MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 2609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017341	CAAAT	2	10	929	938	60 %	20 %	0 %	20 %	384860683
2	NC_017341	AATTT	2	10	1977	1986	40 %	60 %	0 %	0 %	384860684
3	NC_017341	CAATT	2	10	2043	2052	40 %	40 %	0 %	20 %	384860684
4	NC_017341	AAATT	2	10	2421	2430	60 %	40 %	0 %	0 %	384860684
5	NC_017341	CAAAT	2	10	4708	4717	60 %	20 %	0 %	20 %	384860687
6	NC_017341	TGAAT	2	10	6218	6227	40 %	40 %	20 %	0 %	384860687
7	NC_017341	TGAAC	2	10	6459	6468	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017341	TTCAA	2	10	7205	7214	40 %	40 %	0 %	20 %	384860688
9	NC_017341	CTATA	2	10	9209	9218	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017341	GTAGG	2	10	13881	13890	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017341	TTATT	2	10	14917	14926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017341	CGATT	2	10	16246	16255	20 %	40 %	20 %	20 %	384860694
13	NC_017341	TCAAT	2	10	18386	18395	40 %	40 %	0 %	20 %	384860696
14	NC_017341	AGTTA	2	10	21564	21573	40 %	40 %	20 %	0 %	384860698
15	NC_017341	ATGTA	2	10	23123	23132	40 %	40 %	20 %	0 %	384860699
16	NC_017341	TCGAT	2	10	23287	23296	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017341	ATATT	2	10	23824	23833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017341	ACCAA	2	10	25720	25729	60 %	0 %	0 %	40 %	384860701
19	NC_017341	ATCAA	2	10	26432	26441	60 %	20 %	0 %	20 %	384860701
20	NC_017341	GAAAC	2	10	27053	27062	60 %	0 %	20 %	20 %	384860702
21	NC_017341	GAAGT	2	10	27203	27212	40 %	20 %	40 %	0 %	384860702
22	NC_017341	ATTAT	2	10	28846	28855	40 %	60 %	0 %	0 %	384860703
23	NC_017341	AACGA	2	10	28919	28928	60 %	0 %	20 %	20 %	384860703
24	NC_017341	AAACG	2	10	30764	30773	60 %	0 %	20 %	20 %	384860705
25	NC_017341	TGGCG	2	10	31449	31458	0 %	20 %	60 %	20 %	384860705
26	NC_017341	AAGGT	2	10	31936	31945	40 %	20 %	40 %	0 %	384860705
27	NC_017341	TATGA	2	10	32133	32142	40 %	40 %	20 %	0 %	384860705
28	NC_017341	CATTA	2	10	33363	33372	40 %	40 %	0 %	20 %	384860707
29	NC_017341	TTTCA	2	10	33664	33673	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017341	AAATG	2	10	34905	34914	60 %	20 %	20 %	0 %	384860708
31	NC_017341	ATTTT	2	10	34986	34995	20 %	80 %	0 %	0 %	384860708
32	NC_017341	ATTAT	2	10	36020	36029	40 %	60 %	0 %	0 %	384860710
33	NC_017341	TTATC	2	10	36299	36308	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017341	ATTTT	2	10	36457	36466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017341	TTCTT	2	10	37566	37575	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017341	TTTTC	2	10	38236	38245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017341	TTGTC	2	10	38272	38281	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017341	TAAAA	2	10	38480	38489	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017341	CAAAC	2	10	39096	39105	60 %	0 %	0 %	40 %	384860712
40	NC_017341	AAGTA	2	10	39907	39916	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017341	TGACA	2	10	41555	41564	40 %	20 %	20 %	20 %	384860714
42	NC_017341	ATGAG	2	10	43673	43682	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017341	TGAAT	2	10	44020	44029	40 %	40 %	20 %	0 %	384860717
44	NC_017341	TTGGT	2	10	44062	44071	0 %	60 %	40 %	0 %	384860717
45	NC_017341	AATAT	2	10	44130	44139	60 %	40 %	0 %	0 %	384860717
46	NC_017341	TTCGT	2	10	44341	44350	0 %	60 %	20 %	20 %	384860717
47	NC_017341	CAAAA	2	10	44701	44710	80 %	0 %	0 %	20 %	384860718
48	NC_017341	AAATT	2	10	46800	46809	60 %	40 %	0 %	0 %	384860719
49	NC_017341	TTTAA	2	10	49759	49768	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017341	AAAAT	2	10	49851	49860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017341	TTATT	2	10	50079	50088	20 %	80 %	0 %	0 %	384860722
52	NC_017341	GAATT	2	10	51054	51063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017341	TGGTG	2	10	51706	51715	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017341	CTTTT	2	10	52970	52979	0 %	80 %	0 %	20 %	384860723
55	NC_017341	ATAGC	2	10	54473	54482	40 %	20 %	20 %	20 %	384860725
56	NC_017341	ATATA	2	10	54606	54615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017341	TACTT	2	10	54814	54823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017341	GAAGT	2	10	56281	56290	40 %	20 %	40 %	0 %	384860727
59	NC_017341	GATTC	2	10	58727	58736	20 %	40 %	20 %	20 %	384860729
60	NC_017341	GTTGT	2	10	61903	61912	0 %	60 %	40 %	0 %	384860733
61	NC_017341	ATTTT	2	10	63180	63189	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017341	ATTTG	2	10	63611	63620	20 %	60 %	20 %	0 %	384860736
63	NC_017341	GAATT	2	10	64219	64228	40 %	40 %	20 %	0 %	384860736
64	NC_017341	AGATA	2	10	64249	64258	60 %	20 %	20 %	0 %	384860736
65	NC_017341	TGACT	2	10	67754	67763	20 %	40 %	20 %	20 %	384860738
66	NC_017341	CAATA	2	10	67859	67868	60 %	20 %	0 %	20 %	384860738
67	NC_017341	TGTTT	2	10	68055	68064	0 %	80 %	20 %	0 %	384860738
68	NC_017341	AATGA	2	10	68259	68268	60 %	20 %	20 %	0 %	384860738
69	NC_017341	TAAAT	2	10	68869	68878	60 %	40 %	0 %	0 %	384860739
70	NC_017341	AATTA	2	10	72118	72127	60 %	40 %	0 %	0 %	384860742
71	NC_017341	TTTTA	2	10	73955	73964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017341	AAAGT	2	10	75187	75196	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017341	TGTAA	2	10	75642	75651	40 %	40 %	20 %	0 %	384860745
74	NC_017341	GTTGT	2	10	76980	76989	0 %	60 %	40 %	0 %	384860747
75	NC_017341	ATTTA	2	10	78962	78971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017341	AACAA	2	10	79554	79563	80 %	0 %	0 %	20 %	384860748
77	NC_017341	TTTTA	2	10	79915	79924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017341	ATTCA	2	10	82652	82661	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017341	TATAT	2	10	82913	82922	40 %	60 %	0 %	0 %	384860752
80	NC_017341	CAAAA	2	10	84585	84594	80 %	0 %	0 %	20 %	384860753
81	NC_017341	AAATG	2	10	86719	86728	60 %	20 %	20 %	0 %	384860753
82	NC_017341	GATAT	2	10	89302	89311	40 %	40 %	20 %	0 %	384860756
83	NC_017341	ATTGC	2	10	90240	90249	20 %	40 %	20 %	20 %	384860757
84	NC_017341	TCATT	2	10	90428	90437	20 %	60 %	0 %	20 %	384860757
85	NC_017341	CATGG	2	10	91644	91653	20 %	20 %	40 %	20 %	384860757
86	NC_017341	TCAAT	2	10	92684	92693	40 %	40 %	0 %	20 %	384860758
87	NC_017341	GTATT	2	10	93173	93182	20 %	60 %	20 %	0 %	384860759
88	NC_017341	GTAAT	2	10	99053	99062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017341	CAATT	2	10	99485	99494	40 %	40 %	0 %	20 %	384860762
90	NC_017341	ATGTT	2	10	100319	100328	20 %	60 %	20 %	0 %	384860763
91	NC_017341	TTGCG	2	10	100890	100899	0 %	40 %	40 %	20 %	384860763
92	NC_017341	AGTTA	2	10	102354	102363	40 %	40 %	20 %	0 %	384860764
93	NC_017341	TAAAA	2	10	103166	103175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017341	AGATG	2	10	105552	105561	40 %	20 %	40 %	0 %	384860766
95	NC_017341	GGTGA	2	10	106148	106157	20 %	20 %	60 %	0 %	384860767
96	NC_017341	GAAAA	2	10	109585	109594	80 %	0 %	20 %	0 %	384860770
97	NC_017341	AATCA	2	10	112774	112783	60 %	20 %	0 %	20 %	384860772
98	NC_017341	ATTTT	2	10	113472	113481	20 %	80 %	0 %	0 %	384860773
99	NC_017341	ATCAA	2	10	113499	113508	60 %	20 %	0 %	20 %	384860773
100	NC_017341	ATCAC	2	10	114732	114741	40 %	20 %	0 %	40 %	384860774
101	NC_017341	AACGA	2	10	115409	115418	60 %	0 %	20 %	20 %	384860774
102	NC_017341	ACACA	2	10	117465	117474	60 %	0 %	0 %	40 %	384860776
103	NC_017341	GACAA	2	10	118616	118625	60 %	0 %	20 %	20 %	384860777
104	NC_017341	ATTAC	2	10	120799	120808	40 %	40 %	0 %	20 %	384860779
105	NC_017341	ATTTT	2	10	121102	121111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017341	TATCT	2	10	121458	121467	20 %	60 %	0 %	20 %	384860780
107	NC_017341	ATACG	2	10	123888	123897	40 %	20 %	20 %	20 %	384860782
108	NC_017341	TTATA	2	10	124546	124555	40 %	60 %	0 %	0 %	384860783
109	NC_017341	TATAA	2	10	124916	124925	60 %	40 %	0 %	0 %	384860783
110	NC_017341	TTTTA	2	10	125344	125353	20 %	80 %	0 %	0 %	384860783
111	NC_017341	TCAAC	2	10	126059	126068	40 %	20 %	0 %	40 %	384860784
112	NC_017341	AATAA	2	10	126450	126459	80 %	20 %	0 %	0 %	384860784
113	NC_017341	TACGC	2	10	126717	126726	20 %	20 %	20 %	40 %	384860784
114	NC_017341	TCCCT	2	10	129376	129385	0 %	40 %	0 %	60 %	384860787
115	NC_017341	GCTTT	2	10	131610	131619	0 %	60 %	20 %	20 %	384860789
116	NC_017341	TAATT	2	10	131695	131704	40 %	60 %	0 %	0 %	384860789
117	NC_017341	ATACT	2	10	132876	132885	40 %	40 %	0 %	20 %	384860791
118	NC_017341	TAATA	2	10	134042	134051	60 %	40 %	0 %	0 %	384860792
119	NC_017341	ATTTT	2	10	135033	135042	20 %	80 %	0 %	0 %	384860793
120	NC_017341	ATTTG	2	10	136345	136354	20 %	60 %	20 %	0 %	384860794
121	NC_017341	TTGTA	2	10	137257	137266	20 %	60 %	20 %	0 %	384860795
122	NC_017341	TGCAA	2	10	138262	138271	40 %	20 %	20 %	20 %	384860796
123	NC_017341	ATATG	2	10	140280	140289	40 %	40 %	20 %	0 %	384860797
124	NC_017341	TATGA	2	10	141960	141969	40 %	40 %	20 %	0 %	384860799
125	NC_017341	AATAT	2	10	142966	142975	60 %	40 %	0 %	0 %	384860799
126	NC_017341	CGAAC	2	10	144954	144963	40 %	0 %	20 %	40 %	384860800
127	NC_017341	TTCAA	2	10	146981	146990	40 %	40 %	0 %	20 %	384860801
128	NC_017341	ACATC	2	10	147824	147833	40 %	20 %	0 %	40 %	384860803
129	NC_017341	TTAAG	2	10	150055	150064	40 %	40 %	20 %	0 %	384860804
130	NC_017341	GTAAT	2	10	150797	150806	40 %	40 %	20 %	0 %	384860805
131	NC_017341	AGAGA	2	10	153073	153082	60 %	0 %	40 %	0 %	384860807
132	NC_017341	AATCC	2	10	153429	153438	40 %	20 %	0 %	40 %	384860807
133	NC_017341	TTGGA	2	10	156458	156467	20 %	40 %	40 %	0 %	384860810
134	NC_017341	TTATT	2	10	156873	156882	20 %	80 %	0 %	0 %	384860811
135	NC_017341	ATTTT	2	10	156939	156948	20 %	80 %	0 %	0 %	384860811
136	NC_017341	TATGG	2	10	157340	157349	20 %	40 %	40 %	0 %	384860811
137	NC_017341	ATCGT	2	10	157781	157790	20 %	40 %	20 %	20 %	384860811
138	NC_017341	TGAAT	2	10	162367	162376	40 %	40 %	20 %	0 %	384860816
139	NC_017341	CAAAA	2	10	163751	163760	80 %	0 %	0 %	20 %	384860818
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239	NC_017341	GTTAA	2	10	276163	276172	40 %	40 %	20 %	0 %	384860901
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265	NC_017341	GCAAT	2	10	303319	303328	40 %	20 %	20 %	20 %	384860926
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