MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97 chromosome

Total Repeats: 2506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017351	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	385780299
2	NC_017351	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	385780300
3	NC_017351	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	385780300
4	NC_017351	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	385780300
5	NC_017351	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	385780303
6	NC_017351	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017351	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	385780304
8	NC_017351	GGTGT	2	10	10123	10132	0 %	40 %	60 %	0 %	385780305
9	NC_017351	ATCGC	2	10	10185	10194	20 %	20 %	20 %	40 %	385780305
10	NC_017351	CGTTG	2	10	11728	11737	0 %	40 %	40 %	20 %	385780306
11	NC_017351	AGGAA	2	10	14341	14350	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017351	GTAGG	2	10	14401	14410	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017351	TTATT	2	10	15441	15450	20 %	80 %	0 %	0 %	385780309
14	NC_017351	GCAAG	2	10	16613	16622	40 %	0 %	40 %	20 %	385780310
15	NC_017351	TTTGA	2	10	16772	16781	20 %	60 %	20 %	0 %	385780310
16	NC_017351	AGTTA	2	10	22089	22098	40 %	40 %	20 %	0 %	385780314
17	NC_017351	ATGTA	2	10	23648	23657	40 %	40 %	20 %	0 %	385780315
18	NC_017351	TCGAT	2	10	23812	23821	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017351	ATATT	2	10	24350	24359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017351	ACCAA	2	10	26259	26268	60 %	0 %	0 %	40 %	385780317
21	NC_017351	ATCAA	2	10	26971	26980	60 %	20 %	0 %	20 %	385780317
22	NC_017351	GAAAC	2	10	27592	27601	60 %	0 %	20 %	20 %	385780318
23	NC_017351	GAAGT	2	10	27742	27751	40 %	20 %	40 %	0 %	385780318
24	NC_017351	ATTAT	2	10	29385	29394	40 %	60 %	0 %	0 %	385780319
25	NC_017351	AACGA	2	10	29458	29467	60 %	0 %	20 %	20 %	385780319
26	NC_017351	GAAAC	2	10	31286	31295	60 %	0 %	20 %	20 %	385780321
27	NC_017351	AAGGT	2	10	32459	32468	40 %	20 %	40 %	0 %	385780321
28	NC_017351	TATGA	2	10	32656	32665	40 %	40 %	20 %	0 %	385780321
29	NC_017351	CATTA	2	10	33886	33895	40 %	40 %	0 %	20 %	385780322
30	NC_017351	TTTCA	2	10	34289	34298	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017351	AAATG	2	10	35530	35539	60 %	20 %	20 %	0 %	385780323
32	NC_017351	ATTTT	2	10	35611	35620	20 %	80 %	0 %	0 %	385780323
33	NC_017351	TAAAA	2	10	35742	35751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017351	AGATA	2	10	35900	35909	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017351	ATGAG	2	10	38219	38228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017351	TGAAT	2	10	38566	38575	40 %	40 %	20 %	0 %	385780327
37	NC_017351	TTGGT	2	10	38608	38617	0 %	60 %	40 %	0 %	385780327
38	NC_017351	AATAT	2	10	38676	38685	60 %	40 %	0 %	0 %	385780327
39	NC_017351	TTCGT	2	10	38887	38896	0 %	60 %	20 %	20 %	385780327
40	NC_017351	CAAAA	2	10	39247	39256	80 %	0 %	0 %	20 %	385780328
41	NC_017351	AAATT	2	10	41346	41355	60 %	40 %	0 %	0 %	385780329
42	NC_017351	TTGAA	2	10	43375	43384	40 %	40 %	20 %	0 %	385780332
43	NC_017351	TTGAA	2	10	43721	43730	40 %	40 %	20 %	0 %	385780332
44	NC_017351	TTTGT	2	10	44625	44634	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017351	TTACT	2	10	46263	46272	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017351	CGTCT	2	10	46577	46586	0 %	40 %	20 %	40 %	385780336
47	NC_017351	TGTTT	2	10	47264	47273	0 %	80 %	20 %	0 %	385780337
48	NC_017351	GTTTT	2	10	48354	48363	0 %	80 %	20 %	0 %	385780337
49	NC_017351	AAATT	2	10	48798	48807	60 %	40 %	0 %	0 %	385780338
50	NC_017351	ATATT	2	10	49748	49757	40 %	60 %	0 %	0 %	385780339
51	NC_017351	TAATT	2	10	50165	50174	40 %	60 %	0 %	0 %	385780340
52	NC_017351	TTGAG	2	10	50177	50186	20 %	40 %	40 %	0 %	385780340
53	NC_017351	TATGA	2	10	50338	50347	40 %	40 %	20 %	0 %	385780340
54	NC_017351	GTATC	2	10	51105	51114	20 %	40 %	20 %	20 %	385780340
55	NC_017351	TATTT	2	10	51115	51124	20 %	80 %	0 %	0 %	385780340
56	NC_017351	TTATG	2	10	51309	51318	20 %	60 %	20 %	0 %	385780340
57	NC_017351	AATTA	2	10	52134	52143	60 %	40 %	0 %	0 %	385780341
58	NC_017351	CAGTC	2	10	53412	53421	20 %	20 %	20 %	40 %	385780342
59	NC_017351	ATTTT	2	10	54766	54775	20 %	80 %	0 %	0 %	385780343
60	NC_017351	TTTTG	2	10	54886	54895	0 %	80 %	20 %	0 %	385780343
61	NC_017351	GTTTT	2	10	55466	55475	0 %	80 %	20 %	0 %	385780343
62	NC_017351	TATAA	2	10	56074	56083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017351	TTTTA	2	10	57007	57016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017351	TTAGA	2	10	59448	59457	40 %	40 %	20 %	0 %	385780348
65	NC_017351	ATGTG	2	10	59491	59500	20 %	40 %	40 %	0 %	385780348
66	NC_017351	TATAA	2	10	60558	60567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017351	GTATT	2	10	62195	62204	20 %	60 %	20 %	0 %	385780351
68	NC_017351	ATCAA	2	10	62366	62375	60 %	20 %	0 %	20 %	385780352
69	NC_017351	ATTAT	2	10	64692	64701	40 %	60 %	0 %	0 %	385780354
70	NC_017351	TATAA	2	10	64946	64955	60 %	40 %	0 %	0 %	385780355
71	NC_017351	GATAA	2	10	66637	66646	60 %	20 %	20 %	0 %	385780358
72	NC_017351	AAAAT	2	10	67806	67815	80 %	20 %	0 %	0 %	385780359
73	NC_017351	AAATC	2	10	68430	68439	60 %	20 %	0 %	20 %	385780360
74	NC_017351	TCAAT	2	10	68582	68591	40 %	40 %	0 %	20 %	385780360
75	NC_017351	AATTT	2	10	72109	72118	40 %	60 %	0 %	0 %	385780363
76	NC_017351	AAATT	2	10	72751	72760	60 %	40 %	0 %	0 %	385780364
77	NC_017351	TAGTT	2	10	72817	72826	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017351	TTTGA	2	10	74647	74656	20 %	60 %	20 %	0 %	385780365
79	NC_017351	GTTTT	2	10	74730	74739	0 %	80 %	20 %	0 %	385780365
80	NC_017351	GTTTG	2	10	75360	75369	0 %	60 %	40 %	0 %	385780366
81	NC_017351	TTGCT	2	10	75688	75697	0 %	60 %	20 %	20 %	385780366
82	NC_017351	ATTAT	2	10	79826	79835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017351	TTATA	2	10	79996	80005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017351	AATCA	2	10	80817	80826	60 %	20 %	0 %	20 %	385780370
85	NC_017351	ATGCA	2	10	83758	83767	40 %	20 %	20 %	20 %	385780373
86	NC_017351	CTAGA	2	10	84340	84349	40 %	20 %	20 %	20 %	385780373
87	NC_017351	GAAAT	2	10	84465	84474	60 %	20 %	20 %	0 %	385780374
88	NC_017351	AGATA	2	10	85580	85589	60 %	20 %	20 %	0 %	385780374
89	NC_017351	AAATT	2	10	86194	86203	60 %	40 %	0 %	0 %	385780374
90	NC_017351	TAATA	2	10	87135	87144	60 %	40 %	0 %	0 %	385780375
91	NC_017351	AACTC	2	10	88655	88664	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017351	TGAGT	2	10	88949	88958	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017351	TTACA	2	10	89326	89335	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017351	TATAT	2	10	92327	92336	40 %	60 %	0 %	0 %	385780379
95	NC_017351	CTAAA	2	10	93967	93976	60 %	20 %	0 %	20 %	385780380
96	NC_017351	CAAAA	2	10	93998	94007	80 %	0 %	0 %	20 %	385780380
97	NC_017351	GATAT	2	10	98685	98694	40 %	40 %	20 %	0 %	385780383
98	NC_017351	ATATA	2	10	99508	99517	60 %	40 %	0 %	0 %	385780384
99	NC_017351	GATAT	2	10	100500	100509	40 %	40 %	20 %	0 %	385780385
100	NC_017351	ATTGC	2	10	103613	103622	20 %	40 %	20 %	20 %	385780389
101	NC_017351	CATGG	2	10	105017	105026	20 %	20 %	40 %	20 %	385780389
102	NC_017351	TGAAA	2	10	105685	105694	60 %	20 %	20 %	0 %	385780390
103	NC_017351	TCAAT	2	10	106057	106066	40 %	40 %	0 %	20 %	385780390
104	NC_017351	GTATT	2	10	106546	106555	20 %	60 %	20 %	0 %	385780391
105	NC_017351	GTAAT	2	10	113035	113044	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017351	CAATT	2	10	113467	113476	40 %	40 %	0 %	20 %	385780395
107	NC_017351	TTGCG	2	10	114872	114881	0 %	40 %	40 %	20 %	385780396
108	NC_017351	AGTTA	2	10	116336	116345	40 %	40 %	20 %	0 %	385780397
109	NC_017351	TTGCG	2	10	116844	116853	0 %	40 %	40 %	20 %	385780397
110	NC_017351	AAGTT	2	10	117302	117311	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017351	AGATG	2	10	119709	119718	40 %	20 %	40 %	0 %	385780399
112	NC_017351	GGTGA	2	10	120305	120314	20 %	20 %	60 %	0 %	385780400
113	NC_017351	GAAAA	2	10	123742	123751	80 %	0 %	20 %	0 %	385780403
114	NC_017351	TCCAT	2	10	124430	124439	20 %	40 %	0 %	40 %	385780404
115	NC_017351	AATCA	2	10	126931	126940	60 %	20 %	0 %	20 %	385780405
116	NC_017351	ATTTT	2	10	127629	127638	20 %	80 %	0 %	0 %	385780406
117	NC_017351	ATCAA	2	10	127656	127665	60 %	20 %	0 %	20 %	385780406
118	NC_017351	ATCAC	2	10	128889	128898	40 %	20 %	0 %	40 %	385780407
119	NC_017351	AACGA	2	10	129566	129575	60 %	0 %	20 %	20 %	385780407
120	NC_017351	ACACA	2	10	131622	131631	60 %	0 %	0 %	40 %	385780409
121	NC_017351	GACAA	2	10	132773	132782	60 %	0 %	20 %	20 %	385780410
122	NC_017351	ATTAC	2	10	134956	134965	40 %	40 %	0 %	20 %	385780412
123	NC_017351	ATTTT	2	10	135259	135268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017351	TATCT	2	10	135615	135624	20 %	60 %	0 %	20 %	385780413
125	NC_017351	ATACG	2	10	138048	138057	40 %	20 %	20 %	20 %	385780415
126	NC_017351	TTATA	2	10	138706	138715	40 %	60 %	0 %	0 %	385780416
127	NC_017351	TTTTA	2	10	139504	139513	20 %	80 %	0 %	0 %	385780416
128	NC_017351	GTATT	2	10	140017	140026	20 %	60 %	20 %	0 %	385780417
129	NC_017351	AATAA	2	10	140610	140619	80 %	20 %	0 %	0 %	385780417
130	NC_017351	TACGC	2	10	140877	140886	20 %	20 %	20 %	40 %	385780417
131	NC_017351	GCTTT	2	10	145919	145928	0 %	60 %	20 %	20 %	385780422
132	NC_017351	TAATT	2	10	146004	146013	40 %	60 %	0 %	0 %	385780422
133	NC_017351	ATACT	2	10	147185	147194	40 %	40 %	0 %	20 %	385780424
134	NC_017351	TAATA	2	10	148351	148360	60 %	40 %	0 %	0 %	385780425
135	NC_017351	ATTTT	2	10	149342	149351	20 %	80 %	0 %	0 %	385780426
136	NC_017351	TTGTA	2	10	151547	151556	20 %	60 %	20 %	0 %	385780428
137	NC_017351	TGCAA	2	10	152552	152561	40 %	20 %	20 %	20 %	385780429
138	NC_017351	ATATG	2	10	154570	154579	40 %	40 %	20 %	0 %	385780430
139	NC_017351	AATAT	2	10	155432	155441	60 %	40 %	0 %	0 %	385780431
140	NC_017351	ATTTT	2	10	156926	156935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017351	GATTT	2	10	156980	156989	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_017351	TAAAG	2	10	181163	181172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_017351	TGATT	2	10	216368	216377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017351	TTGAA	2	10	216950	216959	40 %	40 %	20 %	0 %	385780481
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239	NC_017351	AAGCG	2	10	271162	271171	40 %	0 %	40 %	20 %	385780521
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241	NC_017351	AAATT	2	10	272243	272252	60 %	40 %	0 %	0 %	385780523
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259	NC_017351	ATAAA	2	10	294357	294366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_017351	TCATA	2	10	302794	302803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_017351	TGGCA	2	10	304784	304793	20 %	20 %	40 %	20 %	385780554
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266	NC_017351	TAGTT	2	10	307844	307853	20 %	60 %	20 %	0 %	385780559
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