MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 plasmid unnamed

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017345	ATTTTA	2	12	1121	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017345	TAAAAA	2	12	2410	2421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017345	TGACGA	2	12	3023	3034	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384868562
4	NC_017345	AAAATT	2	12	5135	5146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
5	NC_017345	TTTATT	2	12	8136	8147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017345	AGAAAA	2	12	8666	8677	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384868572
7	NC_017345	ATTTCA	2	12	9859	9870	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017345	CTAAAT	2	12	10732	10743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384868574
9	NC_017345	AAAATT	2	12	10952	10963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868574
10	NC_017345	CAAAAA	2	12	12543	12554	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384868576
11	NC_017345	AAATAA	2	12	13216	13227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384868576
12	NC_017345	CAGCTT	2	12	13568	13579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384868577
13	NC_017345	TCTTTT	2	12	14457	14468	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384868578
14	NC_017345	TTGAAG	2	12	15746	15757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868579
15	NC_017345	CAATTA	2	12	15911	15922	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384868579
16	NC_017345	ATTATA	2	12	17054	17065	50 %	50 %	0 %	0 %	384868580
17	NC_017345	ACAGGT	2	12	17626	17637	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384868580
18	NC_017345	TCGTGG	2	12	19810	19821	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384868583
19	NC_017345	AAAATC	2	12	22730	22741	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384868586

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.