MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 1734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017342	AGTA	2	8	160	167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017342	ATTT	2	8	191	198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017342	TCGA	2	8	210	217	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017342	ATGA	2	8	775	782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017342	CCTA	2	8	969	976	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017342	TCGC	2	8	1423	1430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017342	TCTA	2	8	1489	1496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017342	AATT	2	8	2146	2153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017342	TCGC	2	8	2863	2870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017342	CTTA	2	8	3025	3032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017342	TACT	2	8	3378	3385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017342	TAAA	2	8	3501	3508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017342	TTAC	2	8	4659	4666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017342	TAGG	2	8	4996	5003	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017342	AAGC	2	8	5045	5052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017342	AATT	2	8	5433	5440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017342	ACTT	2	8	6114	6121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017342	TTAA	2	8	6137	6144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017342	TTCA	2	8	6239	6246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017342	ACAT	2	8	8253	8260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017342	AAAT	2	8	8504	8511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017342	TAGT	2	8	11474	11481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017342	TTTA	2	8	11496	11503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017342	AAAT	2	8	11526	11533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017342	CAAA	2	8	11543	11550	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017342	TTTA	2	8	17287	17294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017342	TAAA	2	8	17707	17714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017342	AGTA	2	8	25359	25366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017342	AATT	2	8	25440	25447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017342	TTAA	2	8	25473	25480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017342	TTGC	2	8	26291	26298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017342	TTTA	2	8	26304	26311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017342	ACGA	2	8	26323	26330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017342	TTTA	2	8	29522	29529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017342	TAAA	2	8	31853	31860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017342	ATTA	2	8	43740	43747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017342	TCTT	2	8	44018	44025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017342	AGTA	2	8	44258	44265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017342	ATTT	2	8	44289	44296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017342	TCGA	2	8	44308	44315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017342	ATGA	2	8	44873	44880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017342	CCTA	2	8	45067	45074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017342	TCGC	2	8	45521	45528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017342	TCTA	2	8	45587	45594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017342	AATT	2	8	46244	46251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017342	TCGC	2	8	46961	46968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017342	CTTA	2	8	47123	47130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017342	TACT	2	8	47353	47360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017342	CTTT	2	8	47491	47498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017342	TAAA	2	8	47564	47571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017342	TTAC	2	8	48721	48728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017342	TAGG	2	8	49058	49065	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017342	AAGC	2	8	49107	49114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017342	AATT	2	8	49318	49325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017342	AATT	2	8	49363	49370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017342	AAAT	2	8	49634	49641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017342	AATA	2	8	51127	51134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017342	TTTC	2	8	51153	51160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017342	AACG	2	8	56557	56564	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017342	TAAT	2	8	58685	58692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017342	GATA	2	8	58749	58756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017342	ATTC	2	8	65964	65971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017342	CAAA	2	8	70808	70815	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017342	CAAA	2	8	75925	75932	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017342	ATGT	2	8	77375	77382	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017342	CCAT	2	8	77545	77552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017342	CATA	2	8	79777	79784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017342	TCTG	2	8	84837	84844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017342	AACA	2	8	85222	85229	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017342	GTAA	2	8	85303	85310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017342	AAAT	2	8	85665	85672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017342	ACAT	2	8	86043	86050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017342	TAGA	2	8	86106	86113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017342	TTCA	2	8	86205	86212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017342	ATTT	2	8	87436	87443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017342	TTAA	2	8	87524	87531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017342	TTTA	2	8	88060	88067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017342	CAAA	2	8	90965	90972	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017342	ATAA	2	8	94337	94344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017342	ATTA	2	8	94408	94415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017342	TATT	2	8	94562	94569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017342	TCAT	2	8	97336	97343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017342	ACTT	2	8	97375	97382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017342	TTTA	2	8	97461	97468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017342	TTTA	2	8	97496	97503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017342	CAAA	2	8	100584	100591	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017342	ATTT	2	8	101384	101391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017342	TTAA	2	8	101543	101550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017342	AAAC	2	8	102526	102533	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017342	TAAT	2	8	102583	102590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017342	ATTG	2	8	102770	102777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017342	TAAT	2	8	103636	103643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017342	CTTT	2	8	103704	103711	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017342	ACAA	2	8	106195	106202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017342	CTAC	2	8	109355	109362	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017342	TAAT	2	8	109430	109437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017342	AATA	2	8	109674	109681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017342	CAAA	2	8	111411	111418	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017342	TTTA	2	8	111672	111679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017342	AGAA	2	8	111936	111943	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017342	TTTA	2	8	112424	112431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017342	TTAA	2	8	112898	112905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017342	ATTT	2	8	113100	113107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017342	TAAG	2	8	113136	113143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017342	ACAT	2	8	113206	113213	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017342	TAGC	2	8	114344	114351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017342	ATTA	2	8	118616	118623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017342	GAAC	2	8	120578	120585	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017342	CAAT	2	8	120607	120614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017342	TATG	2	8	122236	122243	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017342	ATTT	2	8	123502	123509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017342	TTAA	2	8	126643	126650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017342	CATC	2	8	126778	126785	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017342	CTTT	2	8	126946	126953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017342	CTAA	2	8	127022	127029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017342	CAAT	2	8	127056	127063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017342	TCAT	2	8	129221	129228	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017342	ATCC	2	8	131827	131834	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017342	AATT	2	8	133042	133049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017342	TATT	2	8	133650	133657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017342	ACTA	2	8	135725	135732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017342	GAAA	2	8	135764	135771	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017342	TTAA	2	8	139260	139267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017342	TTTA	2	8	142579	142586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017342	CAAA	2	8	142632	142639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017342	TAAT	2	8	142701	142708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017342	CTTA	2	8	142969	142976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017342	ATTC	2	8	143107	143114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017342	TAAT	2	8	150306	150313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017342	TTTG	2	8	151677	151684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017342	CTAT	2	8	151827	151834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017342	ATTA	2	8	152027	152034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017342	ATAA	2	8	153347	153354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017342	AAAT	2	8	153421	153428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017342	TATG	2	8	156064	156071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017342	TGAG	2	8	156690	156697	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017342	CTAA	2	8	157739	157746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017342	ATAA	2	8	161968	161975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017342	ATTT	2	8	162584	162591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017342	GTAT	2	8	166685	166692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017342	ATTT	2	8	166734	166741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017342	CCGA	2	8	168827	168834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017342	CTAA	2	8	170774	170781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017342	ATTT	2	8	170822	170829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017342	ACTT	2	8	175076	175083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017342	CATT	2	8	180718	180725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017342	TCAA	2	8	183002	183009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017342	TTCT	2	8	185245	185252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017342	AAAC	2	8	187024	187031	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017342	CATT	2	8	187052	187059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017342	TAAT	2	8	187087	187094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017342	GTTG	2	8	188892	188899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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