MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus T0131 chromosome

Total Repeats: 2599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017347	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	384868589
2	NC_017347	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	384868590
3	NC_017347	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	384868590
4	NC_017347	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	384868590
5	NC_017347	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	384868593
6	NC_017347	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	384868593
7	NC_017347	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017347	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	384868594
9	NC_017347	CTATA	2	10	9725	9734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017347	GTAGG	2	10	14396	14405	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017347	TTATT	2	10	15432	15441	20 %	80 %	0 %	0 %	384868600
12	NC_017347	CGATT	2	10	16761	16770	20 %	40 %	20 %	20 %	384868601
13	NC_017347	TCAAT	2	10	18901	18910	40 %	40 %	0 %	20 %	384868603
14	NC_017347	AGTTA	2	10	22079	22088	40 %	40 %	20 %	0 %	384868605
15	NC_017347	ATGTA	2	10	23638	23647	40 %	40 %	20 %	0 %	384868606
16	NC_017347	TCGAT	2	10	23802	23811	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017347	ATATT	2	10	24256	24265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017347	ACCAA	2	10	26152	26161	60 %	0 %	0 %	40 %	384868608
19	NC_017347	ATCAA	2	10	26864	26873	60 %	20 %	0 %	20 %	384868608
20	NC_017347	GAAAC	2	10	27485	27494	60 %	0 %	20 %	20 %	384868609
21	NC_017347	GAAGT	2	10	27635	27644	40 %	20 %	40 %	0 %	384868609
22	NC_017347	ATTAT	2	10	29278	29287	40 %	60 %	0 %	0 %	384868610
23	NC_017347	AACGA	2	10	29351	29360	60 %	0 %	20 %	20 %	384868610
24	NC_017347	AAACG	2	10	31196	31205	60 %	0 %	20 %	20 %	384868612
25	NC_017347	TGGCG	2	10	31881	31890	0 %	20 %	60 %	20 %	384868612
26	NC_017347	AAGGT	2	10	32368	32377	40 %	20 %	40 %	0 %	384868612
27	NC_017347	TATGA	2	10	32565	32574	40 %	40 %	20 %	0 %	384868612
28	NC_017347	CATTA	2	10	33795	33804	40 %	40 %	0 %	20 %	384868614
29	NC_017347	TTTCA	2	10	34198	34207	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017347	AAATG	2	10	35439	35448	60 %	20 %	20 %	0 %	384868615
31	NC_017347	ATTTT	2	10	35520	35529	20 %	80 %	0 %	0 %	384868615
32	NC_017347	TAAAA	2	10	35651	35660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017347	AGATA	2	10	35809	35818	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017347	ATGAG	2	10	38063	38072	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017347	TGAAT	2	10	38410	38419	40 %	40 %	20 %	0 %	384868619
36	NC_017347	TTGGT	2	10	38452	38461	0 %	60 %	40 %	0 %	384868619
37	NC_017347	AATAT	2	10	38520	38529	60 %	40 %	0 %	0 %	384868619
38	NC_017347	TTCGT	2	10	38731	38740	0 %	60 %	20 %	20 %	384868619
39	NC_017347	CAAAA	2	10	39091	39100	80 %	0 %	0 %	20 %	384868620
40	NC_017347	AAATT	2	10	41190	41199	60 %	40 %	0 %	0 %	384868621
41	NC_017347	TTTAA	2	10	44149	44158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017347	TTATT	2	10	44473	44482	20 %	80 %	0 %	0 %	384868624
43	NC_017347	GAATT	2	10	45448	45457	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017347	TGGTG	2	10	46100	46109	0 %	40 %	60 %	0 %	384868626
45	NC_017347	CTTTT	2	10	47364	47373	0 %	80 %	0 %	20 %	384868627
46	NC_017347	ATAGC	2	10	48867	48876	40 %	20 %	20 %	20 %	384868629
47	NC_017347	ATATA	2	10	49000	49009	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017347	TACTT	2	10	49208	49217	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017347	GAAGT	2	10	50675	50684	40 %	20 %	40 %	0 %	384868631
50	NC_017347	GATTC	2	10	53121	53130	20 %	40 %	20 %	20 %	384868633
51	NC_017347	GTTGT	2	10	56298	56307	0 %	60 %	40 %	0 %	384868637
52	NC_017347	ATTTT	2	10	57481	57490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017347	ATTTG	2	10	57912	57921	20 %	60 %	20 %	0 %	384868639
54	NC_017347	GAATT	2	10	58520	58529	40 %	40 %	20 %	0 %	384868639
55	NC_017347	AGATA	2	10	58550	58559	60 %	20 %	20 %	0 %	384868639
56	NC_017347	TGACT	2	10	62055	62064	20 %	40 %	20 %	20 %	384868642
57	NC_017347	CAATA	2	10	62160	62169	60 %	20 %	0 %	20 %	384868642
58	NC_017347	TGTTT	2	10	62356	62365	0 %	80 %	20 %	0 %	384868642
59	NC_017347	AATGA	2	10	62560	62569	60 %	20 %	20 %	0 %	384868642
60	NC_017347	TAAAT	2	10	63170	63179	60 %	40 %	0 %	0 %	384868643
61	NC_017347	AATTA	2	10	66420	66429	60 %	40 %	0 %	0 %	384868646
62	NC_017347	AACGA	2	10	68498	68507	60 %	0 %	20 %	20 %	384868648
63	NC_017347	AACAG	2	10	68628	68637	60 %	0 %	20 %	20 %	384868648
64	NC_017347	GACTT	2	10	69423	69432	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017347	TTTTA	2	10	69589	69598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017347	AAAGT	2	10	70821	70830	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017347	TGTAA	2	10	71276	71285	40 %	40 %	20 %	0 %	384868651
68	NC_017347	GTTGT	2	10	72614	72623	0 %	60 %	40 %	0 %	384868653
69	NC_017347	ATTTA	2	10	74596	74605	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017347	AACAA	2	10	75188	75197	80 %	0 %	0 %	20 %	384868656
71	NC_017347	TTTTA	2	10	75549	75558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017347	ATTCA	2	10	78285	78294	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017347	AACGA	2	10	78882	78891	60 %	0 %	20 %	20 %	384868661
74	NC_017347	AACAG	2	10	79012	79021	60 %	0 %	20 %	20 %	384868661
75	NC_017347	GACTT	2	10	79807	79816	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017347	TATAT	2	10	79878	79887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017347	CAAAA	2	10	81550	81559	80 %	0 %	0 %	20 %	384868663
78	NC_017347	AAATG	2	10	83684	83693	60 %	20 %	20 %	0 %	384868663
79	NC_017347	GATAT	2	10	86267	86276	40 %	40 %	20 %	0 %	384868666
80	NC_017347	ATTGC	2	10	87205	87214	20 %	40 %	20 %	20 %	384868667
81	NC_017347	TCATT	2	10	87393	87402	20 %	60 %	0 %	20 %	384868667
82	NC_017347	CATGG	2	10	88609	88618	20 %	20 %	40 %	20 %	384868667
83	NC_017347	TCAAT	2	10	89649	89658	40 %	40 %	0 %	20 %	384868668
84	NC_017347	GTATT	2	10	90138	90147	20 %	60 %	20 %	0 %	384868669
85	NC_017347	GTAAT	2	10	96017	96026	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017347	CAATT	2	10	96449	96458	40 %	40 %	0 %	20 %	384868673
87	NC_017347	ATGTT	2	10	97283	97292	20 %	60 %	20 %	0 %	384868674
88	NC_017347	TTGCG	2	10	97854	97863	0 %	40 %	40 %	20 %	384868674
89	NC_017347	AGTTA	2	10	99294	99303	40 %	40 %	20 %	0 %	384868675
90	NC_017347	TAAAA	2	10	100106	100115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017347	AGATG	2	10	102492	102501	40 %	20 %	40 %	0 %	384868677
92	NC_017347	GGTGA	2	10	103088	103097	20 %	20 %	60 %	0 %	384868678
93	NC_017347	GAAAA	2	10	106525	106534	80 %	0 %	20 %	0 %	384868681
94	NC_017347	AATCA	2	10	109714	109723	60 %	20 %	0 %	20 %	384868683
95	NC_017347	ATTTT	2	10	110412	110421	20 %	80 %	0 %	0 %	384868684
96	NC_017347	ATCAA	2	10	110439	110448	60 %	20 %	0 %	20 %	384868684
97	NC_017347	ATCAC	2	10	111672	111681	40 %	20 %	0 %	40 %	384868685
98	NC_017347	AACGA	2	10	112349	112358	60 %	0 %	20 %	20 %	384868685
99	NC_017347	ACACA	2	10	114405	114414	60 %	0 %	0 %	40 %	384868687
100	NC_017347	GACAA	2	10	115556	115565	60 %	0 %	20 %	20 %	384868688
101	NC_017347	ATTAC	2	10	117739	117748	40 %	40 %	0 %	20 %	384868691
102	NC_017347	ATTTT	2	10	118042	118051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017347	TATCT	2	10	118398	118407	20 %	60 %	0 %	20 %	384868692
104	NC_017347	ATACG	2	10	120828	120837	40 %	20 %	20 %	20 %	384868694
105	NC_017347	TTATA	2	10	121486	121495	40 %	60 %	0 %	0 %	384868695
106	NC_017347	TATAA	2	10	121856	121865	60 %	40 %	0 %	0 %	384868695
107	NC_017347	TTTTA	2	10	122284	122293	20 %	80 %	0 %	0 %	384868695
108	NC_017347	TCAAC	2	10	122999	123008	40 %	20 %	0 %	40 %	384868696
109	NC_017347	AATAA	2	10	123390	123399	80 %	20 %	0 %	0 %	384868696
110	NC_017347	TACGC	2	10	123657	123666	20 %	20 %	20 %	40 %	384868696
111	NC_017347	TCCCT	2	10	126316	126325	0 %	40 %	0 %	60 %	384868699
112	NC_017347	GCTTT	2	10	128550	128559	0 %	60 %	20 %	20 %	384868701
113	NC_017347	TAATT	2	10	128635	128644	40 %	60 %	0 %	0 %	384868701
114	NC_017347	ATACT	2	10	129816	129825	40 %	40 %	0 %	20 %	384868703
115	NC_017347	TAATA	2	10	130981	130990	60 %	40 %	0 %	0 %	384868704
116	NC_017347	ATTTT	2	10	131972	131981	20 %	80 %	0 %	0 %	384868705
117	NC_017347	ATTTG	2	10	133284	133293	20 %	60 %	20 %	0 %	384868706
118	NC_017347	TTGTA	2	10	134196	134205	20 %	60 %	20 %	0 %	384868707
119	NC_017347	TGCAA	2	10	135201	135210	40 %	20 %	20 %	20 %	384868708
120	NC_017347	ATATG	2	10	137219	137228	40 %	40 %	20 %	0 %	384868709
121	NC_017347	TATGA	2	10	138898	138907	40 %	40 %	20 %	0 %	384868710
122	NC_017347	AATAT	2	10	139905	139914	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017347	CGAAC	2	10	141893	141902	40 %	0 %	20 %	40 %	384868711
124	NC_017347	TTCAA	2	10	143920	143929	40 %	40 %	0 %	20 %	384868712
125	NC_017347	ACATC	2	10	144763	144772	40 %	20 %	0 %	40 %	384868714
126	NC_017347	TTAAG	2	10	146994	147003	40 %	40 %	20 %	0 %	384868715
127	NC_017347	GTAAT	2	10	147736	147745	40 %	40 %	20 %	0 %	384868716
128	NC_017347	AGAGA	2	10	150012	150021	60 %	0 %	40 %	0 %	384868718
129	NC_017347	AATCC	2	10	150368	150377	40 %	20 %	0 %	40 %	384868718
130	NC_017347	TTGGA	2	10	153397	153406	20 %	40 %	40 %	0 %	384868721
131	NC_017347	TTATT	2	10	153812	153821	20 %	80 %	0 %	0 %	384868722
132	NC_017347	ATTTT	2	10	153878	153887	20 %	80 %	0 %	0 %	384868722
133	NC_017347	TATGG	2	10	154279	154288	20 %	40 %	40 %	0 %	384868722
134	NC_017347	ATCGT	2	10	154720	154729	20 %	40 %	20 %	20 %	384868722
135	NC_017347	TGAAT	2	10	159306	159315	40 %	40 %	20 %	0 %	384868727
136	NC_017347	CAAAA	2	10	160690	160699	80 %	0 %	0 %	20 %	384868729
137	NC_017347	AAAGC	2	10	163152	163161	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017347	TTATT	2	10	164909	164918	20 %	80 %	0 %	0 %	384868733
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