MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251

Total Repeats: 1767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017349	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	387779218
2	NC_017349	AATTT	2	10	2495	2504	40 %	60 %	0 %	0 %	387779219
3	NC_017349	CAATT	2	10	2561	2570	40 %	40 %	0 %	20 %	387779219
4	NC_017349	AAATT	2	10	2939	2948	60 %	40 %	0 %	0 %	387779219
5	NC_017349	CAAAT	2	10	5226	5235	60 %	20 %	0 %	20 %	387779222
6	NC_017349	TGAAT	2	10	6736	6745	40 %	40 %	20 %	0 %	387779222
7	NC_017349	TTCAA	2	10	7723	7732	40 %	40 %	0 %	20 %	387779223
8	NC_017349	CGTTG	2	10	11727	11736	0 %	40 %	40 %	20 %	387779225
9	NC_017349	TTATT	2	10	15441	15450	20 %	80 %	0 %	0 %	387779228
10	NC_017349	GCAAG	2	10	16615	16624	40 %	0 %	40 %	20 %	387779229
11	NC_017349	GATTT	2	10	16772	16781	20 %	60 %	20 %	0 %	387779229
12	NC_017349	TCAAT	2	10	18911	18920	40 %	40 %	0 %	20 %	387779231
13	NC_017349	AGTTA	2	10	22089	22098	40 %	40 %	20 %	0 %	387779233
14	NC_017349	ATGTA	2	10	23647	23656	40 %	40 %	20 %	0 %	387779234
15	NC_017349	ACCAA	2	10	26515	26524	60 %	0 %	0 %	40 %	387779236
16	NC_017349	ATCAA	2	10	27227	27236	60 %	20 %	0 %	20 %	387779236
17	NC_017349	GAAAC	2	10	27848	27857	60 %	0 %	20 %	20 %	387779237
18	NC_017349	GAAGT	2	10	27998	28007	40 %	20 %	40 %	0 %	387779237
19	NC_017349	ATTAT	2	10	29641	29650	40 %	60 %	0 %	0 %	387779238
20	NC_017349	AAACG	2	10	31559	31568	60 %	0 %	20 %	20 %	387779240
21	NC_017349	AAGGT	2	10	32731	32740	40 %	20 %	40 %	0 %	387779240
22	NC_017349	TATGA	2	10	32928	32937	40 %	40 %	20 %	0 %	387779240
23	NC_017349	GTTGT	2	10	33321	33330	0 %	60 %	40 %	0 %	387779240
24	NC_017349	CATTA	2	10	34159	34168	40 %	40 %	0 %	20 %	387779241
25	NC_017349	TAGTA	2	10	38450	38459	40 %	40 %	20 %	0 %	387779244
26	NC_017349	AATGG	2	10	39016	39025	40 %	20 %	40 %	0 %	387779244
27	NC_017349	AAGTT	2	10	39238	39247	40 %	40 %	20 %	0 %	387779244
28	NC_017349	TAATT	2	10	40851	40860	40 %	60 %	0 %	0 %	387779247
29	NC_017349	GATAA	2	10	41134	41143	60 %	20 %	20 %	0 %	387779248
30	NC_017349	AATAG	2	10	42050	42059	60 %	20 %	20 %	0 %	387779249
31	NC_017349	ATAAA	2	10	42089	42098	80 %	20 %	0 %	0 %	387779249
32	NC_017349	TGTGT	2	10	43464	43473	0 %	60 %	40 %	0 %	387779252
33	NC_017349	ATGTT	2	10	44441	44450	20 %	60 %	20 %	0 %	387779253
34	NC_017349	ATTTG	2	10	44536	44545	20 %	60 %	20 %	0 %	387779253
35	NC_017349	TGATT	2	10	45755	45764	20 %	60 %	20 %	0 %	387779253
36	NC_017349	TCAGT	2	10	47047	47056	20 %	40 %	20 %	20 %	387779254
37	NC_017349	ATTGA	2	10	47409	47418	40 %	40 %	20 %	0 %	387779255
38	NC_017349	CGCTT	2	10	47933	47942	0 %	40 %	20 %	40 %	387779256
39	NC_017349	TATTT	2	10	52578	52587	20 %	80 %	0 %	0 %	387779259
40	NC_017349	CATTA	2	10	53204	53213	40 %	40 %	0 %	20 %	387779260
41	NC_017349	TTGGT	2	10	57007	57016	0 %	60 %	40 %	0 %	387779262
42	NC_017349	ATGAT	2	10	57477	57486	40 %	40 %	20 %	0 %	387779262
43	NC_017349	AGTTT	2	10	58844	58853	20 %	60 %	20 %	0 %	387779263
44	NC_017349	ATTTC	2	10	59506	59515	20 %	60 %	0 %	20 %	387779263
45	NC_017349	AGTGC	2	10	59719	59728	20 %	20 %	40 %	20 %	387779263
46	NC_017349	TTTCA	2	10	60746	60755	20 %	60 %	0 %	20 %	387779265
47	NC_017349	ACAAA	2	10	64524	64533	80 %	0 %	0 %	20 %	387779269
48	NC_017349	CTATT	2	10	66740	66749	20 %	60 %	0 %	20 %	387779271
49	NC_017349	ATTTA	2	10	67190	67199	40 %	60 %	0 %	0 %	387779272
50	NC_017349	ATTTT	2	10	67529	67538	20 %	80 %	0 %	0 %	387779272
51	NC_017349	GGTAG	2	10	68022	68031	20 %	20 %	60 %	0 %	387779272
52	NC_017349	TTTTG	2	10	69147	69156	0 %	80 %	20 %	0 %	387779273
53	NC_017349	TATGA	2	10	69811	69820	40 %	40 %	20 %	0 %	387779273
54	NC_017349	ATTAT	2	10	70664	70673	40 %	60 %	0 %	0 %	387779273
55	NC_017349	AGTTG	2	10	71028	71037	20 %	40 %	40 %	0 %	387779273
56	NC_017349	CTTTT	2	10	71746	71755	0 %	80 %	0 %	20 %	387779274
57	NC_017349	GAAAA	2	10	72166	72175	80 %	0 %	20 %	0 %	387779275
58	NC_017349	TACTA	2	10	74035	74044	40 %	40 %	0 %	20 %	387779277
59	NC_017349	AGCAA	2	10	75042	75051	60 %	0 %	20 %	20 %	387779279
60	NC_017349	ATCAA	2	10	76788	76797	60 %	20 %	0 %	20 %	387779280
61	NC_017349	TAATA	2	10	78619	78628	60 %	40 %	0 %	0 %	387779281
62	NC_017349	AAGTG	2	10	81128	81137	40 %	20 %	40 %	0 %	387779284
63	NC_017349	ATTTT	2	10	81218	81227	20 %	80 %	0 %	0 %	387779285
64	NC_017349	TATGG	2	10	83231	83240	20 %	40 %	40 %	0 %	387779287
65	NC_017349	TAACT	2	10	83536	83545	40 %	40 %	0 %	20 %	387779287
66	NC_017349	ATTGC	2	10	88061	88070	20 %	40 %	20 %	20 %	387779290
67	NC_017349	TCATT	2	10	88249	88258	20 %	60 %	0 %	20 %	387779290
68	NC_017349	TGAAA	2	10	90133	90142	60 %	20 %	20 %	0 %	387779291
69	NC_017349	TCAAT	2	10	90505	90514	40 %	40 %	0 %	20 %	387779291
70	NC_017349	GTATT	2	10	90994	91003	20 %	60 %	20 %	0 %	387779292
71	NC_017349	AGATA	2	10	96860	96869	60 %	20 %	20 %	0 %	387779295
72	NC_017349	TAAAA	2	10	97420	97429	80 %	20 %	0 %	0 %	387779295
73	NC_017349	ATACA	2	10	97851	97860	60 %	20 %	0 %	20 %	387779296
74	NC_017349	AAAGA	2	10	99054	99063	80 %	0 %	20 %	0 %	387779296
75	NC_017349	CAATT	2	10	99705	99714	40 %	40 %	0 %	20 %	387779297
76	NC_017349	ATGTT	2	10	100539	100548	20 %	60 %	20 %	0 %	387779298
77	NC_017349	TTGCG	2	10	101110	101119	0 %	40 %	40 %	20 %	387779298
78	NC_017349	AGTTA	2	10	102667	102676	40 %	40 %	20 %	0 %	387779299
79	NC_017349	AGATG	2	10	106040	106049	40 %	20 %	40 %	0 %	387779301
80	NC_017349	GAAAA	2	10	110073	110082	80 %	0 %	20 %	0 %	387779305
81	NC_017349	AATCA	2	10	113262	113271	60 %	20 %	0 %	20 %	387779307
82	NC_017349	ATTTT	2	10	113960	113969	20 %	80 %	0 %	0 %	387779308
83	NC_017349	ATCAA	2	10	113987	113996	60 %	20 %	0 %	20 %	387779308
84	NC_017349	ATCAC	2	10	115220	115229	40 %	20 %	0 %	40 %	387779309
85	NC_017349	AACGA	2	10	115897	115906	60 %	0 %	20 %	20 %	387779309
86	NC_017349	ACACA	2	10	117953	117962	60 %	0 %	0 %	40 %	387779311
87	NC_017349	GACAA	2	10	119104	119113	60 %	0 %	20 %	20 %	387779312
88	NC_017349	TCTTA	2	10	119887	119896	20 %	60 %	0 %	20 %	387779313
89	NC_017349	ATTAC	2	10	121934	121943	40 %	40 %	0 %	20 %	387779315
90	NC_017349	TATCT	2	10	122593	122602	20 %	60 %	0 %	20 %	387779316
91	NC_017349	ATACG	2	10	125026	125035	40 %	20 %	20 %	20 %	387779318
92	NC_017349	TTATA	2	10	125684	125693	40 %	60 %	0 %	0 %	387779319
93	NC_017349	TTTTA	2	10	126482	126491	20 %	80 %	0 %	0 %	387779319
94	NC_017349	GTATT	2	10	126995	127004	20 %	60 %	20 %	0 %	387779320
95	NC_017349	AATAA	2	10	127588	127597	80 %	20 %	0 %	0 %	387779320
96	NC_017349	TACGC	2	10	127855	127864	20 %	20 %	20 %	40 %	387779320
97	NC_017349	TCCCT	2	10	129811	129820	0 %	40 %	0 %	60 %	387779322
98	NC_017349	GCTTT	2	10	132045	132054	0 %	60 %	20 %	20 %	387779324
99	NC_017349	TAATT	2	10	132130	132139	40 %	60 %	0 %	0 %	387779324
100	NC_017349	ATACT	2	10	133311	133320	40 %	40 %	0 %	20 %	387779326
101	NC_017349	TAATA	2	10	134476	134485	60 %	40 %	0 %	0 %	387779327
102	NC_017349	ATTTT	2	10	135467	135476	20 %	80 %	0 %	0 %	387779328
103	NC_017349	TAAAA	2	10	135666	135675	80 %	20 %	0 %	0 %	387779328
104	NC_017349	TTGTA	2	10	137691	137700	20 %	60 %	20 %	0 %	387779330
105	NC_017349	TGCAA	2	10	138696	138705	40 %	20 %	20 %	20 %	387779331
106	NC_017349	ATATG	2	10	140714	140723	40 %	40 %	20 %	0 %	387779332
107	NC_017349	TATGA	2	10	142395	142404	40 %	40 %	20 %	0 %	387779333
108	NC_017349	AATAT	2	10	143401	143410	60 %	40 %	0 %	0 %	387779333
109	NC_017349	CGAAC	2	10	145390	145399	40 %	0 %	20 %	40 %	387779334
110	NC_017349	TTCAA	2	10	147417	147426	40 %	40 %	0 %	20 %	387779335
111	NC_017349	ACATC	2	10	148260	148269	40 %	20 %	0 %	40 %	387779337
112	NC_017349	TAATT	2	10	150483	150492	40 %	60 %	0 %	0 %	387779338
113	NC_017349	AGAGA	2	10	153509	153518	60 %	0 %	40 %	0 %	387779341
114	NC_017349	TGAAT	2	10	162621	162630	40 %	40 %	20 %	0 %	387779350
115	NC_017349	CAAAA	2	10	164005	164014	80 %	0 %	0 %	20 %	387779352
116	NC_017349	TTCAT	2	10	166860	166869	20 %	60 %	0 %	20 %	387779354
117	NC_017349	TTTAC	2	10	167243	167252	20 %	60 %	0 %	20 %	387779354
118	NC_017349	TTATT	2	10	168223	168232	20 %	80 %	0 %	0 %	387779356
119	NC_017349	GGATT	2	10	169211	169220	20 %	40 %	40 %	0 %	387779357
120	NC_017349	CACAA	2	10	169863	169872	60 %	0 %	0 %	40 %	387779358
121	NC_017349	TAACT	2	10	172251	172260	40 %	40 %	0 %	20 %	387779360
122	NC_017349	TGCAT	2	10	173391	173400	20 %	40 %	20 %	20 %	387779361
123	NC_017349	ACATT	2	10	173483	173492	40 %	40 %	0 %	20 %	387779361
124	NC_017349	TATTT	2	10	173940	173949	20 %	80 %	0 %	0 %	387779361
125	NC_017349	ATGCA	2	10	175222	175231	40 %	20 %	20 %	20 %	387779362
126	NC_017349	TATGA	2	10	182468	182477	40 %	40 %	20 %	0 %	387779363
127	NC_017349	GTGAA	2	10	182502	182511	40 %	20 %	40 %	0 %	387779363
128	NC_017349	ATATA	2	10	185796	185805	60 %	40 %	0 %	0 %	387779367
129	NC_017349	AAGAT	2	10	189521	189530	60 %	20 %	20 %	0 %	387779369
130	NC_017349	CGTTT	2	10	189967	189976	0 %	60 %	20 %	20 %	387779370
131	NC_017349	AAATG	2	10	192448	192457	60 %	20 %	20 %	0 %	387779372
132	NC_017349	GTAAA	2	10	192612	192621	60 %	20 %	20 %	0 %	387779372
133	NC_017349	TTTAA	2	10	192632	192641	40 %	60 %	0 %	0 %	387779372
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135	NC_017349	TTGTT	2	10	194154	194163	0 %	80 %	20 %	0 %	387779372
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