MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2 plasmid pLUH02

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017344	TTTTC	2	10	1099	1108	0 %	80 %	0 %	20 %	384863364
2	NC_017344	ATCAC	2	10	1702	1711	40 %	20 %	0 %	40 %	384863365
3	NC_017344	AAAAT	2	10	3537	3546	80 %	20 %	0 %	0 %	384863369
4	NC_017344	ATATT	2	10	3995	4004	40 %	60 %	0 %	0 %	384863371
5	NC_017344	TAATT	2	10	6841	6850	40 %	60 %	0 %	0 %	384863374
6	NC_017344	TACCT	2	10	11926	11935	20 %	40 %	0 %	40 %	384863377
7	NC_017344	TTGAA	2	10	13164	13173	40 %	40 %	20 %	0 %	384863378
8	NC_017344	AAAGA	2	10	14446	14455	80 %	0 %	20 %	0 %	384863380
9	NC_017344	AAATC	2	10	15797	15806	60 %	20 %	0 %	20 %	384863381
10	NC_017344	CTTTT	2	10	16992	17001	0 %	80 %	0 %	20 %	384863382
11	NC_017344	AGAAA	2	10	17981	17990	80 %	0 %	20 %	0 %	384863384
12	NC_017344	AAATT	2	10	19395	19404	60 %	40 %	0 %	0 %	384863386
13	NC_017344	ATATT	2	10	20345	20354	40 %	60 %	0 %	0 %	384863387
14	NC_017344	TAATT	2	10	20762	20771	40 %	60 %	0 %	0 %	384863388
15	NC_017344	TTGAG	2	10	20774	20783	20 %	40 %	40 %	0 %	384863388
16	NC_017344	TATGA	2	10	20935	20944	40 %	40 %	20 %	0 %	384863388
17	NC_017344	GTATC	2	10	21702	21711	20 %	40 %	20 %	20 %	384863388
18	NC_017344	TATTT	2	10	21712	21721	20 %	80 %	0 %	0 %	384863388
19	NC_017344	TTATG	2	10	21906	21915	20 %	60 %	20 %	0 %	384863388
20	NC_017344	AATTA	2	10	22731	22740	60 %	40 %	0 %	0 %	384863389
21	NC_017344	TTTGT	2	10	24343	24352	0 %	80 %	20 %	0 %	384863390
22	NC_017344	GTAAA	2	10	24762	24771	60 %	20 %	20 %	0 %	384863391

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.