MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2

Total Repeats: 1268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017343	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863398
2	NC_017343	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384863402
3	NC_017343	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384863402
4	NC_017343	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384863402
5	NC_017343	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863402
6	NC_017343	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384863402
7	NC_017343	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384863404
8	NC_017343	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384863404
9	NC_017343	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384863409
10	NC_017343	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863409
11	NC_017343	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	384863410
12	NC_017343	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384863411
13	NC_017343	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863411
14	NC_017343	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384863412
15	NC_017343	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863412
16	NC_017343	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863413
17	NC_017343	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863414
18	NC_017343	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384863416
19	NC_017343	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384863419
20	NC_017343	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384863421
21	NC_017343	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863422
22	NC_017343	GTTTAA	2	12	36653	36664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863424
23	NC_017343	ATTTAT	2	12	37499	37510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863426
24	NC_017343	GTTTAA	2	12	41999	42010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863430
25	NC_017343	TTTAAT	2	12	44366	44377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863432
26	NC_017343	ACAAAT	2	12	46781	46792	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384863434
27	NC_017343	AATTAA	2	12	46872	46883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863434
28	NC_017343	TTAATG	2	12	49817	49828	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863436
29	NC_017343	AAGTCA	2	12	51022	51033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384863438
30	NC_017343	AAAAAG	2	12	51136	51147	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384863438
31	NC_017343	GAAAAA	2	12	51449	51460	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384863438
32	NC_017343	AATTAT	2	12	53688	53699	50 %	50 %	0 %	0 %	384863440
33	NC_017343	ACCCTT	2	12	55526	55537	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384863441
34	NC_017343	TTTAGC	2	12	57435	57446	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384863443
35	NC_017343	AAATAA	2	12	57486	57497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384863443
36	NC_017343	GTTAGA	2	12	59609	59620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863444
37	NC_017343	AAAAGA	2	12	59663	59674	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384863444
38	NC_017343	GCTAAA	2	12	62452	62463	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384863446
39	NC_017343	TAAAGA	2	12	66600	66611	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384863451
40	NC_017343	AACCAC	2	12	70472	70483	50 %	0 %	0 %	50 %	384863453
41	NC_017343	AACCGA	2	12	73783	73794	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384863455
42	NC_017343	ATAGAT	2	12	78683	78694	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863458
43	NC_017343	TATCAT	2	12	79450	79461	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384863459
44	NC_017343	TTTATT	2	12	79858	79869	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384863460
45	NC_017343	TATTTG	2	12	79944	79955	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384863460
46	NC_017343	TAAATA	2	12	81377	81388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863460
47	NC_017343	TTTTTC	2	12	83221	83232	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384863461
48	NC_017343	TAAGCC	2	12	85082	85093	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384863463
49	NC_017343	ATCGCA	2	12	86297	86308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384863464
50	NC_017343	TTTGAA	2	12	87328	87339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863465
51	NC_017343	CAATGG	2	12	96286	96297	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384863471
52	NC_017343	TGAAGA	2	12	97120	97131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384863472
53	NC_017343	TTTCAT	2	12	97801	97812	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384863473
54	NC_017343	TGTATA	2	12	102021	102032	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863478
55	NC_017343	TCGAAA	2	12	103522	103533	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384863480
56	NC_017343	CTATTG	2	12	106108	106119	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384863482
57	NC_017343	CATATG	2	12	107311	107322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384863483
58	NC_017343	GGTATG	2	12	110354	110365	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384863486
59	NC_017343	CAGATT	2	12	112952	112963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384863488
60	NC_017343	AGATAT	2	12	120332	120343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863496
61	NC_017343	ATGCCT	2	12	121471	121482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384863497
62	NC_017343	TGAAAG	2	12	122111	122122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384863497
63	NC_017343	GATATG	2	12	129611	129622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863503
64	NC_017343	ATTTGA	2	12	133517	133528	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863506
65	NC_017343	ATGTTA	2	12	143218	143229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863516
66	NC_017343	ATTTTT	2	12	143856	143867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384863517
67	NC_017343	CCATGC	2	12	145018	145029	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384863517
68	NC_017343	AGAAAA	2	12	145840	145851	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384863518
69	NC_017343	ACAAAG	2	12	149285	149296	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384863522
70	NC_017343	TGTAAT	2	12	150309	150320	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863523
71	NC_017343	AAAGAT	2	12	151298	151309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384863525
72	NC_017343	CAATAT	2	12	153770	153781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384863526
73	NC_017343	TTGGTA	2	12	157795	157806	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384863531
74	NC_017343	GCGATT	2	12	157815	157826	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384863531
75	NC_017343	AAATTT	2	12	157913	157924	50 %	50 %	0 %	0 %	384863531
76	NC_017343	ACCTGC	2	12	160816	160827	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384863534
77	NC_017343	AAGATA	2	12	160962	160973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384863534
78	NC_017343	CGTTAA	2	12	163896	163907	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384863536
79	NC_017343	CTATTA	2	12	165747	165758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384863536
80	NC_017343	TATGAT	2	12	167281	167292	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863536
81	NC_017343	TTGAAA	2	12	167733	167744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863536
82	NC_017343	AACATT	2	12	170173	170184	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384863536
83	NC_017343	AGCAAC	2	12	173662	173673	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384863540
84	NC_017343	TGTTTG	2	12	173710	173721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863540
85	NC_017343	CACCTT	2	12	175714	175725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384863542
86	NC_017343	ACCTTT	2	12	176219	176230	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384863542
87	NC_017343	GTAAAT	2	12	179958	179969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863545
88	NC_017343	ATTTTA	2	12	181553	181564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863546
89	NC_017343	TATCTT	2	12	186167	186178	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384863549
90	NC_017343	ATTTGG	2	12	187180	187191	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384863550
91	NC_017343	GAGTTT	2	12	190523	190534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384863551
92	NC_017343	TATACA	2	12	194524	194535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384863555
93	NC_017343	TTATTT	2	12	196556	196567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384863557
94	NC_017343	ATTTAT	2	12	197135	197146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863557
95	NC_017343	CCCTGA	2	12	199893	199904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384863560
96	NC_017343	TCCTGA	2	12	200712	200723	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384863560
97	NC_017343	TCAATT	2	12	202863	202874	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384863562
98	NC_017343	AATATG	2	12	204163	204174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863563
99	NC_017343	AAAAAT	2	12	207670	207681	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384863565
100	NC_017343	AGGACA	2	12	209530	209541	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384863567
101	NC_017343	ACATTT	2	12	209866	209877	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384863567
102	NC_017343	TTCTTG	2	12	214795	214806	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384863571
103	NC_017343	GGACGT	2	12	225296	225307	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384863580
104	NC_017343	TGGTAT	2	12	254475	254486	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384863601
105	NC_017343	TATAGA	2	12	257829	257840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384863605
106	NC_017343	ACGATG	2	12	264458	264469	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384863610
107	NC_017343	AGAATC	2	12	272016	272027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384863615
108	NC_017343	AAGTAA	2	12	275439	275450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384863620
109	NC_017343	ATAAAG	2	12	276420	276431	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384863621
110	NC_017343	GACATT	2	12	278001	278012	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384863622
111	NC_017343	GATTTC	2	12	279820	279831	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384863624
112	NC_017343	TTCATA	2	12	280390	280401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384863625
113	NC_017343	GATTAT	2	12	284797	284808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384863630
114	NC_017343	ATGGTG	2	12	284930	284941	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384863630
115	NC_017343	CAGCAA	2	12	285317	285328	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384863630
116	NC_017343	TCTTCA	2	12	290896	290907	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384863635
117	NC_017343	TTATCT	2	12	290992	291003	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384863635
118	NC_017343	GAAAAA	2	12	293254	293265	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384863638
119	NC_017343	GATACA	2	12	294419	294430	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384863638
120	NC_017343	TAATTA	2	12	296746	296757	50 %	50 %	0 %	0 %	384863640
121	NC_017343	ACAAGA	2	12	297586	297597	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384863641
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229	NC_017343	GTTTAG	2	12	548557	548568	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384863871
230	NC_017343	AAGTTG	2	12	551582	551593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863872
231	NC_017343	CTGGTA	2	12	552365	552376	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384863872
232	NC_017343	TTGTAC	2	12	553222	553233	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384863874
233	NC_017343	ACGACT	2	12	554089	554100	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384863876
234	NC_017343	AACGTG	2	12	555062	555073	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384863876
235	NC_017343	TTCGAA	2	12	555583	555594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384863876
236	NC_017343	TACAGC	2	12	557829	557840	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384863878
237	NC_017343	TTGCTA	2	12	558110	558121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384863878
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342	NC_017343	TTCAGG	2	12	700091	700102	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384864012
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