MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251

Total Repeats: 2460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017349	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	387779218
2	NC_017349	AATTT	2	10	2495	2504	40 %	60 %	0 %	0 %	387779219
3	NC_017349	CAATT	2	10	2561	2570	40 %	40 %	0 %	20 %	387779219
4	NC_017349	AAATT	2	10	2939	2948	60 %	40 %	0 %	0 %	387779219
5	NC_017349	CAAAT	2	10	5226	5235	60 %	20 %	0 %	20 %	387779222
6	NC_017349	TGAAT	2	10	6736	6745	40 %	40 %	20 %	0 %	387779222
7	NC_017349	TGAAC	2	10	6977	6986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017349	TTCAA	2	10	7723	7732	40 %	40 %	0 %	20 %	387779223
9	NC_017349	CGTTG	2	10	11727	11736	0 %	40 %	40 %	20 %	387779225
10	NC_017349	GTAGG	2	10	14399	14408	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017349	TTATT	2	10	15441	15450	20 %	80 %	0 %	0 %	387779228
12	NC_017349	GCAAG	2	10	16615	16624	40 %	0 %	40 %	20 %	387779229
13	NC_017349	GATTT	2	10	16772	16781	20 %	60 %	20 %	0 %	387779229
14	NC_017349	TCAAT	2	10	18911	18920	40 %	40 %	0 %	20 %	387779231
15	NC_017349	AGTTA	2	10	22089	22098	40 %	40 %	20 %	0 %	387779233
16	NC_017349	ATGTA	2	10	23647	23656	40 %	40 %	20 %	0 %	387779234
17	NC_017349	TCGAT	2	10	23811	23820	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017349	ATATT	2	10	24349	24358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017349	GCCCC	2	10	24717	24726	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_017349	ATTTC	2	10	24750	24759	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017349	ACCAA	2	10	26515	26524	60 %	0 %	0 %	40 %	387779236
22	NC_017349	ATCAA	2	10	27227	27236	60 %	20 %	0 %	20 %	387779236
23	NC_017349	GAAAC	2	10	27848	27857	60 %	0 %	20 %	20 %	387779237
24	NC_017349	GAAGT	2	10	27998	28007	40 %	20 %	40 %	0 %	387779237
25	NC_017349	ATTAT	2	10	29641	29650	40 %	60 %	0 %	0 %	387779238
26	NC_017349	AAACG	2	10	31559	31568	60 %	0 %	20 %	20 %	387779240
27	NC_017349	AAGGT	2	10	32731	32740	40 %	20 %	40 %	0 %	387779240
28	NC_017349	TATGA	2	10	32928	32937	40 %	40 %	20 %	0 %	387779240
29	NC_017349	GTTGT	2	10	33321	33330	0 %	60 %	40 %	0 %	387779240
30	NC_017349	CATTA	2	10	34159	34168	40 %	40 %	0 %	20 %	387779241
31	NC_017349	TAGTA	2	10	38450	38459	40 %	40 %	20 %	0 %	387779244
32	NC_017349	AATGG	2	10	39016	39025	40 %	20 %	40 %	0 %	387779244
33	NC_017349	AAGTT	2	10	39238	39247	40 %	40 %	20 %	0 %	387779244
34	NC_017349	TAATA	2	10	40128	40137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017349	TAATT	2	10	40851	40860	40 %	60 %	0 %	0 %	387779247
36	NC_017349	GATAA	2	10	41134	41143	60 %	20 %	20 %	0 %	387779248
37	NC_017349	AATAG	2	10	42050	42059	60 %	20 %	20 %	0 %	387779249
38	NC_017349	ATAAA	2	10	42089	42098	80 %	20 %	0 %	0 %	387779249
39	NC_017349	TGTGT	2	10	43464	43473	0 %	60 %	40 %	0 %	387779252
40	NC_017349	ATTTT	2	10	44103	44112	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017349	ATGTT	2	10	44441	44450	20 %	60 %	20 %	0 %	387779253
42	NC_017349	ATTTG	2	10	44536	44545	20 %	60 %	20 %	0 %	387779253
43	NC_017349	TGATT	2	10	45755	45764	20 %	60 %	20 %	0 %	387779253
44	NC_017349	TCAGT	2	10	47047	47056	20 %	40 %	20 %	20 %	387779254
45	NC_017349	ATTGA	2	10	47409	47418	40 %	40 %	20 %	0 %	387779255
46	NC_017349	TTAAT	2	10	47677	47686	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017349	CGCTT	2	10	47933	47942	0 %	40 %	20 %	40 %	387779256
48	NC_017349	TATAA	2	10	51074	51083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017349	TATTT	2	10	52578	52587	20 %	80 %	0 %	0 %	387779259
50	NC_017349	TGTAT	2	10	53052	53061	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017349	CATTA	2	10	53204	53213	40 %	40 %	0 %	20 %	387779260
52	NC_017349	TAATA	2	10	55273	55282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017349	ATTTT	2	10	56658	56667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017349	TTGGT	2	10	57007	57016	0 %	60 %	40 %	0 %	387779262
55	NC_017349	ATGAT	2	10	57477	57486	40 %	40 %	20 %	0 %	387779262
56	NC_017349	AGTTT	2	10	58844	58853	20 %	60 %	20 %	0 %	387779263
57	NC_017349	ATTTC	2	10	59506	59515	20 %	60 %	0 %	20 %	387779263
58	NC_017349	AGTGC	2	10	59719	59728	20 %	20 %	40 %	20 %	387779263
59	NC_017349	ACTTA	2	10	60617	60626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017349	TTTCA	2	10	60746	60755	20 %	60 %	0 %	20 %	387779265
61	NC_017349	ACAAA	2	10	64524	64533	80 %	0 %	0 %	20 %	387779269
62	NC_017349	CTATT	2	10	66740	66749	20 %	60 %	0 %	20 %	387779271
63	NC_017349	ATTTA	2	10	67190	67199	40 %	60 %	0 %	0 %	387779272
64	NC_017349	ATTTT	2	10	67529	67538	20 %	80 %	0 %	0 %	387779272
65	NC_017349	GGTAG	2	10	68022	68031	20 %	20 %	60 %	0 %	387779272
66	NC_017349	TTTTG	2	10	69147	69156	0 %	80 %	20 %	0 %	387779273
67	NC_017349	TATGA	2	10	69811	69820	40 %	40 %	20 %	0 %	387779273
68	NC_017349	ATTAT	2	10	70664	70673	40 %	60 %	0 %	0 %	387779273
69	NC_017349	AGTTG	2	10	71028	71037	20 %	40 %	40 %	0 %	387779273
70	NC_017349	CTTTT	2	10	71746	71755	0 %	80 %	0 %	20 %	387779274
71	NC_017349	TAGTA	2	10	72072	72081	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017349	GAAAA	2	10	72166	72175	80 %	0 %	20 %	0 %	387779275
73	NC_017349	ATTTC	2	10	73353	73362	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017349	GCCCC	2	10	73381	73390	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
75	NC_017349	TACTA	2	10	74035	74044	40 %	40 %	0 %	20 %	387779277
76	NC_017349	AGCAA	2	10	75042	75051	60 %	0 %	20 %	20 %	387779279
77	NC_017349	ATCAA	2	10	76788	76797	60 %	20 %	0 %	20 %	387779280
78	NC_017349	TAATA	2	10	78619	78628	60 %	40 %	0 %	0 %	387779281
79	NC_017349	GTGTT	2	10	78703	78712	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017349	AAGTG	2	10	81128	81137	40 %	20 %	40 %	0 %	387779284
81	NC_017349	ATTTT	2	10	81218	81227	20 %	80 %	0 %	0 %	387779285
82	NC_017349	TATGG	2	10	83231	83240	20 %	40 %	40 %	0 %	387779287
83	NC_017349	TAACT	2	10	83536	83545	40 %	40 %	0 %	20 %	387779287
84	NC_017349	ATATA	2	10	87120	87129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017349	ATTGC	2	10	88061	88070	20 %	40 %	20 %	20 %	387779290
86	NC_017349	TCATT	2	10	88249	88258	20 %	60 %	0 %	20 %	387779290
87	NC_017349	TGAAA	2	10	90133	90142	60 %	20 %	20 %	0 %	387779291
88	NC_017349	TCAAT	2	10	90505	90514	40 %	40 %	0 %	20 %	387779291
89	NC_017349	GTATT	2	10	90994	91003	20 %	60 %	20 %	0 %	387779292
90	NC_017349	AGATA	2	10	96860	96869	60 %	20 %	20 %	0 %	387779295
91	NC_017349	TAAAA	2	10	97420	97429	80 %	20 %	0 %	0 %	387779295
92	NC_017349	ATACA	2	10	97851	97860	60 %	20 %	0 %	20 %	387779296
93	NC_017349	AAAGA	2	10	99054	99063	80 %	0 %	20 %	0 %	387779296
94	NC_017349	GTAAT	2	10	99273	99282	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017349	CAATT	2	10	99705	99714	40 %	40 %	0 %	20 %	387779297
96	NC_017349	ATGTT	2	10	100539	100548	20 %	60 %	20 %	0 %	387779298
97	NC_017349	TTGCG	2	10	101110	101119	0 %	40 %	40 %	20 %	387779298
98	NC_017349	AGTTA	2	10	102667	102676	40 %	40 %	20 %	0 %	387779299
99	NC_017349	TAAAA	2	10	103653	103662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017349	AGATG	2	10	106040	106049	40 %	20 %	40 %	0 %	387779301
101	NC_017349	GAAAA	2	10	110073	110082	80 %	0 %	20 %	0 %	387779305
102	NC_017349	AATCA	2	10	113262	113271	60 %	20 %	0 %	20 %	387779307
103	NC_017349	ATTTT	2	10	113960	113969	20 %	80 %	0 %	0 %	387779308
104	NC_017349	ATCAA	2	10	113987	113996	60 %	20 %	0 %	20 %	387779308
105	NC_017349	ATCAC	2	10	115220	115229	40 %	20 %	0 %	40 %	387779309
106	NC_017349	AACGA	2	10	115897	115906	60 %	0 %	20 %	20 %	387779309
107	NC_017349	ACACA	2	10	117953	117962	60 %	0 %	0 %	40 %	387779311
108	NC_017349	GACAA	2	10	119104	119113	60 %	0 %	20 %	20 %	387779312
109	NC_017349	TCTTA	2	10	119887	119896	20 %	60 %	0 %	20 %	387779313
110	NC_017349	ATTAC	2	10	121934	121943	40 %	40 %	0 %	20 %	387779315
111	NC_017349	ATTTT	2	10	122237	122246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017349	TATCT	2	10	122593	122602	20 %	60 %	0 %	20 %	387779316
113	NC_017349	ATACG	2	10	125026	125035	40 %	20 %	20 %	20 %	387779318
114	NC_017349	TTATA	2	10	125684	125693	40 %	60 %	0 %	0 %	387779319
115	NC_017349	TTTTA	2	10	126482	126491	20 %	80 %	0 %	0 %	387779319
116	NC_017349	GTATT	2	10	126995	127004	20 %	60 %	20 %	0 %	387779320
117	NC_017349	AATAA	2	10	127588	127597	80 %	20 %	0 %	0 %	387779320
118	NC_017349	TACGC	2	10	127855	127864	20 %	20 %	20 %	40 %	387779320
119	NC_017349	TACTT	2	10	128983	128992	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017349	TCCCT	2	10	129811	129820	0 %	40 %	0 %	60 %	387779322
121	NC_017349	GCTTT	2	10	132045	132054	0 %	60 %	20 %	20 %	387779324
122	NC_017349	TAATT	2	10	132130	132139	40 %	60 %	0 %	0 %	387779324
123	NC_017349	ATACT	2	10	133311	133320	40 %	40 %	0 %	20 %	387779326
124	NC_017349	TAATA	2	10	134346	134355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017349	TAATA	2	10	134476	134485	60 %	40 %	0 %	0 %	387779327
126	NC_017349	ATTTT	2	10	135467	135476	20 %	80 %	0 %	0 %	387779328
127	NC_017349	TAAAA	2	10	135666	135675	80 %	20 %	0 %	0 %	387779328
128	NC_017349	TTGTA	2	10	137691	137700	20 %	60 %	20 %	0 %	387779330
129	NC_017349	TGCAA	2	10	138696	138705	40 %	20 %	20 %	20 %	387779331
130	NC_017349	ATATG	2	10	140714	140723	40 %	40 %	20 %	0 %	387779332
131	NC_017349	TATGA	2	10	142395	142404	40 %	40 %	20 %	0 %	387779333
132	NC_017349	AATAT	2	10	143401	143410	60 %	40 %	0 %	0 %	387779333
133	NC_017349	CGAAC	2	10	145390	145399	40 %	0 %	20 %	40 %	387779334
134	NC_017349	TTCAA	2	10	147417	147426	40 %	40 %	0 %	20 %	387779335
135	NC_017349	ACATC	2	10	148260	148269	40 %	20 %	0 %	40 %	387779337
136	NC_017349	TAATT	2	10	150483	150492	40 %	60 %	0 %	0 %	387779338
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138	NC_017349	TGAAT	2	10	162621	162630	40 %	40 %	20 %	0 %	387779350
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