MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 8752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017342	AGTA	2	8	160	167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017342	ATTT	2	8	191	198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017342	TCGA	2	8	210	217	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017342	ATGA	2	8	775	782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017342	CCTA	2	8	969	976	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017342	TCGC	2	8	1423	1430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017342	TCTA	2	8	1489	1496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017342	AATT	2	8	2146	2153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017342	TCGC	2	8	2863	2870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017342	CTTA	2	8	3025	3032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017342	TACT	2	8	3378	3385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017342	TAAA	2	8	3501	3508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017342	TTAC	2	8	4659	4666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017342	TAGG	2	8	4996	5003	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017342	AAGC	2	8	5045	5052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017342	AATT	2	8	5433	5440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017342	ACTT	2	8	6114	6121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017342	TTAA	2	8	6137	6144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017342	TTCA	2	8	6239	6246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017342	ATTT	2	8	6662	6669	25 %	75 %	0 %	0 %	384865887
21	NC_017342	TGAT	2	8	6702	6709	25 %	50 %	25 %	0 %	384865887
22	NC_017342	AATC	2	8	7218	7225	50 %	25 %	0 %	25 %	384865887
23	NC_017342	TTCG	2	8	7642	7649	0 %	50 %	25 %	25 %	384865887
24	NC_017342	TAGT	2	8	7734	7741	25 %	50 %	25 %	0 %	384865887
25	NC_017342	TCAT	2	8	8132	8139	25 %	50 %	0 %	25 %	384865887
26	NC_017342	ACAT	2	8	8253	8260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017342	AAAT	2	8	8504	8511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017342	TTCA	2	8	8807	8814	25 %	50 %	0 %	25 %	384865888
29	NC_017342	ATTC	2	8	9082	9089	25 %	50 %	0 %	25 %	384865888
30	NC_017342	CATC	2	8	10195	10202	25 %	25 %	0 %	50 %	384865890
31	NC_017342	GAAT	2	8	10259	10266	50 %	25 %	25 %	0 %	384865890
32	NC_017342	ATTA	2	8	10520	10527	50 %	50 %	0 %	0 %	384865891
33	NC_017342	TAGT	2	8	11474	11481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017342	TTTA	2	8	11496	11503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017342	AAAT	2	8	11526	11533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017342	CAAA	2	8	11543	11550	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017342	AATT	2	8	11897	11904	50 %	50 %	0 %	0 %	384865892
38	NC_017342	GCAC	2	8	12252	12259	25 %	0 %	25 %	50 %	384865892
39	NC_017342	TTCT	2	8	13765	13772	0 %	75 %	0 %	25 %	384865894
40	NC_017342	ATCC	2	8	14133	14140	25 %	25 %	0 %	50 %	384865894
41	NC_017342	AATT	2	8	14491	14498	50 %	50 %	0 %	0 %	384865894
42	NC_017342	AATA	2	8	14638	14645	75 %	25 %	0 %	0 %	384865894
43	NC_017342	TTAA	2	8	15664	15671	50 %	50 %	0 %	0 %	384865895
44	NC_017342	TTGT	2	8	15867	15874	0 %	75 %	25 %	0 %	384865896
45	NC_017342	TTTA	2	8	17287	17294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017342	TTAA	2	8	17297	17304	50 %	50 %	0 %	0 %	384865897
47	NC_017342	TTGA	2	8	17347	17354	25 %	50 %	25 %	0 %	384865897
48	NC_017342	CTTT	2	8	17477	17484	0 %	75 %	0 %	25 %	384865897
49	NC_017342	TAAA	2	8	17707	17714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017342	ATTT	2	8	17805	17812	25 %	75 %	0 %	0 %	384865898
51	NC_017342	ATCA	2	8	18942	18949	50 %	25 %	0 %	25 %	384865900
52	NC_017342	TAAT	2	8	19969	19976	50 %	50 %	0 %	0 %	384865901
53	NC_017342	ATTA	2	8	20222	20229	50 %	50 %	0 %	0 %	384865901
54	NC_017342	CAAT	2	8	20368	20375	50 %	25 %	0 %	25 %	384865901
55	NC_017342	ATCA	2	8	20480	20487	50 %	25 %	0 %	25 %	384865901
56	NC_017342	AATA	2	8	20915	20922	75 %	25 %	0 %	0 %	384865901
57	NC_017342	AATT	2	8	21507	21514	50 %	50 %	0 %	0 %	384865902
58	NC_017342	TCCT	2	8	22545	22552	0 %	50 %	0 %	50 %	384865902
59	NC_017342	GTTT	2	8	22555	22562	0 %	75 %	25 %	0 %	384865902
60	NC_017342	TTCC	2	8	22691	22698	0 %	50 %	0 %	50 %	384865902
61	NC_017342	TCTT	2	8	22914	22921	0 %	75 %	0 %	25 %	384865902
62	NC_017342	AATC	2	8	22928	22935	50 %	25 %	0 %	25 %	384865902
63	NC_017342	TTTA	2	8	23007	23014	25 %	75 %	0 %	0 %	384865902
64	NC_017342	TCAA	2	8	23638	23645	50 %	25 %	0 %	25 %	384865902
65	NC_017342	CATA	2	8	23831	23838	50 %	25 %	0 %	25 %	384865902
66	NC_017342	TTTC	2	8	23909	23916	0 %	75 %	0 %	25 %	384865902
67	NC_017342	ATAA	2	8	24343	24350	75 %	25 %	0 %	0 %	384865902
68	NC_017342	TAAT	2	8	24530	24537	50 %	50 %	0 %	0 %	384865902
69	NC_017342	ATTC	2	8	24712	24719	25 %	50 %	0 %	25 %	384865903
70	NC_017342	CCGC	2	8	24936	24943	0 %	0 %	25 %	75 %	384865903
71	NC_017342	AGTA	2	8	25359	25366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017342	AATT	2	8	25440	25447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017342	TTAA	2	8	25473	25480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017342	ATTG	2	8	25944	25951	25 %	50 %	25 %	0 %	384865904
75	NC_017342	GTTT	2	8	26188	26195	0 %	75 %	25 %	0 %	384865904
76	NC_017342	TTGC	2	8	26291	26298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017342	TTTA	2	8	26304	26311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017342	ACGA	2	8	26323	26330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017342	ATTG	2	8	27065	27072	25 %	50 %	25 %	0 %	384865905
80	NC_017342	ATCA	2	8	27098	27105	50 %	25 %	0 %	25 %	384865905
81	NC_017342	TAAT	2	8	27106	27113	50 %	50 %	0 %	0 %	384865905
82	NC_017342	ATTT	2	8	27669	27676	25 %	75 %	0 %	0 %	384865906
83	NC_017342	CAAT	2	8	28497	28504	50 %	25 %	0 %	25 %	384865906
84	NC_017342	CCTT	2	8	28562	28569	0 %	50 %	0 %	50 %	384865906
85	NC_017342	TTTA	2	8	29522	29529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017342	TACT	2	8	29576	29583	25 %	50 %	0 %	25 %	384865909
87	NC_017342	ATTT	2	8	29679	29686	25 %	75 %	0 %	0 %	384865909
88	NC_017342	TCAT	2	8	29695	29702	25 %	50 %	0 %	25 %	384865909
89	NC_017342	TCAA	2	8	30050	30057	50 %	25 %	0 %	25 %	384865910
90	NC_017342	TCAT	2	8	30119	30126	25 %	50 %	0 %	25 %	384865910
91	NC_017342	TAAT	2	8	30257	30264	50 %	50 %	0 %	0 %	384865910
92	NC_017342	TACC	2	8	30450	30457	25 %	25 %	0 %	50 %	384865910
93	NC_017342	AAAT	2	8	30469	30476	75 %	25 %	0 %	0 %	384865910
94	NC_017342	TTCT	2	8	30496	30503	0 %	75 %	0 %	25 %	384865910
95	NC_017342	CTAA	2	8	30807	30814	50 %	25 %	0 %	25 %	384865911
96	NC_017342	CTTT	2	8	30867	30874	0 %	75 %	0 %	25 %	384865911
97	NC_017342	AATA	2	8	31418	31425	75 %	25 %	0 %	0 %	384865911
98	NC_017342	AATT	2	8	31609	31616	50 %	50 %	0 %	0 %	384865911
99	NC_017342	TAAA	2	8	31853	31860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017342	GTAT	2	8	32025	32032	25 %	50 %	25 %	0 %	384865912
101	NC_017342	CAAT	2	8	32176	32183	50 %	25 %	0 %	25 %	384865912
102	NC_017342	ATAG	2	8	32374	32381	50 %	25 %	25 %	0 %	384865913
103	NC_017342	TCTT	2	8	32492	32499	0 %	75 %	0 %	25 %	384865913
104	NC_017342	TCAT	2	8	33220	33227	25 %	50 %	0 %	25 %	384865913
105	NC_017342	ATGA	2	8	34313	34320	50 %	25 %	25 %	0 %	384865915
106	NC_017342	TAAC	2	8	35974	35981	50 %	25 %	0 %	25 %	384865916
107	NC_017342	TATT	2	8	36814	36821	25 %	75 %	0 %	0 %	384865917
108	NC_017342	TATT	2	8	36832	36839	25 %	75 %	0 %	0 %	384865917
109	NC_017342	ATTT	2	8	36988	36995	25 %	75 %	0 %	0 %	384865918
110	NC_017342	GATA	2	8	37111	37118	50 %	25 %	25 %	0 %	384865918
111	NC_017342	TCAA	2	8	37160	37167	50 %	25 %	0 %	25 %	384865918
112	NC_017342	ATCT	2	8	37297	37304	25 %	50 %	0 %	25 %	384865918
113	NC_017342	TTAA	2	8	37836	37843	50 %	50 %	0 %	0 %	384865919
114	NC_017342	CTTC	2	8	38081	38088	0 %	50 %	0 %	50 %	384865920
115	NC_017342	TTGA	2	8	39357	39364	25 %	50 %	25 %	0 %	384865921
116	NC_017342	CATT	2	8	39365	39372	25 %	50 %	0 %	25 %	384865921
117	NC_017342	AATT	2	8	40333	40340	50 %	50 %	0 %	0 %	384865923
118	NC_017342	TGTA	2	8	40423	40430	25 %	50 %	25 %	0 %	384865923
119	NC_017342	TTCT	2	8	40939	40946	0 %	75 %	0 %	25 %	384865923
120	NC_017342	AAAT	2	8	41095	41102	75 %	25 %	0 %	0 %	384865923
121	NC_017342	ATTT	2	8	41115	41122	25 %	75 %	0 %	0 %	384865923
122	NC_017342	CATT	2	8	41158	41165	25 %	50 %	0 %	25 %	384865923
123	NC_017342	ATGA	2	8	41833	41840	50 %	25 %	25 %	0 %	384865925
124	NC_017342	TAAA	2	8	41956	41963	75 %	25 %	0 %	0 %	384865925
125	NC_017342	ATTA	2	8	42289	42296	50 %	50 %	0 %	0 %	384865925
126	NC_017342	TGTT	2	8	42596	42603	0 %	75 %	25 %	0 %	384865926
127	NC_017342	AAAT	2	8	42665	42672	75 %	25 %	0 %	0 %	384865926
128	NC_017342	ATTT	2	8	43663	43670	25 %	75 %	0 %	0 %	384865926
129	NC_017342	ATTA	2	8	43740	43747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017342	TCTT	2	8	44018	44025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017342	AGTA	2	8	44258	44265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017342	ATTT	2	8	44289	44296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017342	TCGA	2	8	44308	44315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017342	ATGA	2	8	44873	44880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017342	CCTA	2	8	45067	45074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017342	TCGC	2	8	45521	45528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017342	TCTA	2	8	45587	45594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017342	AATT	2	8	46244	46251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017342	TCGC	2	8	46961	46968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017342	CTTA	2	8	47123	47130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017342	TACT	2	8	47353	47360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017342	CTTT	2	8	47491	47498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017342	TAAA	2	8	47564	47571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017342	TTAC	2	8	48721	48728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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