MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2 plasmid pLUH02

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017344	AGTA	2	8	1938	1945	50 %	25 %	25 %	0 %	384863366
2	NC_017344	TTCA	2	8	2061	2068	25 %	50 %	0 %	25 %	384863366
3	NC_017344	ACTA	2	8	2205	2212	50 %	25 %	0 %	25 %	384863366
4	NC_017344	AAAT	2	8	2791	2798	75 %	25 %	0 %	0 %	384863368
5	NC_017344	TCAT	2	8	4397	4404	25 %	50 %	0 %	25 %	384863371
6	NC_017344	TCTA	2	8	4750	4757	25 %	50 %	0 %	25 %	384863371
7	NC_017344	CATT	2	8	4760	4767	25 %	50 %	0 %	25 %	384863371
8	NC_017344	TGGA	2	8	4769	4776	25 %	25 %	50 %	0 %	384863371
9	NC_017344	CATA	2	8	4803	4810	50 %	25 %	0 %	25 %	384863371
10	NC_017344	AAAC	2	8	5412	5419	75 %	0 %	0 %	25 %	384863372
11	NC_017344	AATT	2	8	5471	5478	50 %	50 %	0 %	0 %	384863372
12	NC_017344	AAGA	2	8	5523	5530	75 %	0 %	25 %	0 %	384863372
13	NC_017344	TAAA	2	8	5761	5768	75 %	25 %	0 %	0 %	384863372
14	NC_017344	GTTT	2	8	6124	6131	0 %	75 %	25 %	0 %	384863372
15	NC_017344	GTTG	2	8	6308	6315	0 %	50 %	50 %	0 %	384863373
16	NC_017344	AGAA	2	8	6532	6539	75 %	0 %	25 %	0 %	384863373
17	NC_017344	ATTC	2	8	8092	8099	25 %	50 %	0 %	25 %	384863375
18	NC_017344	TTAT	2	8	9571	9578	25 %	75 %	0 %	0 %	384863376
19	NC_017344	TTCA	2	8	9690	9697	25 %	50 %	0 %	25 %	384863376
20	NC_017344	TATG	2	8	9711	9718	25 %	50 %	25 %	0 %	384863376
21	NC_017344	AATT	2	8	9851	9858	50 %	50 %	0 %	0 %	384863376
22	NC_017344	TTTA	2	8	10046	10053	25 %	75 %	0 %	0 %	384863376
23	NC_017344	TTTA	2	8	10194	10201	25 %	75 %	0 %	0 %	384863376
24	NC_017344	AAAT	2	8	12787	12794	75 %	25 %	0 %	0 %	384863378
25	NC_017344	CTTG	2	8	12905	12912	0 %	50 %	25 %	25 %	384863378
26	NC_017344	CTAT	2	8	13076	13083	25 %	50 %	0 %	25 %	384863378
27	NC_017344	TTCT	2	8	13351	13358	0 %	75 %	0 %	25 %	384863378
28	NC_017344	TTAG	2	8	14101	14108	25 %	50 %	25 %	0 %	384863379
29	NC_017344	ATGT	2	8	14739	14746	25 %	50 %	25 %	0 %	384863380
30	NC_017344	GTTA	2	8	15004	15011	25 %	50 %	25 %	0 %	384863380
31	NC_017344	ATTT	2	8	15014	15021	25 %	75 %	0 %	0 %	384863380
32	NC_017344	ATTC	2	8	15659	15666	25 %	50 %	0 %	25 %	384863381
33	NC_017344	TTTA	2	8	16017	16024	25 %	75 %	0 %	0 %	384863381
34	NC_017344	CATT	2	8	16687	16694	25 %	50 %	0 %	25 %	384863382
35	NC_017344	AATT	2	8	16755	16762	50 %	50 %	0 %	0 %	384863382
36	NC_017344	ATTC	2	8	17112	17119	25 %	50 %	0 %	25 %	384863382
37	NC_017344	ATAA	2	8	17468	17475	75 %	25 %	0 %	0 %	384863382
38	NC_017344	TAAC	2	8	17500	17507	50 %	25 %	0 %	25 %	384863382
39	NC_017344	CTGT	2	8	18480	18487	0 %	50 %	25 %	25 %	384863385
40	NC_017344	TTCA	2	8	18760	18767	25 %	50 %	0 %	25 %	384863385
41	NC_017344	TTTA	2	8	19318	19325	25 %	75 %	0 %	0 %	384863386
42	NC_017344	TCTA	2	8	19564	19571	25 %	50 %	0 %	25 %	384863386
43	NC_017344	AAAT	2	8	20200	20207	75 %	25 %	0 %	0 %	384863387
44	NC_017344	TCCA	2	8	20720	20727	25 %	25 %	0 %	50 %	384863388
45	NC_017344	TAAA	2	8	20965	20972	75 %	25 %	0 %	0 %	384863388
46	NC_017344	CTTT	2	8	21008	21015	0 %	75 %	0 %	25 %	384863388
47	NC_017344	TCTT	2	8	21038	21045	0 %	75 %	0 %	25 %	384863388
48	NC_017344	AATT	2	8	21220	21227	50 %	50 %	0 %	0 %	384863388
49	NC_017344	ATTA	2	8	21259	21266	50 %	50 %	0 %	0 %	384863388
50	NC_017344	AATG	2	8	21299	21306	50 %	25 %	25 %	0 %	384863388
51	NC_017344	TCTT	2	8	21441	21448	0 %	75 %	0 %	25 %	384863388
52	NC_017344	ACTT	2	8	21930	21937	25 %	50 %	0 %	25 %	384863388
53	NC_017344	AGCA	2	8	22015	22022	50 %	0 %	25 %	25 %	384863388
54	NC_017344	TAAA	2	8	22500	22507	75 %	25 %	0 %	0 %	384863389
55	NC_017344	TAAA	2	8	22797	22804	75 %	25 %	0 %	0 %	384863389
56	NC_017344	TTAA	2	8	22886	22893	50 %	50 %	0 %	0 %	384863389
57	NC_017344	TAAT	2	8	23448	23455	50 %	50 %	0 %	0 %	384863390
58	NC_017344	TAAA	2	8	23660	23667	75 %	25 %	0 %	0 %	384863390
59	NC_017344	CTTA	2	8	24148	24155	25 %	50 %	0 %	25 %	384863390
60	NC_017344	TTTA	2	8	24163	24170	25 %	75 %	0 %	0 %	384863390
61	NC_017344	TCTT	2	8	24238	24245	0 %	75 %	0 %	25 %	384863390
62	NC_017344	CATA	2	8	24415	24422	50 %	25 %	0 %	25 %	384863390
63	NC_017344	CTTT	3	12	24651	24662	0 %	75 %	0 %	25 %	384863391
64	NC_017344	TAAT	2	8	25156	25163	50 %	50 %	0 %	0 %	384863391
65	NC_017344	TAAA	2	8	25178	25185	75 %	25 %	0 %	0 %	384863391
66	NC_017344	TCTT	2	8	25888	25895	0 %	75 %	0 %	25 %	384863392
67	NC_017344	ATTT	2	8	26690	26697	25 %	75 %	0 %	0 %	384863393
68	NC_017344	TTTA	2	8	26882	26889	25 %	75 %	0 %	0 %	384863393

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.