MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 plasmid unnamed

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017345	TA	3	6	37	42	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017345	TC	3	6	564	569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017345	TA	3	6	794	799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017345	AT	4	8	861	868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017345	TA	3	6	1718	1723	50 %	50 %	0 %	0 %	384868561
6	NC_017345	TC	3	6	2209	2214	0 %	50 %	0 %	50 %	384868561
7	NC_017345	AT	3	6	2225	2230	50 %	50 %	0 %	0 %	384868561
8	NC_017345	TA	3	6	2853	2858	50 %	50 %	0 %	0 %	384868562
9	NC_017345	AT	3	6	3645	3650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017345	TA	3	6	4170	4175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017345	TC	3	6	4330	4335	0 %	50 %	0 %	50 %	384868564
12	NC_017345	TA	3	6	4575	4580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017345	CT	3	6	4636	4641	0 %	50 %	0 %	50 %	384868565
14	NC_017345	TA	3	6	4710	4715	50 %	50 %	0 %	0 %	384868565
15	NC_017345	AC	3	6	4778	4783	50 %	0 %	0 %	50 %	384868565
16	NC_017345	TA	3	6	5038	5043	50 %	50 %	0 %	0 %	384868566
17	NC_017345	CT	3	6	5304	5309	0 %	50 %	0 %	50 %	384868566
18	NC_017345	AT	3	6	5854	5859	50 %	50 %	0 %	0 %	384868567
19	NC_017345	TC	3	6	5977	5982	0 %	50 %	0 %	50 %	384868567
20	NC_017345	AT	3	6	6132	6137	50 %	50 %	0 %	0 %	384868568
21	NC_017345	TA	3	6	7914	7919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017345	TA	3	6	7937	7942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017345	AG	3	6	8627	8632	50 %	0 %	50 %	0 %	384868572
24	NC_017345	AT	3	6	8815	8820	50 %	50 %	0 %	0 %	384868572
25	NC_017345	TA	3	6	9017	9022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017345	TA	4	8	9119	9126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017345	GA	3	6	9492	9497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017345	TC	3	6	9523	9528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017345	AG	3	6	9546	9551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017345	TA	3	6	9755	9760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017345	CT	3	6	9979	9984	0 %	50 %	0 %	50 %	384868573
32	NC_017345	AT	3	6	10143	10148	50 %	50 %	0 %	0 %	384868573
33	NC_017345	TC	3	6	10181	10186	0 %	50 %	0 %	50 %	384868573
34	NC_017345	AT	4	8	10845	10852	50 %	50 %	0 %	0 %	384868574
35	NC_017345	AT	4	8	12346	12353	50 %	50 %	0 %	0 %	384868576
36	NC_017345	AT	3	6	12621	12626	50 %	50 %	0 %	0 %	384868576
37	NC_017345	TC	3	6	12954	12959	0 %	50 %	0 %	50 %	384868576
38	NC_017345	TA	4	8	13767	13774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017345	AC	3	6	13833	13838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017345	CT	3	6	14000	14005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017345	CT	3	6	14013	14018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017345	AT	3	6	14050	14055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017345	TA	3	6	14275	14280	50 %	50 %	0 %	0 %	384868578
44	NC_017345	TC	3	6	14336	14341	0 %	50 %	0 %	50 %	384868578
45	NC_017345	TG	3	6	14782	14787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017345	AT	3	6	14809	14814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017345	TA	3	6	14933	14938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017345	TC	3	6	16211	16216	0 %	50 %	0 %	50 %	384868580
49	NC_017345	AT	3	6	16578	16583	50 %	50 %	0 %	0 %	384868580
50	NC_017345	AT	3	6	16635	16640	50 %	50 %	0 %	0 %	384868580
51	NC_017345	AT	3	6	16880	16885	50 %	50 %	0 %	0 %	384868580
52	NC_017345	TA	3	6	17949	17954	50 %	50 %	0 %	0 %	384868581
53	NC_017345	AT	3	6	18256	18261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017345	TA	3	6	18420	18425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017345	GA	3	6	18682	18687	50 %	0 %	50 %	0 %	384868582
56	NC_017345	TC	3	6	19410	19415	0 %	50 %	0 %	50 %	384868583
57	NC_017345	GT	3	6	19691	19696	0 %	50 %	50 %	0 %	384868583
58	NC_017345	AT	3	6	19879	19884	50 %	50 %	0 %	0 %	384868583
59	NC_017345	GT	3	6	20214	20219	0 %	50 %	50 %	0 %	384868583
60	NC_017345	TA	3	6	20722	20727	50 %	50 %	0 %	0 %	384868584
61	NC_017345	AT	3	6	20819	20824	50 %	50 %	0 %	0 %	384868584
62	NC_017345	AT	3	6	21028	21033	50 %	50 %	0 %	0 %	384868584
63	NC_017345	AT	3	6	21320	21325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017345	AT	3	6	21723	21728	50 %	50 %	0 %	0 %	384868585
65	NC_017345	TA	3	6	22290	22295	50 %	50 %	0 %	0 %	384868585
66	NC_017345	AT	3	6	22477	22482	50 %	50 %	0 %	0 %	384868585
67	NC_017345	AT	3	6	22678	22683	50 %	50 %	0 %	0 %	384868586
68	NC_017345	AT	3	6	22971	22976	50 %	50 %	0 %	0 %	384868586
69	NC_017345	TA	3	6	23203	23208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017345	CT	3	6	23407	23412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017345	GA	3	6	23429	23434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017345	TA	3	6	23504	23509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017345	AT	3	6	23679	23684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017345	TC	3	6	23719	23724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017345	AT	3	6	24304	24309	50 %	50 %	0 %	0 %	384868587

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.