MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2 plasmid pLUH02

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017344	CGT	2	6	157	162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017344	ATT	2	6	617	622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017344	GAC	2	6	754	759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017344	GAA	2	6	792	797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017344	CAT	2	6	1008	1013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017344	TAT	2	6	2399	2404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017344	AAT	2	6	2419	2424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017344	CTT	2	6	2553	2558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017344	CGT	2	6	2592	2597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017344	CAA	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017344	TCA	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017344	CGT	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017344	GAT	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017344	TAA	2	6	4961	4966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017344	TTA	2	6	5071	5076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017344	GTA	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017344	GGT	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017344	ATC	2	6	6691	6696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017344	TGA	2	6	6953	6958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017344	TAA	2	6	7492	7497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017344	TAA	2	6	7591	7596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017344	TTC	2	6	7609	7614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017344	ATT	2	6	7631	7636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017344	AGG	2	6	7650	7655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017344	ATT	2	6	7656	7661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017344	TCT	2	6	8382	8387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017344	TAT	2	6	8417	8422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017344	TAA	2	6	8497	8502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017344	TTA	2	6	8548	8553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017344	TCA	2	6	8608	8613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017344	CTT	2	6	8650	8655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017344	TAT	2	6	8752	8757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017344	ATT	2	6	9198	9203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017344	AAC	2	6	9213	9218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017344	ATG	2	6	10320	10325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017344	AGT	2	6	10363	10368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017344	CAA	2	6	10388	10393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017344	TAA	2	6	10403	10408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017344	CTA	2	6	10420	10425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017344	TAG	2	6	10433	10438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017344	TGG	2	6	10441	10446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017344	TTA	2	6	10483	10488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017344	ATT	2	6	10678	10683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017344	ATA	2	6	10693	10698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017344	GTC	2	6	10704	10709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017344	AGG	2	6	10739	10744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017344	CAT	2	6	10748	10753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017344	TAT	2	6	10775	10780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017344	GTA	2	6	10791	10796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017344	ATT	2	6	10811	10816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017344	AAT	2	6	10830	10835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017344	CGA	2	6	10853	10858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017344	AGT	2	6	10899	10904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017344	TTG	2	6	10940	10945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017344	AAG	2	6	11006	11011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017344	ATG	2	6	12141	12146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017344	ATT	2	6	12154	12159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017344	AAT	2	6	12166	12171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017344	TCA	2	6	12191	12196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017344	TCA	2	6	12329	12334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017344	ACT	2	6	12373	12378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017344	TTA	2	6	12453	12458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017344	TGA	2	6	12489	12494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017344	TTC	2	6	12546	12551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017344	ATT	2	6	12561	12566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017344	TAA	2	6	12620	12625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017344	CAA	2	6	13764	13769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017344	TAA	2	6	13780	13785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017344	TAA	2	6	13820	13825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017344	GAA	2	6	13841	13846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017344	CAT	2	6	13849	13854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017344	TAA	2	6	13855	13860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017344	ATT	2	6	13916	13921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017344	GTA	2	6	13927	13932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017344	CAT	2	6	13968	13973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017344	TAA	2	6	14003	14008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017344	TTA	2	6	15162	15167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017344	CTA	2	6	15184	15189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017344	GTA	2	6	15206	15211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017344	TGT	2	6	16199	16204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017344	GAT	2	6	16243	16248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017344	ATA	2	6	16249	16254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017344	GTC	2	6	16275	16280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017344	CAT	2	6	16331	16336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017344	TCA	2	6	16345	16350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017344	TAT	2	6	16368	16373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017344	CAA	2	6	16394	16399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017344	ACT	2	6	16446	16451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017344	TAG	2	6	16517	16522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017344	CTT	2	6	17555	17560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017344	TTG	2	6	17588	17593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017344	ATT	2	6	17692	17697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017344	TTA	2	6	17742	17747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017344	TTA	2	6	18098	18103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017344	CTA	2	6	18198	18203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017344	TAA	2	6	18233	18238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017344	TAA	2	6	18259	18264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017344	TCG	2	6	18296	18301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017344	TTA	3	9	18361	18369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017344	ATA	2	6	18377	18382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017344	CAA	2	6	19112	19117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017344	CCT	2	6	19767	19772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017344	TAA	2	6	19931	19936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017344	TTA	2	6	19950	19955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017344	TAA	2	6	19968	19973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017344	TAT	2	6	19997	20002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017344	CTT	2	6	22158	22163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017344	TAA	2	6	22175	22180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017344	ATT	2	6	22210	22215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017344	ATA	2	6	23114	23119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017344	ATC	2	6	23129	23134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017344	TAT	2	6	23145	23150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017344	TAT	2	6	23194	23199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017344	TCA	2	6	23296	23301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017344	AAT	2	6	23361	23366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017344	TAA	2	6	24558	24563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017344	CTA	2	6	25250	25255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017344	CCT	2	6	25302	25307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017344	TCG	2	6	25312	25317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017344	TAT	3	9	25344	25352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017344	GTC	2	6	25391	25396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017344	AGA	2	6	25437	25442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017344	ATC	2	6	25456	25461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017344	TAA	2	6	25495	25500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017344	ATT	2	6	25634	25639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017344	ATC	2	6	25661	25666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017344	TAC	2	6	25688	25693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017344	TCC	2	6	26382	26387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017344	ATT	2	6	26411	26416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017344	CCA	2	6	27032	27037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017344	GTG	2	6	27064	27069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017344	CAT	2	6	27214	27219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.