MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 plasmid unnamed

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017345	ATT	2	6	25	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017345	AAT	3	9	124	132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017345	ATA	2	6	176	181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017345	TAA	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017345	ATA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017345	ATT	2	6	277	282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017345	TAA	2	6	361	366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017345	TAT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017345	TAA	2	6	417	422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017345	ACA	2	6	438	443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017345	GAA	2	6	530	535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017345	CCA	2	6	638	643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017345	GTG	2	6	670	675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017345	CAT	2	6	820	825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017345	CGT	2	6	1035	1040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017345	TAA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017345	TCA	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017345	AAC	2	6	1375	1380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017345	ACC	2	6	1415	1420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017345	GGT	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017345	TTC	3	9	1486	1494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017345	ATA	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017345	ATA	2	6	1631	1636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017345	ATG	2	6	1657	1662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
25	NC_017345	GAT	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
26	NC_017345	ATT	2	6	1827	1832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868561
27	NC_017345	TAA	2	6	1955	1960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
28	NC_017345	TAA	2	6	1967	1972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
29	NC_017345	TAA	2	6	2107	2112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
30	NC_017345	TTC	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868561
31	NC_017345	TTG	2	6	2180	2185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868561
32	NC_017345	ATG	2	6	2187	2192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
33	NC_017345	TAG	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
34	NC_017345	AAT	2	6	2309	2314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
35	NC_017345	TAT	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017345	GAA	2	6	2583	2588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
37	NC_017345	CAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868562
38	NC_017345	TTG	2	6	2737	2742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868562
39	NC_017345	TAA	2	6	2771	2776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868562
40	NC_017345	AAG	2	6	2863	2868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
41	NC_017345	TGT	2	6	2915	2920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868562
42	NC_017345	TGG	2	6	3098	3103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868562
43	NC_017345	TGA	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868562
44	NC_017345	GAA	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
45	NC_017345	ATT	3	9	3247	3255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868562
46	NC_017345	TGA	2	6	3267	3272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017345	TAT	2	6	3427	3432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017345	ATT	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868563
49	NC_017345	GAC	2	6	3977	3982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868563
50	NC_017345	GAA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017345	CAT	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017345	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868564
53	NC_017345	TAT	2	6	4379	4384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868564
54	NC_017345	TAG	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868564
55	NC_017345	TAT	2	6	4412	4417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868564
56	NC_017345	TAA	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
57	NC_017345	AAT	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
58	NC_017345	ATG	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868565
59	NC_017345	TCT	2	6	4790	4795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868565
60	NC_017345	ATA	2	6	4806	4811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
61	NC_017345	TCT	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868565
62	NC_017345	ATC	2	6	4873	4878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868565
63	NC_017345	AAT	3	9	5014	5022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
64	NC_017345	AAT	2	6	5044	5049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
65	NC_017345	CAA	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868566
66	NC_017345	AAG	2	6	5129	5134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868566
67	NC_017345	ATC	2	6	5323	5328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868566
68	NC_017345	ATA	2	6	5444	5449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
69	NC_017345	TAA	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
70	NC_017345	TAA	2	6	5530	5535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
71	NC_017345	CTG	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868566
72	NC_017345	CAG	3	9	5562	5570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868566
73	NC_017345	CAA	2	6	5571	5576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868566
74	NC_017345	TAT	2	6	5622	5627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017345	AAT	2	6	5642	5647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017345	TTC	2	6	5777	5782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017345	TTA	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868567
78	NC_017345	ATA	2	6	6532	6537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868569
79	NC_017345	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868569
80	NC_017345	TCA	2	6	6608	6613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868569
81	NC_017345	CCA	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868569
82	NC_017345	CGT	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017345	GAT	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017345	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868570
85	NC_017345	TTC	2	6	6890	6895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868570
86	NC_017345	AAG	2	6	7000	7005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868570
87	NC_017345	TAA	2	6	7127	7132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868570
88	NC_017345	ATC	2	6	7178	7183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868570
89	NC_017345	ATT	2	6	7259	7264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868570
90	NC_017345	TCT	2	6	7425	7430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868570
91	NC_017345	CGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868570
92	NC_017345	TCA	2	6	7632	7637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868570
93	NC_017345	TAA	2	6	7844	7849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017345	ATT	2	6	7905	7910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017345	TTA	2	6	7964	7969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017345	AGT	2	6	7989	7994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017345	TAT	2	6	8018	8023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017345	ATC	2	6	8092	8097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017345	TAT	2	6	8160	8165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017345	TGA	2	6	8223	8228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017345	GAA	2	6	8254	8259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868571
102	NC_017345	TAA	2	6	8286	8291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868571
103	NC_017345	AGA	2	6	8346	8351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868571
104	NC_017345	TAC	2	6	8415	8420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868571
105	NC_017345	ATA	2	6	8446	8451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868571
106	NC_017345	TAG	2	6	8482	8487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868571
107	NC_017345	AAT	2	6	8517	8522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017345	GTC	2	6	8542	8547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017345	ACA	2	6	8553	8558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017345	TAA	2	6	8633	8638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868572
111	NC_017345	CTA	2	6	8704	8709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868572
112	NC_017345	TAC	2	6	8747	8752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868572
113	NC_017345	GAA	2	6	8781	8786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868572
114	NC_017345	CGA	2	6	8834	8839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868572
115	NC_017345	GAA	2	6	8853	8858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868572
116	NC_017345	AGA	2	6	8867	8872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868572
117	NC_017345	AGA	2	6	8909	8914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868572
118	NC_017345	GAA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868572
119	NC_017345	AAT	2	6	8973	8978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017345	ATC	2	6	9039	9044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017345	TAA	2	6	9057	9062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017345	AGG	2	6	9064	9069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017345	TAT	2	6	9072	9077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017345	ATT	2	6	9274	9279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017345	CAA	2	6	9287	9292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017345	CTT	2	6	9366	9371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017345	CTT	2	6	9390	9395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017345	CAT	2	6	9412	9417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017345	GTC	2	6	9515	9520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017345	CAT	2	6	9584	9589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017345	ACA	2	6	9591	9596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017345	GAC	2	6	9664	9669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017345	CCA	2	6	9931	9936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868573
134	NC_017345	GTT	2	6	9973	9978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868573
135	NC_017345	CTA	2	6	10252	10257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017345	ACT	2	6	10260	10265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017345	TAA	2	6	10266	10271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017345	TAT	2	6	10277	10282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.