MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 1906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017342	ATTGT	2	10	7234	7243	20 %	60 %	20 %	0 %	384865887
2	NC_017342	TAAAT	2	10	11627	11636	60 %	40 %	0 %	0 %	384865892
3	NC_017342	CTTTT	2	10	17942	17951	0 %	80 %	0 %	20 %	384865898
4	NC_017342	CAATG	2	10	19769	19778	40 %	20 %	20 %	20 %	384865901
5	NC_017342	ATACC	2	10	19876	19885	40 %	20 %	0 %	40 %	384865901
6	NC_017342	CAAAT	2	10	21717	21726	60 %	20 %	0 %	20 %	384865902
7	NC_017342	TGTTC	2	10	22256	22265	0 %	60 %	20 %	20 %	384865902
8	NC_017342	TCTTG	2	10	27030	27039	0 %	60 %	20 %	20 %	384865905
9	NC_017342	TAATG	2	10	29413	29422	40 %	40 %	20 %	0 %	384865908
10	NC_017342	TTGTT	2	10	29787	29796	0 %	80 %	20 %	0 %	384865909
11	NC_017342	ACCAT	2	10	29863	29872	40 %	20 %	0 %	40 %	384865909
12	NC_017342	CTTTT	2	10	30616	30625	0 %	80 %	0 %	20 %	384865910
13	NC_017342	TCTTT	2	10	31503	31512	0 %	80 %	0 %	20 %	384865911
14	NC_017342	TTAAA	2	10	33931	33940	60 %	40 %	0 %	0 %	384865915
15	NC_017342	ATAAG	2	10	33983	33992	60 %	20 %	20 %	0 %	384865915
16	NC_017342	TAATC	2	10	34407	34416	40 %	40 %	0 %	20 %	384865915
17	NC_017342	TCACT	2	10	34633	34642	20 %	40 %	0 %	40 %	384865915
18	NC_017342	TCATT	2	10	36097	36106	20 %	60 %	0 %	20 %	384865916
19	NC_017342	ACAGA	2	10	39087	39096	60 %	0 %	20 %	20 %	384865921
20	NC_017342	ATCTA	2	10	41890	41899	40 %	40 %	0 %	20 %	384865925
21	NC_017342	ACCTT	2	10	42089	42098	20 %	40 %	0 %	40 %	384865925
22	NC_017342	CAACA	2	10	43235	43244	60 %	0 %	0 %	40 %	384865926
23	NC_017342	CACAA	2	10	50525	50534	60 %	0 %	0 %	40 %	384865928
24	NC_017342	ATCAT	2	10	52034	52043	40 %	40 %	0 %	20 %	384865930
25	NC_017342	TATAA	2	10	52516	52525	60 %	40 %	0 %	0 %	384865930
26	NC_017342	ATATT	2	10	54185	54194	40 %	60 %	0 %	0 %	384865932
27	NC_017342	TTGAA	2	10	56701	56710	40 %	40 %	20 %	0 %	384865934
28	NC_017342	ACTTT	2	10	57887	57896	20 %	60 %	0 %	20 %	384865934
29	NC_017342	CGATT	2	10	58981	58990	20 %	40 %	20 %	20 %	384865936
30	NC_017342	ACCAT	2	10	59103	59112	40 %	20 %	0 %	40 %	384865936
31	NC_017342	AAATC	2	10	61181	61190	60 %	20 %	0 %	20 %	384865937
32	NC_017342	GTTTT	2	10	65983	65992	0 %	80 %	20 %	0 %	384865939
33	NC_017342	TTATA	2	10	66339	66348	40 %	60 %	0 %	0 %	384865939
34	NC_017342	GTATT	2	10	67219	67228	20 %	60 %	20 %	0 %	384865940
35	NC_017342	ATTTA	2	10	68045	68054	40 %	60 %	0 %	0 %	384865941
36	NC_017342	ATGTA	2	10	68337	68346	40 %	40 %	20 %	0 %	384865941
37	NC_017342	ATTAG	2	10	70348	70357	40 %	40 %	20 %	0 %	384865944
38	NC_017342	AAAAT	2	10	72542	72551	80 %	20 %	0 %	0 %	384865947
39	NC_017342	AAATA	2	10	77016	77025	80 %	20 %	0 %	0 %	384865950
40	NC_017342	TGACA	2	10	78162	78171	40 %	20 %	20 %	20 %	384865951
41	NC_017342	CAAAC	2	10	78914	78923	60 %	0 %	0 %	40 %	384865952
42	NC_017342	CATTA	2	10	79467	79476	40 %	40 %	0 %	20 %	384865953
43	NC_017342	TGACG	2	10	80670	80679	20 %	20 %	40 %	20 %	384865955
44	NC_017342	CAATG	2	10	84573	84582	40 %	20 %	20 %	20 %	384865956
45	NC_017342	ATTGT	2	10	86518	86527	20 %	60 %	20 %	0 %	384865958
46	NC_017342	TTTTC	2	10	88620	88629	0 %	80 %	0 %	20 %	384865961
47	NC_017342	TTTTA	2	10	89611	89620	20 %	80 %	0 %	0 %	384865962
48	NC_017342	AATAT	2	10	89673	89682	60 %	40 %	0 %	0 %	384865962
49	NC_017342	TATCC	2	10	90328	90337	20 %	40 %	0 %	40 %	384865963
50	NC_017342	TATAA	2	10	90514	90523	60 %	40 %	0 %	0 %	384865963
51	NC_017342	CAATC	2	10	91813	91822	40 %	20 %	0 %	40 %	384865964
52	NC_017342	TTTCA	2	10	92248	92257	20 %	60 %	0 %	20 %	384865965
53	NC_017342	GTACA	2	10	92629	92638	40 %	20 %	20 %	20 %	384865965
54	NC_017342	TTTCA	2	10	93062	93071	20 %	60 %	0 %	20 %	384865966
55	NC_017342	CGTTT	2	10	95755	95764	0 %	60 %	20 %	20 %	384865969
56	NC_017342	CTTGT	2	10	96818	96827	0 %	60 %	20 %	20 %	384865970
57	NC_017342	AAGTA	2	10	97026	97035	60 %	20 %	20 %	0 %	384865970
58	NC_017342	TTTCT	2	10	98448	98457	0 %	80 %	0 %	20 %	384865971
59	NC_017342	CTTTT	2	10	100964	100973	0 %	80 %	0 %	20 %	384865973
60	NC_017342	ACTTT	2	10	102345	102354	20 %	60 %	0 %	20 %	384865974
61	NC_017342	CTGTT	2	10	105849	105858	0 %	60 %	20 %	20 %	384865978
62	NC_017342	TCTGT	2	10	107079	107088	0 %	60 %	20 %	20 %	384865979
63	NC_017342	CAATT	2	10	107721	107730	40 %	40 %	0 %	20 %	384865980
64	NC_017342	GCAAA	2	10	110046	110055	60 %	0 %	20 %	20 %	384865982
65	NC_017342	TCCAT	2	10	110108	110117	20 %	40 %	0 %	40 %	384865982
66	NC_017342	TATGA	2	10	110373	110382	40 %	40 %	20 %	0 %	384865982
67	NC_017342	CAGAA	2	10	111596	111605	60 %	0 %	20 %	20 %	384865984
68	NC_017342	TAAAT	2	10	113425	113434	60 %	40 %	0 %	0 %	384865986
69	NC_017342	AATTG	2	10	114096	114105	40 %	40 %	20 %	0 %	384865987
70	NC_017342	TACGA	2	10	115635	115644	40 %	20 %	20 %	20 %	384865989
71	NC_017342	TGTGA	2	10	116060	116069	20 %	40 %	40 %	0 %	384865989
72	NC_017342	ATTTA	2	10	118464	118473	40 %	60 %	0 %	0 %	384865990
73	NC_017342	TGAAT	2	10	119065	119074	40 %	40 %	20 %	0 %	384865991
74	NC_017342	TCTTT	2	10	119126	119135	0 %	80 %	0 %	20 %	384865991
75	NC_017342	TGCAG	2	10	120265	120274	20 %	20 %	40 %	20 %	384865992
76	NC_017342	ACAGC	2	10	123190	123199	40 %	0 %	20 %	40 %	384865995
77	NC_017342	ATTTA	2	10	124139	124148	40 %	60 %	0 %	0 %	384865997
78	NC_017342	GCATG	2	10	127354	127363	20 %	20 %	40 %	20 %	384866000
79	NC_017342	ACTTA	2	10	128100	128109	40 %	40 %	0 %	20 %	384866001
80	NC_017342	ACTTA	2	10	128976	128985	40 %	40 %	0 %	20 %	384866001
81	NC_017342	TATAT	2	10	130526	130535	40 %	60 %	0 %	0 %	384866002
82	NC_017342	AAAAT	2	10	131525	131534	80 %	20 %	0 %	0 %	384866003
83	NC_017342	ATTTT	2	10	133372	133381	20 %	80 %	0 %	0 %	384866006
84	NC_017342	TACAT	2	10	136226	136235	40 %	40 %	0 %	20 %	384866011
85	NC_017342	TCGCT	2	10	142081	142090	0 %	40 %	20 %	40 %	384866020
86	NC_017342	AATCC	2	10	143226	143235	40 %	20 %	0 %	40 %	384866021
87	NC_017342	ATCCA	2	10	143588	143597	40 %	20 %	0 %	40 %	384866021
88	NC_017342	TCGCA	2	10	145655	145664	20 %	20 %	20 %	40 %	384866023
89	NC_017342	GTCAT	2	10	151516	151525	20 %	40 %	20 %	20 %	384866026
90	NC_017342	GATTA	2	10	152454	152463	40 %	40 %	20 %	0 %	384866027
91	NC_017342	TAAAT	2	10	152923	152932	60 %	40 %	0 %	0 %	384866027
92	NC_017342	ACCAT	2	10	153704	153713	40 %	20 %	0 %	40 %	384866028
93	NC_017342	TTTTA	2	10	156722	156731	20 %	80 %	0 %	0 %	384866033
94	NC_017342	TTTCA	2	10	157146	157155	20 %	60 %	0 %	20 %	384866034
95	NC_017342	ATCAT	2	10	158434	158443	40 %	40 %	0 %	20 %	384866035
96	NC_017342	ATTTG	2	10	159441	159450	20 %	60 %	20 %	0 %	384866035
97	NC_017342	TTAAT	2	10	162837	162846	40 %	60 %	0 %	0 %	384866039
98	NC_017342	AAATC	2	10	165289	165298	60 %	20 %	0 %	20 %	384866043
99	NC_017342	CAAAC	2	10	165578	165587	60 %	0 %	0 %	40 %	384866043
100	NC_017342	GGATG	2	10	168131	168140	20 %	20 %	60 %	0 %	384866045
101	NC_017342	TTTTA	2	10	168145	168154	20 %	80 %	0 %	0 %	384866045
102	NC_017342	TGCTC	2	10	168359	168368	0 %	40 %	20 %	40 %	384866046
103	NC_017342	ATAAA	2	10	169571	169580	80 %	20 %	0 %	0 %	384866047
104	NC_017342	TTACT	2	10	174355	174364	20 %	60 %	0 %	20 %	384866052
105	NC_017342	TTGAA	2	10	177566	177575	40 %	40 %	20 %	0 %	384866055
106	NC_017342	TCATA	2	10	177982	177991	40 %	40 %	0 %	20 %	384866055
107	NC_017342	TTGTC	2	10	178336	178345	0 %	60 %	20 %	20 %	384866055
108	NC_017342	ATCTT	2	10	179509	179518	20 %	60 %	0 %	20 %	384866057
109	NC_017342	ATTTT	2	10	181517	181526	20 %	80 %	0 %	0 %	384866059
110	NC_017342	CATTA	2	10	185940	185949	40 %	40 %	0 %	20 %	384866062
111	NC_017342	TTGGC	2	10	186684	186693	0 %	40 %	40 %	20 %	384866062
112	NC_017342	CAATG	2	10	187515	187524	40 %	20 %	20 %	20 %	384866063
113	NC_017342	ACAGA	2	10	190196	190205	60 %	0 %	20 %	20 %	384866066
114	NC_017342	TATGG	2	10	191816	191825	20 %	40 %	40 %	0 %	384866067
115	NC_017342	CATTT	2	10	192337	192346	20 %	60 %	0 %	20 %	384866067
116	NC_017342	TTATT	2	10	193425	193434	20 %	80 %	0 %	0 %	384866068
117	NC_017342	TTAAC	2	10	194137	194146	40 %	40 %	0 %	20 %	384866069
118	NC_017342	ATTTG	2	10	195191	195200	20 %	60 %	20 %	0 %	384866070
119	NC_017342	ATGTC	2	10	195353	195362	20 %	40 %	20 %	20 %	384866070
120	NC_017342	ATATG	2	10	197458	197467	40 %	40 %	20 %	0 %	384866072
121	NC_017342	TAAAA	2	10	197826	197835	80 %	20 %	0 %	0 %	384866072
122	NC_017342	TTTCA	2	10	201419	201428	20 %	60 %	0 %	20 %	384866076
123	NC_017342	GCTTG	2	10	202098	202107	0 %	40 %	40 %	20 %	384866076
124	NC_017342	TATTT	2	10	202819	202828	20 %	80 %	0 %	0 %	384866077
125	NC_017342	TTAAT	2	10	205673	205682	40 %	60 %	0 %	0 %	384866081
126	NC_017342	AATTC	2	10	206884	206893	40 %	40 %	0 %	20 %	384866083
127	NC_017342	ATAAA	2	10	207882	207891	80 %	20 %	0 %	0 %	384866084
128	NC_017342	AATAA	2	10	209002	209011	80 %	20 %	0 %	0 %	384866087
129	NC_017342	CATTT	2	10	209983	209992	20 %	60 %	0 %	20 %	384866088
130	NC_017342	TAGTA	2	10	210860	210869	40 %	40 %	20 %	0 %	384866090
131	NC_017342	TAATA	2	10	213366	213375	60 %	40 %	0 %	0 %	384866095
132	NC_017342	ATCAA	2	10	213628	213637	60 %	20 %	0 %	20 %	384866095
133	NC_017342	AAATG	2	10	215227	215236	60 %	20 %	20 %	0 %	384866096
134	NC_017342	CTAAT	2	10	216497	216506	40 %	40 %	0 %	20 %	384866099
135	NC_017342	GAATT	2	10	217235	217244	40 %	40 %	20 %	0 %	384866099
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262	NC_017342	AGTTG	2	10	403615	403624	20 %	40 %	40 %	0 %	384866252
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