MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 2464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017342	CAATC	2	10	1616	1625	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017342	TCGGT	2	10	2337	2346	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017342	TTTTA	2	10	3242	3251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017342	CACGA	2	10	4044	4053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017342	TTACC	2	10	4863	4872	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017342	ATTGT	2	10	7234	7243	20 %	60 %	20 %	0 %	384865887
7	NC_017342	TTTAA	2	10	10431	10440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017342	TAAAT	2	10	11627	11636	60 %	40 %	0 %	0 %	384865892
9	NC_017342	TTACT	2	10	12554	12563	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017342	TGTCT	2	10	15176	15185	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017342	CTTTT	2	10	17942	17951	0 %	80 %	0 %	20 %	384865898
12	NC_017342	CAATG	2	10	19769	19778	40 %	20 %	20 %	20 %	384865901
13	NC_017342	ATACC	2	10	19876	19885	40 %	20 %	0 %	40 %	384865901
14	NC_017342	CAAAT	2	10	21717	21726	60 %	20 %	0 %	20 %	384865902
15	NC_017342	TGTTC	2	10	22256	22265	0 %	60 %	20 %	20 %	384865902
16	NC_017342	TCTTG	2	10	27030	27039	0 %	60 %	20 %	20 %	384865905
17	NC_017342	TTTCA	2	10	29064	29073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017342	ATCAA	2	10	29136	29145	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017342	TAATG	2	10	29413	29422	40 %	40 %	20 %	0 %	384865908
20	NC_017342	TTGTT	2	10	29787	29796	0 %	80 %	20 %	0 %	384865909
21	NC_017342	ACCAT	2	10	29863	29872	40 %	20 %	0 %	40 %	384865909
22	NC_017342	CTTTT	2	10	30616	30625	0 %	80 %	0 %	20 %	384865910
23	NC_017342	TCTTT	2	10	31503	31512	0 %	80 %	0 %	20 %	384865911
24	NC_017342	TGCTT	2	10	32296	32305	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017342	TTAAA	2	10	33931	33940	60 %	40 %	0 %	0 %	384865915
26	NC_017342	ATAAG	2	10	33983	33992	60 %	20 %	20 %	0 %	384865915
27	NC_017342	TAATC	2	10	34407	34416	40 %	40 %	0 %	20 %	384865915
28	NC_017342	TCACT	2	10	34633	34642	20 %	40 %	0 %	40 %	384865915
29	NC_017342	TCATT	2	10	36097	36106	20 %	60 %	0 %	20 %	384865916
30	NC_017342	TATAT	2	10	38846	38855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017342	ACAGA	2	10	39087	39096	60 %	0 %	20 %	20 %	384865921
32	NC_017342	AAATC	2	10	41264	41273	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017342	ATCTA	2	10	41890	41899	40 %	40 %	0 %	20 %	384865925
34	NC_017342	ACCTT	2	10	42089	42098	20 %	40 %	0 %	40 %	384865925
35	NC_017342	CAACA	2	10	43235	43244	60 %	0 %	0 %	40 %	384865926
36	NC_017342	CAATC	2	10	45714	45723	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017342	TCGGT	2	10	46435	46444	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017342	CACGA	2	10	48107	48116	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017342	TTACC	2	10	48925	48934	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017342	AGTTG	2	10	49398	49407	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017342	ACACC	2	10	50096	50105	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_017342	CACAA	2	10	50525	50534	60 %	0 %	0 %	40 %	384865928
43	NC_017342	ATCAT	2	10	52034	52043	40 %	40 %	0 %	20 %	384865930
44	NC_017342	TATAA	2	10	52516	52525	60 %	40 %	0 %	0 %	384865930
45	NC_017342	ATATT	2	10	54185	54194	40 %	60 %	0 %	0 %	384865932
46	NC_017342	TTGAA	2	10	56701	56710	40 %	40 %	20 %	0 %	384865934
47	NC_017342	ACTTT	2	10	57887	57896	20 %	60 %	0 %	20 %	384865934
48	NC_017342	CGATT	2	10	58981	58990	20 %	40 %	20 %	20 %	384865936
49	NC_017342	ACCAT	2	10	59103	59112	40 %	20 %	0 %	40 %	384865936
50	NC_017342	AAATC	2	10	61181	61190	60 %	20 %	0 %	20 %	384865937
51	NC_017342	GTTTT	2	10	65983	65992	0 %	80 %	20 %	0 %	384865939
52	NC_017342	TTATA	2	10	66339	66348	40 %	60 %	0 %	0 %	384865939
53	NC_017342	GTATT	2	10	67219	67228	20 %	60 %	20 %	0 %	384865940
54	NC_017342	TTAAG	2	10	67903	67912	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017342	ATTTA	2	10	68045	68054	40 %	60 %	0 %	0 %	384865941
56	NC_017342	ATGTA	2	10	68337	68346	40 %	40 %	20 %	0 %	384865941
57	NC_017342	ATTAG	2	10	70348	70357	40 %	40 %	20 %	0 %	384865944
58	NC_017342	AAAAT	2	10	72542	72551	80 %	20 %	0 %	0 %	384865947
59	NC_017342	AAATA	2	10	77016	77025	80 %	20 %	0 %	0 %	384865950
60	NC_017342	TGACA	2	10	78162	78171	40 %	20 %	20 %	20 %	384865951
61	NC_017342	CAAAC	2	10	78914	78923	60 %	0 %	0 %	40 %	384865952
62	NC_017342	CATTA	2	10	79467	79476	40 %	40 %	0 %	20 %	384865953
63	NC_017342	TGACG	2	10	80670	80679	20 %	20 %	40 %	20 %	384865955
64	NC_017342	CAATG	2	10	84573	84582	40 %	20 %	20 %	20 %	384865956
65	NC_017342	ACTAA	2	10	84966	84975	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017342	TAAAA	2	10	85033	85042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017342	CTTTG	2	10	85613	85622	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017342	ATTGT	2	10	86518	86527	20 %	60 %	20 %	0 %	384865958
69	NC_017342	ACTTT	2	10	87542	87551	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017342	AAATA	2	10	87997	88006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017342	TTTTC	2	10	88620	88629	0 %	80 %	0 %	20 %	384865961
72	NC_017342	TTTTA	2	10	89611	89620	20 %	80 %	0 %	0 %	384865962
73	NC_017342	AATAT	2	10	89673	89682	60 %	40 %	0 %	0 %	384865962
74	NC_017342	TATCC	2	10	90328	90337	20 %	40 %	0 %	40 %	384865963
75	NC_017342	TATAA	2	10	90514	90523	60 %	40 %	0 %	0 %	384865963
76	NC_017342	CAATC	2	10	91813	91822	40 %	20 %	0 %	40 %	384865964
77	NC_017342	TTTCA	2	10	92248	92257	20 %	60 %	0 %	20 %	384865965
78	NC_017342	GTACA	2	10	92629	92638	40 %	20 %	20 %	20 %	384865965
79	NC_017342	TTTCA	2	10	93062	93071	20 %	60 %	0 %	20 %	384865966
80	NC_017342	AATTT	2	10	94398	94407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017342	CGTTT	2	10	95755	95764	0 %	60 %	20 %	20 %	384865969
82	NC_017342	CTTGT	2	10	96818	96827	0 %	60 %	20 %	20 %	384865970
83	NC_017342	AAGTA	2	10	97026	97035	60 %	20 %	20 %	0 %	384865970
84	NC_017342	TTTCT	2	10	98448	98457	0 %	80 %	0 %	20 %	384865971
85	NC_017342	CTTTT	2	10	100964	100973	0 %	80 %	0 %	20 %	384865973
86	NC_017342	ACTTT	2	10	102345	102354	20 %	60 %	0 %	20 %	384865974
87	NC_017342	CTGTT	2	10	105849	105858	0 %	60 %	20 %	20 %	384865978
88	NC_017342	CAAAA	2	10	106231	106240	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017342	TCTGT	2	10	107079	107088	0 %	60 %	20 %	20 %	384865979
90	NC_017342	CAATT	2	10	107721	107730	40 %	40 %	0 %	20 %	384865980
91	NC_017342	TAGAT	2	10	108356	108365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017342	GCAAA	2	10	110046	110055	60 %	0 %	20 %	20 %	384865982
93	NC_017342	TCCAT	2	10	110108	110117	20 %	40 %	0 %	40 %	384865982
94	NC_017342	TATGA	2	10	110373	110382	40 %	40 %	20 %	0 %	384865982
95	NC_017342	CAGAA	2	10	111596	111605	60 %	0 %	20 %	20 %	384865984
96	NC_017342	TGTAA	2	10	112371	112380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017342	TAATT	2	10	112747	112756	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017342	TAAAT	2	10	113425	113434	60 %	40 %	0 %	0 %	384865986
99	NC_017342	AATTG	2	10	114096	114105	40 %	40 %	20 %	0 %	384865987
100	NC_017342	TACGA	2	10	115635	115644	40 %	20 %	20 %	20 %	384865989
101	NC_017342	TGTGA	2	10	116060	116069	20 %	40 %	40 %	0 %	384865989
102	NC_017342	ATTTA	2	10	118464	118473	40 %	60 %	0 %	0 %	384865990
103	NC_017342	TGAAT	2	10	119065	119074	40 %	40 %	20 %	0 %	384865991
104	NC_017342	TCTTT	2	10	119126	119135	0 %	80 %	0 %	20 %	384865991
105	NC_017342	TGCAG	2	10	120265	120274	20 %	20 %	40 %	20 %	384865992
106	NC_017342	TACTG	2	10	121423	121432	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017342	ACAGC	2	10	123190	123199	40 %	0 %	20 %	40 %	384865995
108	NC_017342	ATTTA	2	10	124139	124148	40 %	60 %	0 %	0 %	384865997
109	NC_017342	GCATG	2	10	127354	127363	20 %	20 %	40 %	20 %	384866000
110	NC_017342	ACTTA	2	10	128100	128109	40 %	40 %	0 %	20 %	384866001
111	NC_017342	ACTTA	2	10	128976	128985	40 %	40 %	0 %	20 %	384866001
112	NC_017342	TATAT	2	10	130526	130535	40 %	60 %	0 %	0 %	384866002
113	NC_017342	AAAAT	2	10	131525	131534	80 %	20 %	0 %	0 %	384866003
114	NC_017342	CTTAT	2	10	132961	132970	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017342	ATTCT	2	10	133024	133033	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017342	ATTTT	2	10	133372	133381	20 %	80 %	0 %	0 %	384866006
117	NC_017342	TACAT	2	10	136226	136235	40 %	40 %	0 %	20 %	384866011
118	NC_017342	TCGCT	2	10	142081	142090	0 %	40 %	20 %	40 %	384866020
119	NC_017342	AATCC	2	10	143226	143235	40 %	20 %	0 %	40 %	384866021
120	NC_017342	ATCCA	2	10	143588	143597	40 %	20 %	0 %	40 %	384866021
121	NC_017342	TCGCA	2	10	145655	145664	20 %	20 %	20 %	40 %	384866023
122	NC_017342	GTCAT	2	10	151516	151525	20 %	40 %	20 %	20 %	384866026
123	NC_017342	GATTA	2	10	152454	152463	40 %	40 %	20 %	0 %	384866027
124	NC_017342	TAAAT	2	10	152923	152932	60 %	40 %	0 %	0 %	384866027
125	NC_017342	ACCAT	2	10	153704	153713	40 %	20 %	0 %	40 %	384866028
126	NC_017342	TTTTA	2	10	156722	156731	20 %	80 %	0 %	0 %	384866033
127	NC_017342	TTTCA	2	10	157146	157155	20 %	60 %	0 %	20 %	384866034
128	NC_017342	ATCAT	2	10	158434	158443	40 %	40 %	0 %	20 %	384866035
129	NC_017342	ATTTG	2	10	159441	159450	20 %	60 %	20 %	0 %	384866035
130	NC_017342	TTAAT	2	10	162837	162846	40 %	60 %	0 %	0 %	384866039
131	NC_017342	AAATC	2	10	165289	165298	60 %	20 %	0 %	20 %	384866043
132	NC_017342	CAAAC	2	10	165578	165587	60 %	0 %	0 %	40 %	384866043
133	NC_017342	GGATG	2	10	168131	168140	20 %	20 %	60 %	0 %	384866045
134	NC_017342	TTTTA	2	10	168145	168154	20 %	80 %	0 %	0 %	384866045
135	NC_017342	TTATC	2	10	168260	168269	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017342	TGCTC	2	10	168359	168368	0 %	40 %	20 %	40 %	384866046
137	NC_017342	ATAAA	2	10	169571	169580	80 %	20 %	0 %	0 %	384866047
138	NC_017342	TTACT	2	10	174355	174364	20 %	60 %	0 %	20 %	384866052
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140	NC_017342	TCATA	2	10	177982	177991	40 %	40 %	0 %	20 %	384866055
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242	NC_017342	GCTTG	2	10	290701	290710	0 %	40 %	40 %	20 %	384866161
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251	NC_017342	AAATA	2	10	299822	299831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017342	ACAAT	2	10	301973	301982	60 %	20 %	0 %	20 %	384866170
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259	NC_017342	ATCCA	2	10	306993	307002	40 %	20 %	0 %	40 %	384866174
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263	NC_017342	ATTCC	2	10	312961	312970	20 %	40 %	0 %	40 %	384866180
264	NC_017342	CAATC	2	10	317711	317720	40 %	20 %	0 %	40 %	384866183
265	NC_017342	CATAG	2	10	319774	319783	40 %	20 %	20 %	20 %	384866184
266	NC_017342	AATAA	2	10	322030	322039	80 %	20 %	0 %	0 %	384866186
267	NC_017342	ATTGA	2	10	322063	322072	40 %	40 %	20 %	0 %	384866186
268	NC_017342	AGAAA	2	10	322501	322510	80 %	0 %	20 %	0 %	384866186
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270	NC_017342	TATCG	2	10	323914	323923	20 %	40 %	20 %	20 %	384866187
271	NC_017342	TTCAA	2	10	324076	324085	40 %	40 %	0 %	20 %	384866187
272	NC_017342	TGTTA	2	10	324370	324379	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_017342	CATTT	2	10	484905	484914	20 %	60 %	0 %	20 %	384866328
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