MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2 plasmid pLUH02

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017344	AT	3	6	422	427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017344	TA	3	6	947	952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017344	TC	3	6	1107	1112	0 %	50 %	0 %	50 %	384863364
4	NC_017344	TA	3	6	1352	1357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017344	CT	3	6	1413	1418	0 %	50 %	0 %	50 %	384863365
6	NC_017344	TA	3	6	1487	1492	50 %	50 %	0 %	0 %	384863365
7	NC_017344	AC	3	6	1555	1560	50 %	0 %	0 %	50 %	384863365
8	NC_017344	TA	3	6	1815	1820	50 %	50 %	0 %	0 %	384863366
9	NC_017344	CT	3	6	2081	2086	0 %	50 %	0 %	50 %	384863366
10	NC_017344	AT	4	8	2834	2841	50 %	50 %	0 %	0 %	384863368
11	NC_017344	AT	3	6	3097	3102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017344	TA	3	6	4432	4437	50 %	50 %	0 %	0 %	384863371
13	NC_017344	AT	4	8	5017	5024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017344	TA	3	6	5044	5049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017344	TA	3	6	5151	5156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017344	AT	3	6	5446	5451	50 %	50 %	0 %	0 %	384863372
17	NC_017344	AT	3	6	5602	5607	50 %	50 %	0 %	0 %	384863372
18	NC_017344	AT	3	6	5705	5710	50 %	50 %	0 %	0 %	384863372
19	NC_017344	AG	3	6	6040	6045	50 %	0 %	50 %	0 %	384863372
20	NC_017344	AG	3	6	6068	6073	50 %	0 %	50 %	0 %	384863372
21	NC_017344	TA	3	6	6185	6190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017344	GT	3	6	6510	6515	0 %	50 %	50 %	0 %	384863373
23	NC_017344	AT	3	6	7053	7058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017344	AT	3	6	7364	7369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017344	TA	3	6	7401	7406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017344	GA	3	6	7520	7525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017344	AT	3	6	7716	7721	50 %	50 %	0 %	0 %	384863375
28	NC_017344	TA	3	6	8209	8214	50 %	50 %	0 %	0 %	384863375
29	NC_017344	TA	3	6	8399	8404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017344	AT	3	6	8593	8598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017344	AT	3	6	9297	9302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017344	TG	3	6	9453	9458	0 %	50 %	50 %	0 %	384863376
33	NC_017344	AT	3	6	9601	9606	50 %	50 %	0 %	0 %	384863376
34	NC_017344	AT	4	8	9663	9670	50 %	50 %	0 %	0 %	384863376
35	NC_017344	AT	3	6	10109	10114	50 %	50 %	0 %	0 %	384863376
36	NC_017344	AT	3	6	10291	10296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017344	GA	3	6	10629	10634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017344	TA	3	6	11113	11118	50 %	50 %	0 %	0 %	384863377
39	NC_017344	AT	3	6	11585	11590	50 %	50 %	0 %	0 %	384863377
40	NC_017344	AC	3	6	11784	11789	50 %	0 %	0 %	50 %	384863377
41	NC_017344	AT	3	6	12200	12205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017344	CT	3	6	12405	12410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017344	AT	4	8	13528	13535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017344	AT	3	6	13738	13743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017344	TC	3	6	13813	13818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017344	AT	3	6	14507	14512	50 %	50 %	0 %	0 %	384863380
47	NC_017344	AC	3	6	14573	14578	50 %	0 %	0 %	50 %	384863380
48	NC_017344	AT	4	8	15104	15111	50 %	50 %	0 %	0 %	384863380
49	NC_017344	TA	3	6	15113	15118	50 %	50 %	0 %	0 %	384863380
50	NC_017344	TA	3	6	15863	15868	50 %	50 %	0 %	0 %	384863381
51	NC_017344	AG	3	6	15996	16001	50 %	0 %	50 %	0 %	384863381
52	NC_017344	TC	3	6	16268	16273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017344	AG	3	6	16292	16297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017344	AT	3	6	16553	16558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017344	AT	3	6	16709	16714	50 %	50 %	0 %	0 %	384863382
56	NC_017344	AT	3	6	16787	16792	50 %	50 %	0 %	0 %	384863382
57	NC_017344	AG	3	6	17655	17660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017344	TA	3	6	18159	18164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017344	GA	3	6	18328	18333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017344	CT	4	8	18343	18350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017344	AT	3	6	18393	18398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017344	TA	3	6	18618	18623	50 %	50 %	0 %	0 %	384863385
63	NC_017344	TC	3	6	18679	18684	0 %	50 %	0 %	50 %	384863385
64	NC_017344	AT	4	8	19867	19874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017344	AG	3	6	19887	19892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017344	AT	3	6	21312	21317	50 %	50 %	0 %	0 %	384863388
67	NC_017344	AT	3	6	21557	21562	50 %	50 %	0 %	0 %	384863388
68	NC_017344	TA	3	6	23247	23252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017344	AT	3	6	23371	23376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017344	TG	3	6	23403	23408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017344	AT	3	6	23791	23796	50 %	50 %	0 %	0 %	384863390
72	NC_017344	TA	3	6	24358	24363	50 %	50 %	0 %	0 %	384863390
73	NC_017344	AT	3	6	24545	24550	50 %	50 %	0 %	0 %	384863390
74	NC_017344	AT	3	6	24746	24751	50 %	50 %	0 %	0 %	384863391
75	NC_017344	AT	3	6	25039	25044	50 %	50 %	0 %	0 %	384863391
76	NC_017344	TA	3	6	25271	25276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017344	CT	3	6	25306	25311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017344	GA	3	6	25328	25333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017344	TA	3	6	25403	25408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017344	AT	3	6	25578	25583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017344	TC	3	6	25618	25623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017344	AT	3	6	26199	26204	50 %	50 %	0 %	0 %	384863392
83	NC_017344	TA	3	6	26423	26428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017344	TC	3	6	26958	26963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017344	TA	3	6	27188	27193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017344	AT	4	8	27255	27262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.