MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251

Total Repeats: 2048

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017349	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017349	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017349	ATTA	2	8	3319	3326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017349	AAAT	2	8	3376	3383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017349	AATT	2	8	3575	3582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017349	CTAC	2	8	12569	12576	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017349	ACGT	2	8	12733	12740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017349	TAAA	2	8	14536	14543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017349	TATT	2	8	22315	22322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017349	ATCT	2	8	24131	24138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017349	GCCT	2	8	24259	24266	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017349	ATTT	2	8	24593	24600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017349	ATTT	2	8	24647	24654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017349	CATT	2	8	30047	30054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017349	ATCA	2	8	31188	31195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017349	TAAT	2	8	35649	35656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017349	TGAT	2	8	43777	43784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017349	ACTT	2	8	43988	43995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017349	TTAT	3	12	44008	44019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017349	CCAG	2	8	47291	47298	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017349	TGAT	2	8	47328	47335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017349	CTTT	2	8	51011	51018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017349	GATG	2	8	54698	54705	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017349	TATT	2	8	54897	54904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017349	CTAA	2	8	54939	54946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017349	AAAT	2	8	54970	54977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017349	TTGT	2	8	55129	55136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017349	TTGT	2	8	55352	55359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017349	TTTG	2	8	55559	55566	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017349	TCCT	2	8	56577	56584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017349	ATAA	2	8	58485	58492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017349	GTTT	2	8	58699	58706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017349	TAAT	2	8	60574	60581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017349	TAAT	2	8	61408	61415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017349	ATTG	2	8	72992	72999	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017349	ATTT	2	8	73312	73319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017349	TATT	2	8	80693	80700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017349	AGTG	2	8	84318	84325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017349	TATT	2	8	84353	84360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017349	TAAG	2	8	84491	84498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017349	AGCT	2	8	85132	85139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017349	TAAT	2	8	85206	85213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017349	TAAT	2	8	85278	85285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017349	AGAA	2	8	85297	85304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017349	TTGT	2	8	86417	86424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017349	TAAA	2	8	86535	86542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017349	GTAT	2	8	86642	86649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017349	ATAA	2	8	87281	87288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017349	ATAA	2	8	89727	89734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017349	ATCA	2	8	89737	89744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017349	ATGA	2	8	89765	89772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017349	TTAT	2	8	92512	92519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017349	ATAA	2	8	92812	92819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017349	AAAG	2	8	99321	99328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017349	ATAA	2	8	99862	99869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017349	TATT	2	8	99900	99907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017349	AGTA	2	8	101842	101849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017349	TTGT	2	8	101985	101992	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017349	TGTA	2	8	103555	103562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017349	ATTG	2	8	104901	104908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017349	GTTA	2	8	105023	105030	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017349	TAAA	2	8	119668	119675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017349	TAAA	2	8	119706	119713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017349	TAAA	2	8	120184	120191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017349	ATAA	2	8	122003	122010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017349	TAAA	2	8	122249	122256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017349	ATAA	2	8	123324	123331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017349	AAAT	2	8	128161	128168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017349	ATTA	2	8	128195	128202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017349	ATAA	2	8	129073	129080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017349	GAGC	2	8	129121	129128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017349	TGAA	2	8	129184	129191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017349	ATAG	2	8	130095	130102	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017349	TAAA	2	8	132372	132379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017349	CTTT	2	8	136804	136811	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017349	CTTT	2	8	138080	138087	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017349	ATTT	2	8	138167	138174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017349	AAGA	2	8	139753	139760	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017349	GAGT	2	8	139776	139783	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017349	ACTT	2	8	141338	141345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017349	ATTT	2	8	143679	143686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017349	TATT	2	8	146523	146530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017349	ATAA	2	8	146650	146657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017349	TAAT	2	8	146685	146692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017349	TAAA	2	8	160810	160817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017349	ACAT	2	8	162133	162140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017349	GTTT	2	8	166315	166322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017349	TAAC	2	8	166415	166422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017349	ATTT	2	8	166658	166665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017349	TTTA	2	8	167928	167935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017349	GAGT	2	8	169679	169686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017349	ATTT	2	8	172741	172748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017349	ATTT	2	8	174351	174358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017349	ATGT	2	8	174582	174589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017349	TTAA	2	8	174703	174710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017349	AGTA	2	8	174745	174752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017349	AAGT	2	8	182750	182757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017349	ATCA	2	8	182889	182896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017349	TGTA	2	8	188110	188117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017349	TTAA	2	8	189648	189655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017349	AGGG	2	8	192282	192289	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017349	CTTA	2	8	194574	194581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017349	TAAT	2	8	194600	194607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017349	TTTG	2	8	194690	194697	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017349	AAAG	2	8	194871	194878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017349	AGTT	2	8	199370	199377	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017349	TTTG	2	8	203457	203464	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017349	ATGT	2	8	203569	203576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017349	TAGT	2	8	206632	206639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017349	TGAA	2	8	214803	214810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017349	TAGT	2	8	214948	214955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017349	ATCA	2	8	216002	216009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017349	GGAT	2	8	216129	216136	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017349	ATTT	2	8	221732	221739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017349	TTGA	2	8	221948	221955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017349	TTGT	2	8	225291	225298	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017349	TATT	2	8	226120	226127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017349	GAAA	2	8	227918	227925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017349	TTTG	2	8	231408	231415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017349	ACAT	2	8	231734	231741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017349	AAAG	2	8	234905	234912	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017349	CTAT	2	8	237920	237927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017349	AGAT	2	8	237939	237946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017349	TATT	2	8	237976	237983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017349	AATG	2	8	238089	238096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017349	TGAT	2	8	238388	238395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017349	CAAA	2	8	238434	238441	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017349	AAAC	2	8	239186	239193	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017349	AAAC	2	8	239348	239355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017349	CAAA	2	8	239585	239592	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017349	TTCA	2	8	240283	240290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017349	ATTG	2	8	243877	243884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017349	AATT	2	8	251903	251910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017349	AAAT	2	8	251931	251938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017349	AAAT	2	8	252413	252420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017349	AATT	2	8	253905	253912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017349	ATAA	2	8	253926	253933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017349	ATTT	2	8	254033	254040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017349	AAAT	2	8	254199	254206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017349	AAAT	2	8	254257	254264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017349	ATGT	2	8	254383	254390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017349	ATAA	2	8	257532	257539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017349	TTAA	2	8	258528	258535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017349	ATGT	2	8	258631	258638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017349	AGGG	2	8	261920	261927	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017349	TCAA	2	8	269607	269614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017349	AATC	2	8	269659	269666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017349	ATTA	2	8	271085	271092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017349	ATAA	2	8	271103	271110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017349	TATG	2	8	281440	281447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017349	CGTT	2	8	281481	281488	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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