MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2 plasmid pLUH02

Total Repeats: 402

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017344	CGT	2	6	157	162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017344	ATT	2	6	617	622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017344	GAC	2	6	754	759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017344	GAA	2	6	792	797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017344	CAT	2	6	1008	1013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017344	GTT	2	6	1120	1125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863364
7	NC_017344	TAT	2	6	1156	1161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863364
8	NC_017344	TAG	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863364
9	NC_017344	TAT	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863364
10	NC_017344	TAA	2	6	1433	1438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863365
11	NC_017344	AAT	2	6	1439	1444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863365
12	NC_017344	ATG	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863365
13	NC_017344	TCT	2	6	1567	1572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863365
14	NC_017344	ATA	2	6	1583	1588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863365
15	NC_017344	TCT	2	6	1601	1606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863365
16	NC_017344	ATC	2	6	1650	1655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863365
17	NC_017344	AAT	3	9	1791	1799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863366
18	NC_017344	CAA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863366
19	NC_017344	AAG	2	6	1906	1911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863366
20	NC_017344	ATC	2	6	2100	2105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863366
21	NC_017344	ATA	2	6	2221	2226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863366
22	NC_017344	TAA	2	6	2295	2300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863366
23	NC_017344	TAA	2	6	2307	2312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863366
24	NC_017344	CTG	2	6	2318	2323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384863366
25	NC_017344	CAG	3	9	2339	2347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384863366
26	NC_017344	CAA	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863366
27	NC_017344	ATA	2	6	2365	2370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863366
28	NC_017344	TAT	2	6	2399	2404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017344	AAT	2	6	2419	2424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017344	CTT	2	6	2553	2558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017344	CGT	2	6	2592	2597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017344	TTC	2	6	2631	2636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863367
33	NC_017344	ATC	3	9	2649	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863367
34	NC_017344	CAA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863367
35	NC_017344	AAG	2	6	2719	2724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863367
36	NC_017344	ATT	2	6	2757	2762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863368
37	NC_017344	AAC	2	6	2784	2789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863368
38	NC_017344	CAA	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017344	TCA	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017344	ATT	2	6	3512	3517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863369
41	NC_017344	AAT	2	6	3522	3527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863369
42	NC_017344	TAA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863369
43	NC_017344	ATT	2	6	3600	3605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863369
44	NC_017344	ATA	2	6	3685	3690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863370
45	NC_017344	TCT	2	6	3737	3742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863370
46	NC_017344	TCA	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863370
47	NC_017344	CCA	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384863370
48	NC_017344	CGT	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017344	GAT	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017344	ATT	2	6	3981	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
51	NC_017344	TTC	2	6	4042	4047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863371
52	NC_017344	TCT	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863371
53	NC_017344	ATA	2	6	4174	4179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
54	NC_017344	TAA	2	6	4230	4235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
55	NC_017344	GTT	2	6	4278	4283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863371
56	NC_017344	TTC	2	6	4291	4296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863371
57	NC_017344	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
58	NC_017344	GAT	2	6	4341	4346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863371
59	NC_017344	ATG	2	6	4360	4365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863371
60	NC_017344	ATT	3	9	4366	4374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
61	NC_017344	ATA	2	6	4391	4396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
62	NC_017344	TAT	2	6	4443	4448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
63	NC_017344	TAA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
64	NC_017344	TTA	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
65	NC_017344	TAA	2	6	4639	4644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
66	NC_017344	TTA	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
67	NC_017344	TTA	2	6	4742	4747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
68	NC_017344	TAA	2	6	4795	4800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
69	NC_017344	CTG	2	6	4821	4826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384863371
70	NC_017344	ATA	2	6	4925	4930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
71	NC_017344	TAA	2	6	4961	4966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017344	TTA	2	6	5071	5076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017344	GTA	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017344	GGT	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017344	TGA	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863372
76	NC_017344	TAA	2	6	5426	5431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863372
77	NC_017344	AAT	2	6	5610	5615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863372
78	NC_017344	ATG	2	6	5695	5700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863372
79	NC_017344	AAC	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863372
80	NC_017344	CAA	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863372
81	NC_017344	CAA	2	6	5781	5786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863372
82	NC_017344	TAA	2	6	5804	5809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863372
83	NC_017344	AGA	3	9	5837	5845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863372
84	NC_017344	AAG	2	6	5905	5910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863372
85	NC_017344	GAA	2	6	5922	5927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863372
86	NC_017344	CAA	2	6	5946	5951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863372
87	NC_017344	GAA	2	6	6060	6065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863372
88	NC_017344	GAA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863373
89	NC_017344	AGA	2	6	6394	6399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863373
90	NC_017344	TAA	2	6	6465	6470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863373
91	NC_017344	TGT	2	6	6506	6511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863373
92	NC_017344	CAA	2	6	6577	6582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863373
93	NC_017344	ATC	2	6	6691	6696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017344	ACA	2	6	6872	6877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863374
95	NC_017344	ATT	3	9	6933	6941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863374
96	NC_017344	TGA	2	6	6953	6958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017344	TAA	2	6	7492	7497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017344	TAA	2	6	7591	7596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017344	TTC	2	6	7609	7614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017344	ATT	2	6	7631	7636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017344	AGG	2	6	7650	7655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017344	ATT	2	6	7656	7661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017344	ATA	2	6	7747	7752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863375
104	NC_017344	ATG	2	6	7855	7860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863375
105	NC_017344	TTA	2	6	7863	7868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863375
106	NC_017344	TTA	2	6	7873	7878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863375
107	NC_017344	ATT	2	6	7945	7950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863375
108	NC_017344	AGA	2	6	7967	7972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863375
109	NC_017344	GAA	2	6	8049	8054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863375
110	NC_017344	TAT	2	6	8131	8136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863375
111	NC_017344	TAA	2	6	8228	8233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863375
112	NC_017344	GTT	2	6	8307	8312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863375
113	NC_017344	TAT	2	6	8321	8326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863375
114	NC_017344	AAT	2	6	8342	8347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863375
115	NC_017344	TCT	2	6	8382	8387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017344	TAT	2	6	8417	8422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017344	TAA	2	6	8497	8502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017344	TTA	2	6	8548	8553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017344	TCA	2	6	8608	8613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017344	CTT	2	6	8650	8655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017344	TAT	2	6	8752	8757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017344	ATT	2	6	9198	9203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017344	AAC	2	6	9213	9218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017344	TTA	2	6	9482	9487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863376
125	NC_017344	GAT	2	6	9615	9620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863376
126	NC_017344	TGT	2	6	9722	9727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863376
127	NC_017344	AAT	2	6	9790	9795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863376
128	NC_017344	GTA	2	6	10031	10036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863376
129	NC_017344	ATG	2	6	10320	10325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017344	AGT	2	6	10363	10368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017344	CAA	2	6	10388	10393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017344	TAA	2	6	10403	10408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017344	CTA	2	6	10420	10425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017344	TAG	2	6	10433	10438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017344	TGG	2	6	10441	10446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017344	TTA	2	6	10483	10488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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396	NC_017344	TAT	2	6	26753	26758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863393
397	NC_017344	TAA	2	6	26803	26808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863393
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401	NC_017344	GTG	2	6	27064	27069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
402	NC_017344	CAT	2	6	27214	27219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.