MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2

Total Repeats: 1494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017343	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863398
2	NC_017343	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017343	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017343	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384863402
5	NC_017343	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384863402
6	NC_017343	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384863402
7	NC_017343	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863402
8	NC_017343	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384863402
9	NC_017343	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384863404
10	NC_017343	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384863404
11	NC_017343	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017343	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384863409
13	NC_017343	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863409
14	NC_017343	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	384863410
15	NC_017343	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384863411
16	NC_017343	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863411
17	NC_017343	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384863412
18	NC_017343	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863412
19	NC_017343	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863413
20	NC_017343	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863414
21	NC_017343	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384863416
22	NC_017343	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384863419
23	NC_017343	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384863421
24	NC_017343	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863422
25	NC_017343	GTTTAA	2	12	36653	36664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863424
26	NC_017343	ATTTAT	2	12	37499	37510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863426
27	NC_017343	GTTTAA	2	12	41999	42010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863430
28	NC_017343	TTTAAT	2	12	44366	44377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863432
29	NC_017343	ACAAAT	2	12	46781	46792	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384863434
30	NC_017343	AATTAA	2	12	46872	46883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863434
31	NC_017343	ATTTAT	2	12	49293	49304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017343	TTAATG	2	12	49817	49828	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863436
33	NC_017343	AAGTCA	2	12	51022	51033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384863438
34	NC_017343	AAAAAG	2	12	51136	51147	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384863438
35	NC_017343	GAAAAA	2	12	51449	51460	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384863438
36	NC_017343	AATTAT	2	12	53688	53699	50 %	50 %	0 %	0 %	384863440
37	NC_017343	ACCCTT	2	12	55526	55537	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384863441
38	NC_017343	TTTAGC	2	12	57435	57446	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384863443
39	NC_017343	AAATAA	2	12	57486	57497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384863443
40	NC_017343	GTTAGA	2	12	59609	59620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863444
41	NC_017343	AAAAGA	2	12	59663	59674	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384863444
42	NC_017343	GCTAAA	2	12	62452	62463	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384863446
43	NC_017343	AACAAA	2	12	62873	62884	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017343	TAAAGA	2	12	66600	66611	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384863451
45	NC_017343	AACCAC	2	12	70472	70483	50 %	0 %	0 %	50 %	384863453
46	NC_017343	AATATA	2	12	72174	72185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017343	AACCGA	2	12	73783	73794	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384863455
48	NC_017343	ATAGAT	2	12	78683	78694	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863458
49	NC_017343	TATCAT	2	12	79450	79461	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384863459
50	NC_017343	TTTATT	2	12	79858	79869	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384863460
51	NC_017343	TATTTG	2	12	79944	79955	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384863460
52	NC_017343	TAAATA	2	12	81377	81388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863460
53	NC_017343	TTTTTC	2	12	83221	83232	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384863461
54	NC_017343	TTAAAT	2	12	83316	83327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017343	TAACAA	2	12	84673	84684	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017343	TAAGCC	2	12	85082	85093	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384863463
57	NC_017343	ATCGCA	2	12	86297	86308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384863464
58	NC_017343	TTTGAA	2	12	87328	87339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863465
59	NC_017343	CAATGG	2	12	96286	96297	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384863471
60	NC_017343	TGAAGA	2	12	97120	97131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384863472
61	NC_017343	TTTCAT	2	12	97801	97812	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384863473
62	NC_017343	TGTATA	2	12	102021	102032	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863478
63	NC_017343	TCGAAA	2	12	103522	103533	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384863480
64	NC_017343	CTATTG	2	12	106108	106119	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384863482
65	NC_017343	CATATG	2	12	107311	107322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384863483
66	NC_017343	AATGTA	2	12	108212	108223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017343	CTGTAA	2	12	110033	110044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017343	GGTATG	2	12	110354	110365	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384863486
69	NC_017343	CAGATT	2	12	112952	112963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384863488
70	NC_017343	AGATAT	2	12	120332	120343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863496
71	NC_017343	GTTTTT	2	12	121241	121252	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017343	ATGCCT	2	12	121471	121482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384863497
73	NC_017343	TGAAAG	2	12	122111	122122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384863497
74	NC_017343	GATATG	2	12	129611	129622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863503
75	NC_017343	ATTTGA	2	12	133517	133528	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863506
76	NC_017343	GATTTT	2	12	138028	138039	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017343	ATGTTA	2	12	143218	143229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863516
78	NC_017343	ATTTTT	2	12	143856	143867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384863517
79	NC_017343	CCATGC	2	12	145018	145029	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384863517
80	NC_017343	AGAAAA	2	12	145840	145851	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384863518
81	NC_017343	ACAAAG	2	12	149285	149296	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384863522
82	NC_017343	TGTAAT	2	12	150309	150320	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863523
83	NC_017343	AAAGAT	2	12	151298	151309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384863525
84	NC_017343	ATTAAT	2	12	153204	153215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017343	CAATAT	2	12	153770	153781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384863526
86	NC_017343	TCCCAC	2	12	154462	154473	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017343	TTGGTA	2	12	157795	157806	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384863531
88	NC_017343	GCGATT	2	12	157815	157826	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384863531
89	NC_017343	AAATTT	2	12	157913	157924	50 %	50 %	0 %	0 %	384863531
90	NC_017343	ACCTGC	2	12	160816	160827	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384863534
91	NC_017343	AAGATA	2	12	160962	160973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384863534
92	NC_017343	CGTTAA	2	12	163896	163907	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384863536
93	NC_017343	CTATTA	2	12	165747	165758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384863536
94	NC_017343	TATGAT	2	12	167281	167292	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863536
95	NC_017343	TTGAAA	2	12	167733	167744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863536
96	NC_017343	AACATT	2	12	170173	170184	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384863536
97	NC_017343	AGCAAC	2	12	173662	173673	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384863540
98	NC_017343	TGTTTG	2	12	173710	173721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863540
99	NC_017343	CACCTT	2	12	175714	175725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384863542
100	NC_017343	ACCTTT	2	12	176219	176230	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384863542
101	NC_017343	TTTATA	2	12	176315	176326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017343	ATTAAT	2	12	176338	176349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017343	GTAAAT	2	12	179958	179969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863545
104	NC_017343	ATTTTA	2	12	181553	181564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863546
105	NC_017343	TATCTT	2	12	186167	186178	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384863549
106	NC_017343	ATTTGG	2	12	187180	187191	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384863550
107	NC_017343	GAGTTT	2	12	190523	190534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384863551
108	NC_017343	TATACA	2	12	194524	194535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384863555
109	NC_017343	TTATTT	2	12	196556	196567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384863557
110	NC_017343	ATTTAT	2	12	197135	197146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863557
111	NC_017343	TTTTTA	2	12	197166	197177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017343	CCCTGA	2	12	199893	199904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384863560
113	NC_017343	TCCTGA	2	12	200712	200723	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384863560
114	NC_017343	TCAATT	2	12	202863	202874	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384863562
115	NC_017343	AATATG	2	12	204163	204174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863563
116	NC_017343	GATTTT	2	12	207319	207330	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017343	AAAAAT	2	12	207670	207681	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384863565
118	NC_017343	AGGACA	2	12	209530	209541	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384863567
119	NC_017343	ACATTT	2	12	209866	209877	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384863567
120	NC_017343	TTCTTG	2	12	214795	214806	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384863571
121	NC_017343	GGACGT	2	12	225296	225307	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384863580
122	NC_017343	ATATGA	2	12	228033	228044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017343	GGAATA	2	12	242895	242906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017343	TGGTAT	2	12	254475	254486	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384863601
125	NC_017343	TATAGA	2	12	257829	257840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863605
126	NC_017343	ATATAG	2	12	264122	264133	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017343	ACGATG	2	12	264458	264469	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384863610
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129	NC_017343	ATAATT	2	12	270388	270399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017343	AGAATC	2	12	272016	272027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384863615
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226	NC_017343	GTTGGT	2	12	463028	463039	0 %	50 %	50 %	0 %	384863801
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230	NC_017343	GTTTGG	2	12	467517	467528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
231	NC_017343	CAAGAA	2	12	470252	470263	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384863807
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236	NC_017343	TTATAA	2	12	482371	482382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_017343	GTTATA	2	12	544951	544962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_017343	GATTCA	2	12	815899	815910	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384864113
467	NC_017343	GACTCA	2	12	815935	815946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384864113
468	NC_017343	GATTCA	2	12	815953	815964	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384864113
469	NC_017343	GACTCA	2	12	815971	815982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384864113
470	NC_017343	TATCAA	2	12	818305	818316	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
471	NC_017343	AGTACT	2	12	819843	819854	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384864116
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500	NC_017343	CAAATC	2	12	894843	894854	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384864197

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