MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251

Total Repeats: 1468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017349	GTTGAA	2	12	3193	3204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779219
2	NC_017349	ATAAAT	2	12	3294	3305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017349	TTTAAA	2	12	3471	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017349	GTTATC	2	12	7299	7310	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387779223
5	NC_017349	CAGATA	2	12	8208	8219	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387779223
6	NC_017349	CAAGCT	2	12	8267	8278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387779223
7	NC_017349	GTAATG	2	12	9255	9266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779223
8	NC_017349	AGATGA	2	12	9649	9660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387779223
9	NC_017349	ACAATT	2	12	11251	11262	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387779225
10	NC_017349	TAGCAT	2	12	11346	11357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387779225
11	NC_017349	TAAATC	2	12	17163	17174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017349	GCTTTA	2	12	17441	17452	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387779230
13	NC_017349	TTTGAA	2	12	18262	18273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387779230
14	NC_017349	TTGGTG	2	12	19106	19117	0 %	50 %	50 %	0 %	387779231
15	NC_017349	TAAAGG	2	12	20309	20320	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387779232
16	NC_017349	TTGAAG	2	12	20506	20517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779232
17	NC_017349	TGAAAT	2	12	22041	22052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387779233
18	NC_017349	AAGGAA	2	12	22479	22490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779234
19	NC_017349	GTGGGA	2	12	24614	24625	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017349	TGAATT	2	12	25665	25676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387779235
21	NC_017349	ATTTCA	2	12	28149	28160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387779237
22	NC_017349	GTTCTG	2	12	29448	29459	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387779238
23	NC_017349	ATCAGC	2	12	31463	31474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387779240
24	NC_017349	AAAAGA	2	12	34105	34116	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387779241
25	NC_017349	CTAATG	2	12	36265	36276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387779243
26	NC_017349	AATCAA	2	12	39051	39062	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387779244
27	NC_017349	TAAAAT	2	12	40041	40052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017349	TGATAG	2	12	46749	46760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779254
29	NC_017349	AATGTG	2	12	49728	49739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779257
30	NC_017349	AAATAT	2	12	51035	51046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017349	ACATTG	2	12	51404	51415	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387779259
32	NC_017349	GAAAGA	2	12	52734	52745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779259
33	NC_017349	TTTAAA	2	12	53293	53304	50 %	50 %	0 %	0 %	387779260
34	NC_017349	GTTTTC	2	12	56134	56145	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387779261
35	NC_017349	GAGTTT	2	12	56208	56219	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387779261
36	NC_017349	TTACAT	2	12	56515	56526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017349	ATTGAA	2	12	59437	59448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387779263
38	NC_017349	TTCTGG	2	12	59987	59998	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387779264
39	NC_017349	CAAATT	2	12	61018	61029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387779265
40	NC_017349	CAATAG	2	12	62340	62351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387779267
41	NC_017349	GTTAAA	2	12	63347	63358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387779267
42	NC_017349	AAAAAT	2	12	65660	65671	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017349	TGGTAC	2	12	67250	67261	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387779272
44	NC_017349	AAGAAA	2	12	71207	71218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387779273
45	NC_017349	TTAATG	2	12	74220	74231	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387779277
46	NC_017349	AAGTCA	2	12	75428	75439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387779279
47	NC_017349	AAAAAG	2	12	75542	75553	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387779279
48	NC_017349	AATTAT	2	12	78093	78104	50 %	50 %	0 %	0 %	387779281
49	NC_017349	ACCCTT	2	12	79929	79940	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387779283
50	NC_017349	GATGTC	2	12	83834	83845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387779287
51	NC_017349	GTAGAA	2	12	89918	89929	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387779291
52	NC_017349	AACCAC	2	12	90753	90764	50 %	0 %	0 %	50 %	387779291
53	NC_017349	AATATA	2	12	92455	92466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017349	AACCGA	2	12	94069	94080	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387779293
55	NC_017349	CATTAC	2	12	95770	95781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387779294
56	NC_017349	CTTTTA	2	12	95839	95850	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387779294
57	NC_017349	AGCAAA	2	12	98530	98541	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387779296
58	NC_017349	ATAGAT	2	12	98970	98981	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387779296
59	NC_017349	TATCAT	2	12	99737	99748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387779297
60	NC_017349	TTTATT	2	12	100145	100156	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387779298
61	NC_017349	TATTTG	2	12	100231	100242	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387779298
62	NC_017349	TAAATA	2	12	101664	101675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387779298
63	NC_017349	TTTTTC	2	12	103529	103540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387779299
64	NC_017349	TTAAAT	2	12	103624	103635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017349	TAAGCC	2	12	105390	105401	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387779301
66	NC_017349	ATCGCA	2	12	106605	106616	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387779302
67	NC_017349	TTTGAA	2	12	107636	107647	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387779303
68	NC_017349	TGAAGA	2	12	117428	117439	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387779310
69	NC_017349	TTTCAT	2	12	118109	118120	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387779311
70	NC_017349	CATGAA	2	12	119725	119736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387779313
71	NC_017349	ATTTTT	2	12	120323	120334	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387779314
72	NC_017349	TGTATA	2	12	122974	122985	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387779316
73	NC_017349	AATTAT	2	12	123333	123344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017349	TCGAAA	2	12	124475	124486	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387779318
75	NC_017349	CTATTG	2	12	127061	127072	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387779320
76	NC_017349	CATATG	2	12	128264	128275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387779321
77	NC_017349	CAGATT	2	12	133055	133066	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387779325
78	NC_017349	AGATAT	2	12	140453	140464	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387779332
79	NC_017349	GTTTTT	2	12	141362	141373	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017349	TGAAAG	2	12	142233	142244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017349	ATTAAT	2	12	149154	149165	50 %	50 %	0 %	0 %	387779338
82	NC_017349	GATATG	2	12	149737	149748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387779338
83	NC_017349	ATTTGA	2	12	153643	153654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387779341
84	NC_017349	GATTTT	2	12	158154	158165	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387779346
85	NC_017349	ACAAAG	2	12	162674	162685	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387779350
86	NC_017349	TGTAAT	2	12	163698	163709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387779351
87	NC_017349	AAAGAT	2	12	164687	164698	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387779353
88	NC_017349	ATTAAT	2	12	166594	166605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017349	CAATAT	2	12	167160	167171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387779354
90	NC_017349	AATTAG	2	12	169887	169898	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387779358
91	NC_017349	TTGGTA	2	12	171014	171025	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387779359
92	NC_017349	GCGATT	2	12	171034	171045	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387779359
93	NC_017349	AAATTT	2	12	171132	171143	50 %	50 %	0 %	0 %	387779359
94	NC_017349	CTATTA	2	12	177426	177437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387779362
95	NC_017349	TATGAT	2	12	178960	178971	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387779362
96	NC_017349	ATTGAA	2	12	179411	179422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387779362
97	NC_017349	AGCAAC	2	12	185362	185373	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387779366
98	NC_017349	CACCTT	2	12	187414	187425	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387779368
99	NC_017349	ACCTTT	2	12	187919	187930	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387779368
100	NC_017349	TTTATA	2	12	188015	188026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017349	ATTAAT	2	12	188038	188049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017349	GTAAAT	2	12	191652	191663	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387779371
103	NC_017349	ATTTTA	2	12	193248	193259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387779372
104	NC_017349	TATCTT	2	12	197862	197873	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387779375
105	NC_017349	ATTTGG	2	12	198875	198886	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387779376
106	NC_017349	GAGTTT	2	12	202787	202798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387779378
107	NC_017349	CCCTGA	2	12	207362	207373	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387779382
108	NC_017349	TCCTGA	2	12	208181	208192	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387779382
109	NC_017349	TCAATT	2	12	210332	210343	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387779384
110	NC_017349	AATATG	2	12	211632	211643	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387779385
111	NC_017349	AAATTT	2	12	215198	215209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017349	AAAGGA	2	12	216272	216283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387779388
113	NC_017349	ACATTT	2	12	216610	216621	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387779388
114	NC_017349	TTCTTG	2	12	221537	221548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387779392
115	NC_017349	GGACGT	2	12	232380	232391	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387779401
116	NC_017349	ATATGA	2	12	235131	235142	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387779403
117	NC_017349	AAAACT	2	12	238573	238584	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017349	TGAAAC	2	12	238599	238610	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017349	AGCCAT	2	12	245926	245937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387779409
120	NC_017349	AGTGGA	2	12	250069	250080	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017349	TGGTAT	2	12	261654	261665	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387779421
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351	NC_017349	GACTCA	2	12	596009	596020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387779702
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