MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 1254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017341	GTTGAA	2	12	2675	2686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860684
2	NC_017341	GTTATC	2	12	6781	6792	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384860688
3	NC_017341	CAAGCT	2	12	7749	7760	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384860688
4	NC_017341	GTAATG	2	12	8737	8748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860688
5	NC_017341	ACAATT	2	12	10734	10745	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384860690
6	NC_017341	TAGCAT	2	12	10829	10840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384860690
7	NC_017341	GCTTTA	2	12	16916	16927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384860695
8	NC_017341	TTTGAA	2	12	17737	17748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384860695
9	NC_017341	TAAAGG	2	12	19784	19795	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384860697
10	NC_017341	TTGAAG	2	12	19981	19992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860697
11	NC_017341	TGATTG	2	12	21185	21196	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384860698
12	NC_017341	AAGGAA	2	12	21955	21966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860699
13	NC_017341	TGAATT	2	12	24870	24881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384860700
14	NC_017341	CGTATT	2	12	25951	25962	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384860701
15	NC_017341	ATTTCA	2	12	27354	27365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384860702
16	NC_017341	GTTCTG	2	12	28653	28664	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384860703
17	NC_017341	ATCAGC	2	12	30668	30679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384860705
18	NC_017341	AAAAGA	2	12	33309	33320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384860707
19	NC_017341	ACATCT	2	12	34861	34872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860708
20	NC_017341	TTAAAC	2	12	35569	35580	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384860709
21	NC_017341	GTTTAA	2	12	36802	36813	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384860711
22	NC_017341	GTTTAA	2	12	42148	42159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384860715
23	NC_017341	AATGAA	2	12	45035	45046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384860718
24	NC_017341	ACAACT	2	12	47100	47111	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384860719
25	NC_017341	TTCATC	2	12	55180	55191	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384860726
26	NC_017341	TTTTCT	2	12	58610	58621	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384860729
27	NC_017341	AATTAA	2	12	58800	58811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860729
28	NC_017341	GGCATG	2	12	59431	59442	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384860730
29	NC_017341	TAAAAA	2	12	60593	60604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384860730
30	NC_017341	TTCTTT	2	12	68914	68925	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384860739
31	NC_017341	TTAAAC	2	12	69339	69350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384860740
32	NC_017341	GTAAAA	2	12	70592	70603	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384860741
33	NC_017341	TTAAAA	2	12	70682	70693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860741
34	NC_017341	GGGCTT	2	12	75868	75879	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384860745
35	NC_017341	ACCCTT	2	12	81291	81302	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384860750
36	NC_017341	TTTAGC	2	12	83199	83210	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384860752
37	NC_017341	AAATAA	2	12	83250	83261	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384860752
38	NC_017341	AAAAGA	2	12	85428	85439	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384860753
39	NC_017341	TACAAG	2	12	88176	88187	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384860755
40	NC_017341	GTAGAA	2	12	92097	92108	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384860758
41	NC_017341	AACCAC	2	12	92932	92943	50 %	0 %	0 %	50 %	384860758
42	NC_017341	AACCGA	2	12	96245	96256	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384860760
43	NC_017341	CATTAC	2	12	97946	97957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860761
44	NC_017341	CTTTTA	2	12	98015	98026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384860761
45	NC_017341	TATCAT	2	12	99517	99528	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384860762
46	NC_017341	TTTATT	2	12	99925	99936	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384860763
47	NC_017341	TATTTG	2	12	100011	100022	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384860763
48	NC_017341	TAAATA	2	12	101444	101455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860763
49	NC_017341	TTTTTC	2	12	103042	103053	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384860764
50	NC_017341	TTTGAA	2	12	107148	107159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384860768
51	NC_017341	TACCAT	2	12	110584	110595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860771
52	NC_017341	TGAAGA	2	12	116940	116951	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384860775
53	NC_017341	TTTCAT	2	12	117621	117632	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384860776
54	NC_017341	TGTTTA	2	12	121839	121850	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384860780
55	NC_017341	TCGAAA	2	12	123337	123348	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384860782
56	NC_017341	CTATTG	2	12	125923	125934	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384860784
57	NC_017341	CATATG	2	12	127126	127137	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384860785
58	NC_017341	CAGATT	2	12	132620	132631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384860790
59	NC_017341	AGATAT	2	12	140019	140030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384860797
60	NC_017341	GATATG	2	12	149301	149312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860804
61	NC_017341	TAATGA	2	12	152277	152288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384860806
62	NC_017341	ATTTGA	2	12	153207	153218	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384860807
63	NC_017341	TATAAA	2	12	153738	153749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860808
64	NC_017341	GATTTT	2	12	157900	157911	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384860812
65	NC_017341	ACAAAG	2	12	162420	162431	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384860816
66	NC_017341	TGTAAT	2	12	163444	163455	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384860817
67	NC_017341	AAAGAT	2	12	164433	164444	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384860819
68	NC_017341	CAATAT	2	12	166905	166916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384860820
69	NC_017341	AATTAG	2	12	169634	169645	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384860824
70	NC_017341	TTGGTA	2	12	170761	170772	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384860825
71	NC_017341	GCGATT	2	12	170781	170792	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384860825
72	NC_017341	AAATTT	2	12	170879	170890	50 %	50 %	0 %	0 %	384860825
73	NC_017341	TTTGGA	2	12	173444	173455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384860828
74	NC_017341	ACCTGC	2	12	173779	173790	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384860828
75	NC_017341	AAGATA	2	12	173925	173936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384860828
76	NC_017341	CTATTA	2	12	178710	178721	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384860829
77	NC_017341	TATGAT	2	12	180244	180255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384860829
78	NC_017341	TTGAAA	2	12	180696	180707	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384860829
79	NC_017341	AGCAAC	2	12	186647	186658	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384860833
80	NC_017341	CACCTT	2	12	188699	188710	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384860835
81	NC_017341	GTAAAT	2	12	192942	192953	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384860838
82	NC_017341	ATTTTA	2	12	194536	194547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860839
83	NC_017341	TATCTT	2	12	199150	199161	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384860842
84	NC_017341	ATTTGG	2	12	200163	200174	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384860843
85	NC_017341	GAGTTT	2	12	203507	203518	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384860844
86	NC_017341	CCCTGA	2	12	206016	206027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384860846
87	NC_017341	TCCTGA	2	12	206835	206846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384860846
88	NC_017341	TCAATT	2	12	208986	208997	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384860848
89	NC_017341	AATATG	2	12	210286	210297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384860849
90	NC_017341	AAGGAC	2	12	210610	210621	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384860849
91	NC_017341	AGGACA	2	12	214916	214927	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384860852
92	NC_017341	ACATTT	2	12	215252	215263	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384860852
93	NC_017341	TTCTTG	2	12	220180	220191	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384860856
94	NC_017341	AGCCAT	2	12	244251	244262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384860874
95	NC_017341	TGGTAT	2	12	260785	260796	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384860888
96	NC_017341	TATAGA	2	12	264139	264150	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384860892
97	NC_017341	ACGATG	2	12	271310	271321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384860898
98	NC_017341	AGAATC	2	12	278873	278884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384860903
99	NC_017341	GCAATT	2	12	282749	282760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384860907
100	NC_017341	CAATTG	2	12	283311	283322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384860907
101	NC_017341	ATAAAG	2	12	286025	286036	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384860910
102	NC_017341	GACATT	2	12	287724	287735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384860911
103	NC_017341	GATTTC	2	12	289543	289554	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384860913
104	NC_017341	TTCATA	2	12	290113	290124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384860914
105	NC_017341	GATTAT	2	12	294520	294531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384860918
106	NC_017341	ATGGTG	2	12	294653	294664	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384860918
107	NC_017341	CAGCAA	2	12	295040	295051	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384860918
108	NC_017341	TAATGG	2	12	296248	296259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860919
109	NC_017341	TCTTCA	2	12	300619	300630	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384860923
110	NC_017341	TTATCT	2	12	300715	300726	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384860923
111	NC_017341	CTAAAG	2	12	301822	301833	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384860924
112	NC_017341	ATAAGT	2	12	302180	302191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384860924
113	NC_017341	GAAAAA	2	12	302976	302987	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384860926
114	NC_017341	TAATTA	2	12	306468	306479	50 %	50 %	0 %	0 %	384860928
115	NC_017341	ACAAGA	2	12	307308	307319	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384860929
116	NC_017341	AGGACA	2	12	307686	307697	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384860929
117	NC_017341	ATTATC	2	12	308996	309007	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384860930
118	NC_017341	TAAATT	2	12	310536	310547	50 %	50 %	0 %	0 %	384860930
119	NC_017341	TGAAGA	2	12	310797	310808	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384860930
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