MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017342	CAATC	2	10	1616	1625	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017342	TCGGT	2	10	2337	2346	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017342	TTTTA	2	10	3242	3251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017342	CACGA	2	10	4044	4053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017342	TTACC	2	10	4863	4872	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017342	TTTAA	2	10	10431	10440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017342	TTACT	2	10	12554	12563	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017342	TGTCT	2	10	15176	15185	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017342	TTTCA	2	10	29064	29073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017342	ATCAA	2	10	29136	29145	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017342	TGCTT	2	10	32296	32305	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017342	TATAT	2	10	38846	38855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017342	AAATC	2	10	41264	41273	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017342	CAATC	2	10	45714	45723	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017342	TCGGT	2	10	46435	46444	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017342	CACGA	2	10	48107	48116	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017342	TTACC	2	10	48925	48934	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017342	AGTTG	2	10	49398	49407	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017342	ACACC	2	10	50096	50105	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017342	TTAAG	2	10	67903	67912	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017342	ACTAA	2	10	84966	84975	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017342	TAAAA	2	10	85033	85042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017342	CTTTG	2	10	85613	85622	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017342	ACTTT	2	10	87542	87551	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017342	AAATA	2	10	87997	88006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017342	AATTT	2	10	94398	94407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017342	CAAAA	2	10	106231	106240	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017342	TAGAT	2	10	108356	108365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017342	TGTAA	2	10	112371	112380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017342	TAATT	2	10	112747	112756	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017342	TACTG	2	10	121423	121432	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017342	CTTAT	2	10	132961	132970	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017342	ATTCT	2	10	133024	133033	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017342	TTATC	2	10	168260	168269	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017342	ATTCT	2	10	180764	180773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017342	ATACT	2	10	185235	185244	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017342	CAACA	2	10	185474	185483	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017342	AAAAT	2	10	187005	187014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017342	AATTT	2	10	192560	192569	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017342	TTTAT	2	10	204709	204718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017342	TTTCC	2	10	205138	205147	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017342	ATTAA	2	10	226224	226233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017342	CTCAT	2	10	234336	234345	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017342	ATGAT	2	10	236588	236597	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017342	TATGA	2	10	240149	240158	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017342	TTTAT	2	10	251367	251376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017342	TTTTC	2	10	251485	251494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017342	TAAAA	2	10	252352	252361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017342	TAACA	2	10	259201	259210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017342	GATTG	2	10	259266	259275	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017342	ATTTT	2	10	275286	275295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017342	ACTTT	2	10	276999	277008	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017342	TTTAA	2	10	280739	280748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017342	ATTCA	2	10	281693	281702	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017342	TTATC	2	10	286452	286461	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017342	ATGTT	2	10	290389	290398	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017342	AAATA	2	10	299822	299831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017342	ATATT	2	10	305811	305820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017342	TGTTA	2	10	324370	324379	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017342	AATCA	2	10	328527	328536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017342	AGTTG	2	10	333386	333395	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017342	TTATT	2	10	345520	345529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017342	GCTTT	2	10	363463	363472	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017342	TATAA	2	10	365418	365427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017342	AAAAT	2	10	408572	408581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017342	TTATT	2	10	410492	410501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017342	TTTTA	2	10	426509	426518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017342	ATTAC	2	10	430820	430829	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017342	ATTGA	2	10	447217	447226	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017342	GAAAA	2	10	447792	447801	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017342	TAAAA	2	10	449956	449965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017342	TAAAT	2	10	450909	450918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017342	ATTAT	2	10	454644	454653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017342	TACTT	2	10	454683	454692	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017342	TAAAA	2	10	455915	455924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017342	ATTTT	2	10	462579	462588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017342	TATTT	2	10	464837	464846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017342	TATAA	2	10	467102	467111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017342	TATAA	2	10	467271	467280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017342	CAAAT	2	10	474428	474437	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017342	AAACA	2	10	475793	475802	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017342	TCTCA	2	10	482200	482209	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017342	TTATC	2	10	484534	484543	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017342	ATTTT	2	10	484692	484701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017342	TGAAA	2	10	486146	486155	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017342	TAATA	2	10	496088	496097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017342	AATCG	2	10	496625	496634	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017342	AGTTC	2	10	513451	513460	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017342	TAGGG	2	10	521266	521275	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017342	ATAAA	2	10	540545	540554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017342	ATTAA	2	10	542490	542499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017342	ATTTA	2	10	547156	547165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017342	ATGAG	2	10	549590	549599	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017342	TAAAA	2	10	564598	564607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017342	TAAAG	2	10	566675	566684	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017342	TAAAT	2	10	571327	571336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017342	TAAAA	2	10	596644	596653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017342	TTGTT	2	10	596724	596733	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017342	ATTAA	2	10	611619	611628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017342	TATTT	2	10	611629	611638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017342	TGTAT	2	10	614245	614254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017342	TTAAT	2	10	620005	620014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017342	TAATT	2	10	624725	624734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017342	TAGAA	2	10	626505	626514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017342	GATAA	2	10	631311	631320	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017342	ACAGG	2	10	636382	636391	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017342	TTAGG	2	10	640623	640632	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017342	TTTGT	2	10	645239	645248	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017342	TATTG	2	10	647194	647203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017342	ATGTC	2	10	648420	648429	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017342	ATGAC	2	10	654126	654135	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017342	ATAAA	2	10	655581	655590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017342	TTAGG	2	10	657756	657765	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017342	TATAT	2	10	659787	659796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017342	AACAT	2	10	664688	664697	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017342	CTTGC	2	10	665353	665362	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017342	AAAAT	2	10	669796	669805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017342	AAAAG	2	10	678211	678220	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017342	ATACT	2	10	680763	680772	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017342	ATAAA	2	10	681818	681827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017342	TTATT	2	10	684533	684542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017342	TATGT	2	10	684901	684910	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017342	ATTTT	2	10	685039	685048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017342	ATTAC	2	10	686941	686950	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017342	TATCA	2	10	713211	713220	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017342	AAAAG	2	10	715530	715539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017342	ACCTC	2	10	715884	715893	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_017342	TAATA	2	10	715914	715923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017342	AATTG	2	10	720017	720026	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017342	ATTTG	2	10	726493	726502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017342	AAAAT	2	10	726558	726567	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017342	GAAAT	2	10	729746	729755	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017342	TGTTA	2	10	729973	729982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017342	TTTAG	2	10	733073	733082	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017342	AGAAA	2	10	736378	736387	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017342	CTATT	2	10	736823	736832	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017342	CATCC	2	10	742852	742861	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_017342	ACTTA	2	10	751453	751462	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017342	AAATG	2	10	768791	768800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017342	AACTT	2	10	774272	774281	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017342	ATATC	2	10	781058	781067	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017342	TGTAT	2	10	797495	797504	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017342	TGTTA	2	10	807116	807125	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017342	TGAAA	2	10	815528	815537	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017342	ATATA	2	10	831787	831796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017342	TTATG	2	10	845492	845501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017342	GTAGA	2	10	847437	847446	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017342	ATTTG	2	10	847453	847462	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_017342	TTTAA	2	10	2526256	2526265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_017342	TATCA	2	10	2531120	2531129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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