MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2 plasmid pLUH02

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017344	TTTTC	2	10	1099	1108	0 %	80 %	0 %	20 %	384863364
2	NC_017344	TTAGA	2	10	1225	1234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017344	ATTTT	2	10	1271	1280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017344	CAAGA	2	10	1362	1371	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017344	ATCAC	2	10	1702	1711	40 %	20 %	0 %	40 %	384863365
6	NC_017344	AAAAT	2	10	3537	3546	80 %	20 %	0 %	0 %	384863369
7	NC_017344	ATATT	2	10	3995	4004	40 %	60 %	0 %	0 %	384863371
8	NC_017344	TAATT	2	10	6841	6850	40 %	60 %	0 %	0 %	384863374
9	NC_017344	ATTTG	2	10	8704	8713	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017344	TACCT	2	10	11926	11935	20 %	40 %	0 %	40 %	384863377
11	NC_017344	TGCAT	2	10	12340	12349	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017344	TTGAA	2	10	13164	13173	40 %	40 %	20 %	0 %	384863378
13	NC_017344	ATTTT	2	10	13933	13942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017344	CTATA	2	10	13954	13963	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017344	TATAG	2	10	13982	13991	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017344	AAAGA	2	10	14446	14455	80 %	0 %	20 %	0 %	384863380
17	NC_017344	AAATC	2	10	15797	15806	60 %	20 %	0 %	20 %	384863381
18	NC_017344	GCTGT	2	10	16354	16363	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017344	CTTTT	2	10	16992	17001	0 %	80 %	0 %	20 %	384863382
20	NC_017344	ATGAT	2	10	17621	17630	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017344	AGAAA	2	10	17981	17990	80 %	0 %	20 %	0 %	384863384
22	NC_017344	TAGCT	2	10	18145	18154	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017344	AAATT	2	10	18276	18285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017344	AAATT	2	10	19395	19404	60 %	40 %	0 %	0 %	384863386
25	NC_017344	ATATT	2	10	20345	20354	40 %	60 %	0 %	0 %	384863387
26	NC_017344	TAATT	2	10	20762	20771	40 %	60 %	0 %	0 %	384863388
27	NC_017344	TTGAG	2	10	20774	20783	20 %	40 %	40 %	0 %	384863388
28	NC_017344	TATGA	2	10	20935	20944	40 %	40 %	20 %	0 %	384863388
29	NC_017344	GTATC	2	10	21702	21711	20 %	40 %	20 %	20 %	384863388
30	NC_017344	TATTT	2	10	21712	21721	20 %	80 %	0 %	0 %	384863388
31	NC_017344	TTATG	2	10	21906	21915	20 %	60 %	20 %	0 %	384863388
32	NC_017344	AATTA	2	10	22731	22740	60 %	40 %	0 %	0 %	384863389
33	NC_017344	TTTGT	2	10	24343	24352	0 %	80 %	20 %	0 %	384863390
34	NC_017344	GTAAA	2	10	24762	24771	60 %	20 %	20 %	0 %	384863391

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.