MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 plasmid unnamed

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017345	TAATT	2	10	3155	3164	40 %	60 %	0 %	0 %	384868562
2	NC_017345	TTTTC	2	10	4322	4331	0 %	80 %	0 %	20 %	384868564
3	NC_017345	TTAGA	2	10	4448	4457	40 %	40 %	20 %	0 %	384868564
4	NC_017345	ATCAC	2	10	4925	4934	40 %	20 %	0 %	40 %	384868565
5	NC_017345	TTTAA	2	10	6295	6304	40 %	60 %	0 %	0 %	384868568
6	NC_017345	ATATT	2	10	6843	6852	40 %	60 %	0 %	0 %	384868570
7	NC_017345	ATTGA	2	10	6933	6942	40 %	40 %	20 %	0 %	384868570
8	NC_017345	CTTTT	2	10	7562	7571	0 %	80 %	0 %	20 %	384868570
9	NC_017345	AAGTA	2	10	10892	10901	60 %	20 %	20 %	0 %	384868574
10	NC_017345	AAAAT	2	10	11466	11475	80 %	20 %	0 %	0 %	384868576
11	NC_017345	TTTAT	2	10	12053	12062	20 %	80 %	0 %	0 %	384868576
12	NC_017345	TGTTT	2	10	13377	13386	0 %	80 %	20 %	0 %	384868577
13	NC_017345	TAATT	2	10	15457	15466	40 %	60 %	0 %	0 %	384868579
14	NC_017345	CATAA	2	10	16282	16291	60 %	20 %	0 %	20 %	384868580
15	NC_017345	GATAC	2	10	16486	16495	40 %	20 %	20 %	20 %	384868580
16	NC_017345	ACTCA	2	10	17413	17422	40 %	20 %	0 %	40 %	384868580
17	NC_017345	AATTA	2	10	17426	17435	60 %	40 %	0 %	0 %	384868580
18	NC_017345	AATAT	2	10	17843	17852	60 %	40 %	0 %	0 %	384868581
19	NC_017345	TAATT	2	10	18792	18801	40 %	60 %	0 %	0 %	384868582
20	NC_017345	GATTT	2	10	21058	21067	20 %	60 %	20 %	0 %	384868584
21	NC_017345	TAGTT	2	10	21230	21239	20 %	60 %	20 %	0 %	384868584
22	NC_017345	TTTGT	2	10	22275	22284	0 %	80 %	20 %	0 %	384868585
23	NC_017345	GTAAA	2	10	22694	22703	60 %	20 %	20 %	0 %	384868586

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.