MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 plasmid unnamed

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017345	ATG	2	6	1657	1662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
2	NC_017345	GAT	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
3	NC_017345	ATT	2	6	1827	1832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868561
4	NC_017345	TAA	2	6	1955	1960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
5	NC_017345	TAA	2	6	1967	1972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
6	NC_017345	TAA	2	6	2107	2112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
7	NC_017345	TTC	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868561
8	NC_017345	TTG	2	6	2180	2185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868561
9	NC_017345	ATG	2	6	2187	2192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
10	NC_017345	TAG	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868561
11	NC_017345	AAT	2	6	2309	2314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868561
12	NC_017345	GAA	2	6	2583	2588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
13	NC_017345	CAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868562
14	NC_017345	TTG	2	6	2737	2742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868562
15	NC_017345	TAA	2	6	2771	2776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868562
16	NC_017345	AAG	2	6	2863	2868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
17	NC_017345	TGT	2	6	2915	2920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868562
18	NC_017345	TGG	2	6	3098	3103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868562
19	NC_017345	TGA	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868562
20	NC_017345	GAA	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868562
21	NC_017345	ATT	3	9	3247	3255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868562
22	NC_017345	ATT	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868563
23	NC_017345	GAC	2	6	3977	3982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868563
24	NC_017345	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868564
25	NC_017345	TAT	2	6	4379	4384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868564
26	NC_017345	TAG	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868564
27	NC_017345	TAT	2	6	4412	4417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868564
28	NC_017345	TAA	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
29	NC_017345	AAT	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
30	NC_017345	ATG	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868565
31	NC_017345	TCT	2	6	4790	4795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868565
32	NC_017345	ATA	2	6	4806	4811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868565
33	NC_017345	TCT	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868565
34	NC_017345	ATC	2	6	4873	4878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868565
35	NC_017345	AAT	3	9	5014	5022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
36	NC_017345	AAT	2	6	5044	5049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
37	NC_017345	CAA	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868566
38	NC_017345	AAG	2	6	5129	5134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868566
39	NC_017345	ATC	2	6	5323	5328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868566
40	NC_017345	ATA	2	6	5444	5449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
41	NC_017345	TAA	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
42	NC_017345	TAA	2	6	5530	5535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868566
43	NC_017345	CTG	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868566
44	NC_017345	CAG	3	9	5562	5570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868566
45	NC_017345	CAA	2	6	5571	5576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868566
46	NC_017345	TTA	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868567
47	NC_017345	ATA	2	6	6532	6537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868569
48	NC_017345	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868569
49	NC_017345	TCA	2	6	6608	6613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868569
50	NC_017345	CCA	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868569
51	NC_017345	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868570
52	NC_017345	TTC	2	6	6890	6895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868570
53	NC_017345	AAG	2	6	7000	7005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868570
54	NC_017345	TAA	2	6	7127	7132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868570
55	NC_017345	ATC	2	6	7178	7183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868570
56	NC_017345	ATT	2	6	7259	7264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868570
57	NC_017345	TCT	2	6	7425	7430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868570
58	NC_017345	CGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868570
59	NC_017345	TCA	2	6	7632	7637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868570
60	NC_017345	GAA	2	6	8254	8259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868571
61	NC_017345	TAA	2	6	8286	8291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868571
62	NC_017345	AGA	2	6	8346	8351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868571
63	NC_017345	TAC	2	6	8415	8420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868571
64	NC_017345	ATA	2	6	8446	8451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868571
65	NC_017345	TAG	2	6	8482	8487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868571
66	NC_017345	TAA	2	6	8633	8638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868572
67	NC_017345	CTA	2	6	8704	8709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868572
68	NC_017345	TAC	2	6	8747	8752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868572
69	NC_017345	GAA	2	6	8781	8786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868572
70	NC_017345	CGA	2	6	8834	8839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868572
71	NC_017345	GAA	2	6	8853	8858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868572
72	NC_017345	AGA	2	6	8867	8872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868572
73	NC_017345	AGA	2	6	8909	8914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868572
74	NC_017345	GAA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868572
75	NC_017345	CCA	2	6	9931	9936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868573
76	NC_017345	GTT	2	6	9973	9978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868573
77	NC_017345	TCA	2	6	10485	10490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868574
78	NC_017345	TAA	3	9	10499	10507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868574
79	NC_017345	TCA	2	6	10554	10559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868574
80	NC_017345	CAC	3	9	10618	10626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868574
81	NC_017345	CTT	2	6	10681	10686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868574
82	NC_017345	ATG	2	6	11300	11305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868575
83	NC_017345	AAT	2	6	11326	11331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868575
84	NC_017345	AAT	2	6	11422	11427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868576
85	NC_017345	TAT	2	6	11440	11445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868576
86	NC_017345	AGT	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868576
87	NC_017345	ATA	2	6	11495	11500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868576
88	NC_017345	CTG	2	6	11537	11542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868576
89	NC_017345	AAT	2	6	11543	11548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868576
90	NC_017345	TAA	2	6	11569	11574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868576
91	NC_017345	TTA	2	6	11667	11672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868576
92	NC_017345	TCT	2	6	11741	11746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868576
93	NC_017345	CAG	2	6	11817	11822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868576
94	NC_017345	CAA	2	6	11857	11862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868576
95	NC_017345	TTG	2	6	11968	11973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868576
96	NC_017345	GGA	2	6	12038	12043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384868576
97	NC_017345	ATT	2	6	12163	12168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868576
98	NC_017345	TAT	3	9	12186	12194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868576
99	NC_017345	TCC	2	6	12208	12213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384868576
100	NC_017345	GTT	2	6	12216	12221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868576
101	NC_017345	TCT	2	6	12269	12274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868576
102	NC_017345	AGA	2	6	12500	12505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868576
103	NC_017345	CAA	2	6	12523	12528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868576
104	NC_017345	GTA	2	6	12530	12535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868576
105	NC_017345	GAT	2	6	12664	12669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868576
106	NC_017345	AAT	2	6	12691	12696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868576
107	NC_017345	ATG	2	6	12745	12750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868576
108	NC_017345	ATA	2	6	12780	12785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868576
109	NC_017345	TAA	2	6	12808	12813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868576
110	NC_017345	AAT	2	6	12931	12936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868576
111	NC_017345	ATA	2	6	12937	12942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868576
112	NC_017345	TAA	2	6	12964	12969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868576
113	NC_017345	TTA	2	6	12995	13000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868576
114	NC_017345	ATT	2	6	13015	13020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868576
115	NC_017345	TAT	2	6	13053	13058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868576
116	NC_017345	ATT	2	6	13079	13084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868576
117	NC_017345	GAA	2	6	13210	13215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868576
118	NC_017345	AAT	2	6	13265	13270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868576
119	NC_017345	CTG	2	6	13466	13471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868577
120	NC_017345	TAT	2	6	13490	13495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868577
121	NC_017345	ACC	2	6	13545	13550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868577
122	NC_017345	TAA	2	6	13593	13598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868577
123	NC_017345	CTT	2	6	14188	14193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868578
124	NC_017345	GAT	2	6	14212	14217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868578
125	NC_017345	TAA	2	6	14396	14401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868578
126	NC_017345	AAT	2	6	14470	14475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868578
127	NC_017345	AAT	2	6	14486	14491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868578
128	NC_017345	TCA	2	6	14493	14498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868578
129	NC_017345	CTT	2	6	14566	14571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868578
130	NC_017345	CAT	2	6	15230	15235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868579
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.