MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017341	TGAAC	2	10	6459	6468	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017341	CTATA	2	10	9209	9218	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017341	GTAGG	2	10	13881	13890	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017341	TTATT	2	10	14917	14926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017341	TCGAT	2	10	23287	23296	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017341	ATATT	2	10	23824	23833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017341	TTTCA	2	10	33664	33673	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017341	TTATC	2	10	36299	36308	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017341	ATTTT	2	10	36457	36466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017341	TTCTT	2	10	37566	37575	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017341	TTTTC	2	10	38236	38245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017341	TTGTC	2	10	38272	38281	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017341	TAAAA	2	10	38480	38489	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017341	AAGTA	2	10	39907	39916	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017341	ATGAG	2	10	43673	43682	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017341	TTTAA	2	10	49759	49768	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017341	AAAAT	2	10	49851	49860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017341	GAATT	2	10	51054	51063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017341	TGGTG	2	10	51706	51715	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017341	ATATA	2	10	54606	54615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017341	TACTT	2	10	54814	54823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017341	ATTTT	2	10	63180	63189	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017341	TTTTA	2	10	73955	73964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017341	AAAGT	2	10	75187	75196	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017341	ATTTA	2	10	78962	78971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017341	TTTTA	2	10	79915	79924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017341	ATTCA	2	10	82652	82661	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017341	GTAAT	2	10	99053	99062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017341	TAAAA	2	10	103166	103175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017341	ATTTT	2	10	121102	121111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017341	AAAGC	2	10	166213	166222	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017341	TTTAT	2	10	174903	174912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017341	TATCA	2	10	176007	176016	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017341	CAACT	2	10	196291	196300	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017341	GCTTT	2	10	200803	200812	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017341	TGAAG	2	10	201006	201015	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017341	AAAAT	2	10	201077	201086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017341	TGATT	2	10	201150	201159	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017341	TAACA	2	10	205308	205317	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017341	AATAT	2	10	223868	223877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017341	TATTT	2	10	229857	229866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017341	AACAT	2	10	238215	238224	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017341	GATAA	2	10	242152	242161	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017341	ATAAC	2	10	246800	246809	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017341	TGAAT	2	10	246911	246920	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017341	ATTAA	2	10	247865	247874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017341	AAAGT	2	10	251606	251615	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017341	TAAAA	2	10	253318	253327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017341	AAATT	2	10	254635	254644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017341	AAATT	2	10	255114	255123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017341	AAACT	2	10	255353	255362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017341	TTTTA	2	10	276249	276258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017341	GAAAA	2	10	277116	277125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017341	ATAAA	2	10	277234	277243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017341	TCATA	2	10	288452	288461	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017341	ATGAG	2	10	294264	294273	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017341	ATTTA	2	10	302374	302383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017341	TGAAT	2	10	321703	321712	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017341	GATTA	2	10	321899	321908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017341	AGGAA	2	10	321928	321937	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017341	TAAAT	2	10	334506	334515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017341	ATTTT	2	10	340062	340071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017341	GACTT	2	10	343037	343046	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017341	ATAGA	2	10	347633	347642	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017341	GATAA	2	10	360136	360145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017341	AAGTT	2	10	399414	399423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017341	GCTAT	2	10	402167	402176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017341	AATAA	2	10	402288	402297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017341	AAACT	2	10	404910	404919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017341	GTAAT	2	10	409651	409660	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017341	AGATA	2	10	410636	410645	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017341	AGAAT	2	10	410877	410886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017341	TAAGG	2	10	410941	410950	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017341	TAAAT	2	10	418386	418395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017341	ACAGT	2	10	420959	420968	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017341	GTTTC	2	10	428853	428862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017341	GGGAA	2	10	429017	429026	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017341	AGTAT	2	10	430521	430530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017341	CCTTT	2	10	448813	448822	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017341	CATAA	2	10	459633	459642	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017341	TAAAA	2	10	459857	459866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017341	AATAT	2	10	462002	462011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017341	CGCAT	2	10	466517	466526	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017341	AAAGT	2	10	473958	473967	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017341	AAATT	2	10	477148	477157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017341	TTGTA	2	10	478948	478957	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017341	TGAAA	2	10	479330	479339	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017341	TATAA	2	10	479550	479559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017341	GGATT	2	10	479753	479762	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017341	TTAAA	2	10	481333	481342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017341	TAAAG	2	10	487471	487480	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017341	CTCAC	2	10	489376	489385	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_017341	CAAAG	2	10	489401	489410	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017341	TTGTA	2	10	497402	497411	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017341	ATTAT	2	10	497569	497578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017341	ATTTT	2	10	502476	502485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017341	CTTAA	2	10	507110	507119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017341	GAAAA	2	10	517077	517086	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017341	AAAGT	2	10	517140	517149	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017341	TGGTG	2	10	524928	524937	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017341	CAACT	2	10	525494	525503	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017341	GGTAA	2	10	525967	525976	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017341	TCGTG	2	10	526786	526795	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017341	GATTG	2	10	529120	529129	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017341	GATTT	2	10	534030	534039	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017341	ATATA	2	10	536448	536457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017341	CAAAG	2	10	542996	543005	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017341	TTGAT	2	10	546157	546166	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017341	AGACA	2	10	560118	560127	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017341	AAGTA	2	10	562553	562562	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017341	TTAAA	2	10	564677	564686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017341	GATAA	2	10	564716	564725	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017341	GGTAA	2	10	570253	570262	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017341	TCGTG	2	10	571072	571081	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017341	GATTG	2	10	573378	573387	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017341	ATATA	2	10	579994	580003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017341	AAAAT	2	10	584769	584778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017341	TTTAT	2	10	584878	584887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017341	TTATG	2	10	587884	587893	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017341	ATTTA	2	10	588029	588038	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017341	TGAAT	2	10	594301	594310	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017341	GTATA	2	10	594358	594367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017341	TATAA	2	10	598075	598084	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017341	GTTTA	2	10	614241	614250	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017341	TAAAG	2	10	618436	618445	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017341	ATATT	2	10	624546	624555	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017341	TTAAC	2	10	627385	627394	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017341	AATTT	2	10	627470	627479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017341	ATAAA	2	10	635738	635747	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017341	TTATA	2	10	650115	650124	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017341	CACAT	2	10	650511	650520	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017341	ATGAT	2	10	659535	659544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017341	TAATT	2	10	663022	663031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017341	TAAGT	2	10	668007	668016	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017341	TATTG	2	10	669467	669476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017341	AGTTC	2	10	672015	672024	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017341	GACTT	2	10	673508	673517	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017341	TTTAA	2	10	673896	673905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017341	AAATT	2	10	677140	677149	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017341	TAAAT	2	10	679733	679742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017341	AAATT	2	10	681737	681746	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017341	TAAAA	2	10	688876	688885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017341	ATTAA	2	10	691064	691073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017341	TTATT	2	10	691113	691122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017341	CAATA	2	10	691179	691188	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017341	TTAAT	2	10	693804	693813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017341	ATTTT	2	10	696091	696100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017341	ATATA	2	10	696147	696156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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