MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97 plasmid p11819-97

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017350	TAG	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782933
2	NC_017350	TAA	4	12	467	478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782933
3	NC_017350	TAA	2	6	518	523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782933
4	NC_017350	ATA	2	6	544	549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782933
5	NC_017350	ATT	2	6	550	555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782933
6	NC_017350	AGT	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782933
7	NC_017350	TAA	2	6	579	584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782933
8	NC_017350	CAT	2	6	618	623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782933
9	NC_017350	TTA	2	6	737	742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782933
10	NC_017350	AGT	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782933
11	NC_017350	ATG	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782933
12	NC_017350	GAA	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782934
13	NC_017350	TAA	2	6	1563	1568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782934
14	NC_017350	GTA	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782934
15	NC_017350	GAA	2	6	1663	1668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782934
16	NC_017350	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782934
17	NC_017350	ATT	2	6	1836	1841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782934
18	NC_017350	TAA	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782934
19	NC_017350	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782935
20	NC_017350	GTA	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782935
21	NC_017350	ATG	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782935
22	NC_017350	GAT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782935
23	NC_017350	GAA	3	9	2430	2438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782935
24	NC_017350	GGA	2	6	2517	2522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385782935
25	NC_017350	TGT	2	6	2528	2533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385782935
26	NC_017350	ACA	2	6	2550	2555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385782935
27	NC_017350	ATG	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782936
28	NC_017350	ATT	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782936
29	NC_017350	TGC	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385782936
30	NC_017350	TCA	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782936
31	NC_017350	TAA	2	6	3080	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782936
32	NC_017350	TTC	2	6	3101	3106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385782936
33	NC_017350	ATG	2	6	3160	3165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782936
34	NC_017350	TAG	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782936
35	NC_017350	CAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782937
36	NC_017350	TAT	2	6	3601	3606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782937
37	NC_017350	AGC	2	6	3689	3694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385782937
38	NC_017350	GTT	2	6	3793	3798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385782937
39	NC_017350	TAT	2	6	3847	3852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782937
40	NC_017350	ATC	2	6	3941	3946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782937
41	NC_017350	TTA	2	6	3975	3980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782937
42	NC_017350	TAA	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
43	NC_017350	GTA	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782938
44	NC_017350	TAA	2	6	4502	4507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
45	NC_017350	AAT	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
46	NC_017350	ACC	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385782938
47	NC_017350	ATA	2	6	4630	4635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
48	NC_017350	TTA	2	6	4663	4668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782938
49	NC_017350	TTA	2	6	4695	4700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782938
50	NC_017350	TCT	2	6	4978	4983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385782938
51	NC_017350	TAA	2	6	5072	5077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
52	NC_017350	TAT	2	6	5114	5119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782938
53	NC_017350	AGA	2	6	5199	5204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782938
54	NC_017350	AAG	2	6	5218	5223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782938
55	NC_017350	GAA	2	6	5426	5431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782938
56	NC_017350	CAT	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782938
57	NC_017350	ATG	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782938
58	NC_017350	TCT	2	6	5850	5855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385782938
59	NC_017350	ATT	2	6	5858	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782938
60	NC_017350	TAA	2	6	5930	5935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
61	NC_017350	GGT	2	6	5938	5943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385782938
62	NC_017350	TAT	2	6	5976	5981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782938
63	NC_017350	AAG	2	6	6182	6187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782939
64	NC_017350	TCA	2	6	6277	6282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782939
65	NC_017350	AGA	2	6	6291	6296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782939
66	NC_017350	TAA	2	6	6330	6335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782939
67	NC_017350	GAA	2	6	6385	6390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782939
68	NC_017350	GAA	2	6	6409	6414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782939
69	NC_017350	TTG	2	6	6886	6891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385782940
70	NC_017350	TAA	2	6	6953	6958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782940
71	NC_017350	AGA	2	6	6983	6988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782940
72	NC_017350	GCA	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385782940
73	NC_017350	TTC	2	6	7085	7090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385782940
74	NC_017350	GTC	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385782940
75	NC_017350	AAT	2	6	7266	7271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782940
76	NC_017350	TTG	2	6	7422	7427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385782941
77	NC_017350	ATC	2	6	7441	7446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782941
78	NC_017350	AAG	2	6	7557	7562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782941
79	NC_017350	ATG	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782941
80	NC_017350	ATT	2	6	7653	7658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782941
81	NC_017350	TGA	2	6	7680	7685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782941
82	NC_017350	ATG	2	6	7700	7705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782941
83	NC_017350	ATT	2	6	7726	7731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782941
84	NC_017350	ATC	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782941
85	NC_017350	TAT	2	6	7866	7871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782941
86	NC_017350	TAT	2	6	7903	7908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782941
87	NC_017350	GAA	2	6	7934	7939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782941
88	NC_017350	AAG	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782941
89	NC_017350	TAA	2	6	8024	8029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782941
90	NC_017350	TCA	2	6	8519	8524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782942
91	NC_017350	GGT	2	6	8549	8554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385782942
92	NC_017350	AAG	2	6	8566	8571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782942
93	NC_017350	TGA	2	6	8597	8602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782942
94	NC_017350	ATG	2	6	8619	8624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782942
95	NC_017350	GAA	3	9	8686	8694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782943
96	NC_017350	GAA	2	6	8839	8844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782943
97	NC_017350	AGA	2	6	8943	8948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782943
98	NC_017350	ACT	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782943
99	NC_017350	ATT	2	6	9096	9101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782943
100	NC_017350	TGA	2	6	9152	9157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782943
101	NC_017350	ATT	2	6	9181	9186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782943
102	NC_017350	TTG	2	6	9209	9214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385782943
103	NC_017350	AAG	2	6	9305	9310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782943
104	NC_017350	ATA	2	6	9337	9342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782943
105	NC_017350	AGA	2	6	9558	9563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782943
106	NC_017350	ATT	2	6	9580	9585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782943
107	NC_017350	TTG	2	6	9590	9595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385782943
108	NC_017350	AAG	2	6	9596	9601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782943
109	NC_017350	TAC	2	6	9652	9657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782943
110	NC_017350	TGG	2	6	9714	9719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385782943
111	NC_017350	GGT	2	6	9853	9858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385782943
112	NC_017350	GAA	2	6	9970	9975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782943
113	NC_017350	AAT	2	6	10038	10043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782943
114	NC_017350	ATA	2	6	10061	10066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782943
115	NC_017350	GAA	2	6	10090	10095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782943
116	NC_017350	ACT	2	6	10141	10146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782943
117	NC_017350	ATT	2	6	10255	10260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782943
118	NC_017350	TCA	2	6	10341	10346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782943
119	NC_017350	ATG	2	6	10526	10531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782943
120	NC_017350	TGC	2	6	10542	10547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385782943
121	NC_017350	GAT	2	6	10624	10629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782943
122	NC_017350	AAT	2	6	10716	10721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782943
123	NC_017350	CTA	2	6	10787	10792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782943
124	NC_017350	TGA	2	6	10820	10825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782943
125	NC_017350	ATG	2	6	10925	10930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782944
126	NC_017350	ATT	2	6	11150	11155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782944
127	NC_017350	TCA	2	6	11357	11362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782944
128	NC_017350	TAA	2	6	11375	11380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782944
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130	NC_017350	ATG	2	6	11455	11460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782944
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.