCTT	2	12	600609	600620	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385780823
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232	NC_017351	ACTGCA	2	12	603543	603554	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385780827
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