MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 5861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017342	CCT	2	6	104	109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017342	TCA	2	6	272	277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017342	CTC	2	6	449	454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017342	ACG	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017342	ACG	2	6	498	503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017342	ACC	2	6	693	698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017342	AGG	2	6	829	834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017342	CAC	2	6	874	879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017342	GTG	2	6	885	890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017342	GTA	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017342	CCA	2	6	925	930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017342	GCC	2	6	1186	1191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017342	CTC	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017342	TCT	2	6	1543	1548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017342	GGT	2	6	1676	1681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017342	ATG	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017342	GCT	2	6	2002	2007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017342	TGG	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017342	AAT	2	6	2222	2227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017342	ACT	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017342	TCC	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017342	CGT	2	6	2696	2701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017342	ACA	2	6	2724	2729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017342	ATT	2	6	2744	2749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017342	CTT	2	6	2752	2757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017342	GAT	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017342	GTC	2	6	2788	2793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017342	CAA	2	6	2827	2832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017342	TTG	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017342	CTA	2	6	2873	2878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017342	TCC	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017342	TCG	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017342	TAA	2	6	3108	3113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017342	CCA	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017342	ATT	2	6	3172	3177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017342	AAT	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017342	TTA	2	6	3270	3275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017342	ATT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017342	TGG	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017342	ACC	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017342	TCT	2	6	3547	3552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017342	GAA	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017342	AGG	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017342	GTG	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017342	AAC	2	6	3829	3834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017342	ATG	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017342	TCC	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017342	ATG	2	6	3989	3994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017342	GAC	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017342	CAC	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017342	TTC	2	6	4147	4152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017342	GCA	2	6	4266	4271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017342	TCC	2	6	4411	4416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017342	AAT	2	6	4561	4566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017342	GCT	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017342	TTC	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017342	TAA	2	6	4682	4687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017342	TCA	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017342	CTG	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017342	CCG	2	6	5027	5032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017342	CGC	2	6	5089	5094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017342	ATG	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017342	AAT	2	6	5165	5170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017342	TGG	2	6	5254	5259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017342	CCT	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017342	AAT	2	6	5620	5625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017342	AGA	2	6	5631	5636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017342	ACT	2	6	5689	5694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017342	ATT	2	6	5700	5705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017342	TGG	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017342	CCG	2	6	5927	5932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017342	CCT	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017342	CCA	2	6	6099	6104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017342	TGT	2	6	6172	6177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017342	GAC	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017342	TTC	2	6	6282	6287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017342	TCA	2	6	6468	6473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017342	TGT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017342	ATG	2	6	8311	8316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017342	TAA	2	6	8385	8390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017342	CAA	2	6	8492	8497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017342	ATC	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017342	AAT	2	6	8641	8646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017342	ATC	2	6	8649	8654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017342	TAA	2	6	8661	8666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017342	CAA	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017342	ACC	2	6	10314	10319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017342	TAA	2	6	10344	10349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017342	TTA	2	6	10373	10378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017342	TAT	2	6	10390	10395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017342	ATT	2	6	11515	11520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017342	CAA	2	6	12574	12579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017342	CAT	2	6	12598	12603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017342	AAT	2	6	12608	12613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017342	TCC	2	6	15033	15038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017342	ATA	2	6	15047	15052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017342	TAT	2	6	15234	15239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017342	TAA	3	9	15255	15263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017342	ATT	2	6	17240	17245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017342	CAT	2	6	17253	17258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017342	TCC	2	6	17715	17720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017342	TTA	2	6	17741	17746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017342	TAT	3	9	25296	25304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017342	ACA	2	6	25309	25314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017342	ATT	2	6	25344	25349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017342	ATG	2	6	25399	25404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017342	TTG	2	6	25410	25415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017342	TAA	2	6	25487	25492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017342	CAT	2	6	26283	26288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017342	TAT	2	6	26334	26339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017342	TCC	2	6	27350	27355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017342	ATT	2	6	27357	27362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017342	TAT	2	6	27378	27383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017342	AAT	2	6	29016	29021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017342	ATC	2	6	29028	29033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017342	TTA	2	6	29055	29060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017342	ATG	2	6	31671	31676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017342	AAT	2	6	31891	31896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017342	ATA	2	6	31901	31906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017342	CTT	2	6	31911	31916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017342	ATA	2	6	32242	32247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017342	TCC	2	6	36707	36712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017342	ATA	2	6	36732	36737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017342	TAA	3	9	38928	38936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017342	TAA	2	6	39417	39422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017342	CAA	2	6	41221	41226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017342	ATT	2	6	41245	41250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017342	TAA	2	6	41317	41322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017342	TTA	2	6	41324	41329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017342	TGA	2	6	41355	41360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017342	TAT	2	6	41364	41369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017342	CTT	2	6	43758	43763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017342	TAA	2	6	43807	43812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017342	CAG	2	6	43867	43872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017342	GAT	2	6	43876	43881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017342	CTG	2	6	43903	43908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017342	ATT	2	6	43982	43987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017342	CCT	2	6	44202	44207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017342	TCA	2	6	44370	44375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017342	CTC	2	6	44547	44552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017342	ACG	2	6	44570	44575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017342	ACG	2	6	44596	44601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017342	ACC	2	6	44791	44796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_017342	AGG	2	6	44927	44932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017342	TAA	2	6	135737	135742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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