MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2 plasmid pLUH02

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017344	GTT	2	6	1120	1125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863364
2	NC_017344	TAT	2	6	1156	1161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863364
3	NC_017344	TAG	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863364
4	NC_017344	TAT	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863364
5	NC_017344	TAA	2	6	1433	1438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863365
6	NC_017344	AAT	2	6	1439	1444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863365
7	NC_017344	ATG	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863365
8	NC_017344	TCT	2	6	1567	1572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863365
9	NC_017344	ATA	2	6	1583	1588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863365
10	NC_017344	TCT	2	6	1601	1606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863365
11	NC_017344	ATC	2	6	1650	1655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863365
12	NC_017344	AAT	3	9	1791	1799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863366
13	NC_017344	CAA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863366
14	NC_017344	AAG	2	6	1906	1911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863366
15	NC_017344	ATC	2	6	2100	2105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863366
16	NC_017344	ATA	2	6	2221	2226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863366
17	NC_017344	TAA	2	6	2295	2300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863366
18	NC_017344	TAA	2	6	2307	2312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863366
19	NC_017344	CTG	2	6	2318	2323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384863366
20	NC_017344	CAG	3	9	2339	2347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384863366
21	NC_017344	CAA	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863366
22	NC_017344	ATA	2	6	2365	2370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863366
23	NC_017344	TTC	2	6	2631	2636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863367
24	NC_017344	ATC	3	9	2649	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863367
25	NC_017344	CAA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863367
26	NC_017344	AAG	2	6	2719	2724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863367
27	NC_017344	ATT	2	6	2757	2762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863368
28	NC_017344	AAC	2	6	2784	2789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863368
29	NC_017344	ATT	2	6	3512	3517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863369
30	NC_017344	AAT	2	6	3522	3527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863369
31	NC_017344	TAA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863369
32	NC_017344	ATT	2	6	3600	3605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863369
33	NC_017344	ATA	2	6	3685	3690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863370
34	NC_017344	TCT	2	6	3737	3742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863370
35	NC_017344	TCA	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863370
36	NC_017344	CCA	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384863370
37	NC_017344	ATT	2	6	3981	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
38	NC_017344	TTC	2	6	4042	4047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863371
39	NC_017344	TCT	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863371
40	NC_017344	ATA	2	6	4174	4179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
41	NC_017344	TAA	2	6	4230	4235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
42	NC_017344	GTT	2	6	4278	4283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863371
43	NC_017344	TTC	2	6	4291	4296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863371
44	NC_017344	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
45	NC_017344	GAT	2	6	4341	4346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863371
46	NC_017344	ATG	2	6	4360	4365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863371
47	NC_017344	ATT	3	9	4366	4374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
48	NC_017344	ATA	2	6	4391	4396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
49	NC_017344	TAT	2	6	4443	4448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
50	NC_017344	TAA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
51	NC_017344	TTA	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
52	NC_017344	TAA	2	6	4639	4644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
53	NC_017344	TTA	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
54	NC_017344	TTA	2	6	4742	4747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863371
55	NC_017344	TAA	2	6	4795	4800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
56	NC_017344	CTG	2	6	4821	4826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384863371
57	NC_017344	ATA	2	6	4925	4930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863371
58	NC_017344	TGA	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863372
59	NC_017344	TAA	2	6	5426	5431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863372
60	NC_017344	AAT	2	6	5610	5615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863372
61	NC_017344	ATG	2	6	5695	5700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863372
62	NC_017344	AAC	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863372
63	NC_017344	CAA	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863372
64	NC_017344	CAA	2	6	5781	5786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863372
65	NC_017344	TAA	2	6	5804	5809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863372
66	NC_017344	AGA	3	9	5837	5845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863372
67	NC_017344	AAG	2	6	5905	5910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863372
68	NC_017344	GAA	2	6	5922	5927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863372
69	NC_017344	CAA	2	6	5946	5951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863372
70	NC_017344	GAA	2	6	6060	6065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863372
71	NC_017344	GAA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863373
72	NC_017344	AGA	2	6	6394	6399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863373
73	NC_017344	TAA	2	6	6465	6470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863373
74	NC_017344	TGT	2	6	6506	6511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863373
75	NC_017344	CAA	2	6	6577	6582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863373
76	NC_017344	ACA	2	6	6872	6877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863374
77	NC_017344	ATT	3	9	6933	6941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863374
78	NC_017344	ATA	2	6	7747	7752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863375
79	NC_017344	ATG	2	6	7855	7860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863375
80	NC_017344	TTA	2	6	7863	7868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863375
81	NC_017344	TTA	2	6	7873	7878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863375
82	NC_017344	ATT	2	6	7945	7950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863375
83	NC_017344	AGA	2	6	7967	7972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863375
84	NC_017344	GAA	2	6	8049	8054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863375
85	NC_017344	TAT	2	6	8131	8136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863375
86	NC_017344	TAA	2	6	8228	8233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863375
87	NC_017344	GTT	2	6	8307	8312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863375
88	NC_017344	TAT	2	6	8321	8326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863375
89	NC_017344	AAT	2	6	8342	8347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863375
90	NC_017344	TTA	2	6	9482	9487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863376
91	NC_017344	GAT	2	6	9615	9620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863376
92	NC_017344	TGT	2	6	9722	9727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863376
93	NC_017344	AAT	2	6	9790	9795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863376
94	NC_017344	GTA	2	6	10031	10036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863376
95	NC_017344	TTA	3	9	11093	11101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863377
96	NC_017344	ATA	2	6	11153	11158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863377
97	NC_017344	AAT	2	6	11160	11165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863377
98	NC_017344	TTG	2	6	11178	11183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863377
99	NC_017344	TCT	2	6	11252	11257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863377
100	NC_017344	ATT	2	6	11294	11299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863377
101	NC_017344	TAA	2	6	11341	11346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863377
102	NC_017344	TAA	2	6	11404	11409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863377
103	NC_017344	GTT	2	6	11419	11424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863377
104	NC_017344	TAT	2	6	11452	11457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863377
105	NC_017344	TTC	2	6	11550	11555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863377
106	NC_017344	TAA	2	6	11649	11654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863377
107	NC_017344	AAT	2	6	11662	11667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863377
108	NC_017344	TAG	2	6	11706	11711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863377
109	NC_017344	CAA	2	6	11751	11756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863377
110	NC_017344	TCC	2	6	11764	11769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384863377
111	NC_017344	ACT	2	6	11773	11778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863377
112	NC_017344	CCT	2	6	12008	12013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384863377
113	NC_017344	ATA	2	6	12069	12074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863377
114	NC_017344	ACT	2	6	12681	12686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863378
115	NC_017344	TAT	2	6	12735	12740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863378
116	NC_017344	AGA	2	6	12817	12822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863378
117	NC_017344	TCC	2	6	12853	12858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384863378
118	NC_017344	ATT	2	6	12868	12873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863378
119	NC_017344	CTT	2	6	12972	12977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863378
120	NC_017344	TTA	2	6	13031	13036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863378
121	NC_017344	CAC	2	6	13086	13091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384863378
122	NC_017344	TAA	2	6	13180	13185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863378
123	NC_017344	TAT	2	6	13273	13278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863378
124	NC_017344	ATT	2	6	13309	13314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863378
125	NC_017344	TAC	2	6	13323	13328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863378
126	NC_017344	TTA	2	6	14041	14046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863379
127	NC_017344	AGC	2	6	14136	14141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384863379
128	NC_017344	ATT	2	6	14166	14171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863379
129	NC_017344	ACT	2	6	14397	14402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863380
130	NC_017344	AGT	2	6	14479	14484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863380
131	NC_017344	CTT	2	6	14514	14519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384863380
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.