MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97 plasmid p11819-97

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017350	ATA	2	6	94	99	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017350	AAT	2	6	109	114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017350	ATA	2	6	120	125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017350	ACA	2	6	212	217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017350	ATT	2	6	1033	1038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017350	TGA	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017350	TAA	2	6	1296	1301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017350	ATA	2	6	2014	2019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017350	TGA	2	6	2085	2090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017350	AAT	2	6	2128	2133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017350	TAA	2	6	2197	2202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017350	TTG	2	6	2224	2229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017350	AGA	2	6	3294	3299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017350	TAA	2	6	4256	4261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017350	TAT	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017350	AAT	2	6	4300	4305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017350	AAG	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017350	ATA	2	6	6470	6475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017350	TTA	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017350	TAA	2	6	6517	6522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017350	TTA	2	6	6536	6541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017350	GTT	2	6	7353	7358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017350	GAT	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017350	AAT	2	6	8082	8087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017350	ATG	2	6	8234	8239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017350	GAT	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017350	GAA	2	6	8337	8342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017350	AGA	2	6	11589	11594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017350	TGA	2	6	11905	11910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017350	TCA	2	6	11917	11922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017350	TAA	2	6	11945	11950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017350	TAA	2	6	11991	11996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017350	GCT	2	6	12013	12018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017350	TTG	2	6	12057	12062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017350	ATT	3	9	12069	12077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017350	ATT	2	6	12138	12143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017350	ATT	2	6	12304	12309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017350	TTC	2	6	12318	12323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017350	TTA	2	6	13520	13525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017350	ATG	2	6	13570	13575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017350	ACA	2	6	14586	14591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017350	ACT	2	6	14919	14924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017350	TCT	2	6	14941	14946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017350	AAT	2	6	15048	15053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017350	TAA	2	6	15081	15086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017350	TCA	2	6	15136	15141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017350	ACC	2	6	16006	16011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017350	TCA	2	6	16026	16031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017350	TAC	2	6	16046	16051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017350	TAC	2	6	16057	16062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017350	TAA	2	6	16256	16261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017350	TAT	2	6	16303	16308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017350	ATC	2	6	16318	16323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017350	TTA	2	6	16365	16370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017350	GGT	2	6	17393	17398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017350	ACC	2	6	17409	17414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017350	GAG	2	6	17436	17441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017350	TTA	2	6	17679	17684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017350	GTT	2	6	17744	17749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017350	CAT	2	6	17920	17925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017350	ATT	2	6	18043	18048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017350	ACC	2	6	18210	18215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017350	TGG	2	6	18218	18223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017350	TCA	2	6	18273	18278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017350	AAT	2	6	18609	18614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017350	ATT	2	6	18621	18626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017350	TTA	2	6	18690	18695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017350	TTA	2	6	18730	18735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017350	TAA	2	6	18764	18769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017350	ATT	2	6	18820	18825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017350	TAT	2	6	18861	18866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017350	ATC	2	6	19027	19032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017350	GAA	3	9	19050	19058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017350	ATT	2	6	19096	19101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017350	TGT	2	6	19108	19113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017350	TAA	2	6	19852	19857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017350	GAA	2	6	20008	20013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017350	ATT	2	6	20722	20727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017350	TCT	2	6	20770	20775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017350	TAA	2	6	20859	20864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017350	CAT	2	6	20938	20943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017350	TCA	2	6	20952	20957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017350	TAT	2	6	20975	20980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017350	CAA	2	6	21001	21006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017350	AGT	2	6	21061	21066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017350	GGA	2	6	21156	21161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017350	CAT	2	6	21542	21547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017350	TAA	2	6	21621	21626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017350	CAA	2	6	21641	21646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017350	CCT	2	6	21704	21709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017350	ATT	2	6	22103	22108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017350	TTA	2	6	22127	22132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017350	TAA	2	6	22142	22147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017350	GGA	2	6	22161	22166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017350	ATT	2	6	22167	22172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017350	TCT	2	6	22232	22237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017350	CTA	2	6	22294	22299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.