MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus T0131 chromosome

Total Repeats: 44645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017347	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017347	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017347	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017347	GTT	2	6	411	416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017347	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017347	GTT	2	6	466	471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017347	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868589
8	NC_017347	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868589
9	NC_017347	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868589
10	NC_017347	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868589
11	NC_017347	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
12	NC_017347	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868589
13	NC_017347	CAA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868589
14	NC_017347	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868589
15	NC_017347	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868589
16	NC_017347	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868589
17	NC_017347	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868589
18	NC_017347	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868589
19	NC_017347	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868589
20	NC_017347	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868589
21	NC_017347	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
22	NC_017347	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
23	NC_017347	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868589
24	NC_017347	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868589
25	NC_017347	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
26	NC_017347	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
27	NC_017347	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868589
28	NC_017347	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868589
29	NC_017347	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868589
30	NC_017347	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
31	NC_017347	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868589
32	NC_017347	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
33	NC_017347	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
34	NC_017347	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017347	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017347	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017347	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
38	NC_017347	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
39	NC_017347	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868590
40	NC_017347	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868590
41	NC_017347	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868590
42	NC_017347	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
43	NC_017347	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868590
44	NC_017347	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868590
45	NC_017347	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868590
46	NC_017347	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868590
47	NC_017347	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
48	NC_017347	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868590
49	NC_017347	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
50	NC_017347	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868590
51	NC_017347	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
52	NC_017347	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868590
53	NC_017347	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868590
54	NC_017347	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868590
55	NC_017347	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868590
56	NC_017347	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868590
57	NC_017347	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868590
58	NC_017347	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868590
59	NC_017347	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868590
60	NC_017347	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017347	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017347	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017347	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868591
64	NC_017347	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868591
65	NC_017347	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868591
66	NC_017347	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868591
67	NC_017347	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868592
68	NC_017347	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868592
69	NC_017347	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868592
70	NC_017347	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384868592
71	NC_017347	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868592
72	NC_017347	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868592
73	NC_017347	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868592
74	NC_017347	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868592
75	NC_017347	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868592
76	NC_017347	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868592
77	NC_017347	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868592
78	NC_017347	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868592
79	NC_017347	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868592
80	NC_017347	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868592
81	NC_017347	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868592
82	NC_017347	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868593
83	NC_017347	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868593
84	NC_017347	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868593
85	NC_017347	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868593
86	NC_017347	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384868593
87	NC_017347	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868593
88	NC_017347	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868593
89	NC_017347	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868593
90	NC_017347	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868593
91	NC_017347	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868593
92	NC_017347	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868593
93	NC_017347	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868593
94	NC_017347	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868593
95	NC_017347	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868593
96	NC_017347	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868593
97	NC_017347	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868593
98	NC_017347	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868593
99	NC_017347	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868593
100	NC_017347	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384868593
101	NC_017347	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868593
102	NC_017347	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868593
103	NC_017347	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868593
104	NC_017347	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868593
105	NC_017347	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868593
106	NC_017347	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868593
107	NC_017347	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868593
108	NC_017347	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868593
109	NC_017347	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017347	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868594
111	NC_017347	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868594
112	NC_017347	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868594
113	NC_017347	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868594
114	NC_017347	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868594
115	NC_017347	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868594
116	NC_017347	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868594
117	NC_017347	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868594
118	NC_017347	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868594
119	NC_017347	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868594
120	NC_017347	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868594
121	NC_017347	AAG	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868594
122	NC_017347	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868594
123	NC_017347	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868594
124	NC_017347	AGA	2	6	8094	8099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868594
125	NC_017347	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868594
126	NC_017347	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868594
127	NC_017347	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868594
128	NC_017347	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868594
129	NC_017347	TTA	2	6	8397	8402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868594
130	NC_017347	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868594
131	NC_017347	TCG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868594
132	NC_017347	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868594
133	NC_017347	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868594
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