MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 9234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017341	ATGC	2	8	496	503	25 %	25 %	25 %	25 %	384860683
2	NC_017341	TCAT	2	8	1265	1272	25 %	50 %	0 %	25 %	384860683
3	NC_017341	TAAT	2	8	1634	1641	50 %	50 %	0 %	0 %	384860684
4	NC_017341	ATTA	2	8	1954	1961	50 %	50 %	0 %	0 %	384860684
5	NC_017341	GACT	2	8	2176	2183	25 %	25 %	25 %	25 %	384860684
6	NC_017341	TAAA	2	8	2271	2278	75 %	25 %	0 %	0 %	384860684
7	NC_017341	TTTA	2	8	2332	2339	25 %	75 %	0 %	0 %	384860684
8	NC_017341	TTCA	2	8	2620	2627	25 %	50 %	0 %	25 %	384860684
9	NC_017341	GATG	2	8	2641	2648	25 %	25 %	50 %	0 %	384860684
10	NC_017341	AATT	2	8	2745	2752	50 %	50 %	0 %	0 %	384860684
11	NC_017341	ATTA	2	8	2801	2808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017341	AAAT	2	8	2858	2865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017341	AATT	2	8	3057	3064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017341	ATTA	2	8	3276	3283	50 %	50 %	0 %	0 %	384860685
15	NC_017341	TTCT	2	8	3366	3373	0 %	75 %	0 %	25 %	384860685
16	NC_017341	TCAT	2	8	3377	3384	25 %	50 %	0 %	25 %	384860685
17	NC_017341	GTAT	2	8	4615	4622	25 %	50 %	25 %	0 %	384860687
18	NC_017341	TACG	2	8	5372	5379	25 %	25 %	25 %	25 %	384860687
19	NC_017341	TATC	2	8	5518	5525	25 %	50 %	0 %	25 %	384860687
20	NC_017341	TAGA	2	8	5923	5930	50 %	25 %	25 %	0 %	384860687
21	NC_017341	TGGA	2	8	6049	6056	25 %	25 %	50 %	0 %	384860687
22	NC_017341	AATG	2	8	6272	6279	50 %	25 %	25 %	0 %	384860687
23	NC_017341	TCAA	2	8	6503	6510	50 %	25 %	0 %	25 %	384860688
24	NC_017341	TATC	2	8	6739	6746	25 %	50 %	0 %	25 %	384860688
25	NC_017341	ATGG	2	8	6825	6832	25 %	25 %	50 %	0 %	384860688
26	NC_017341	GGTA	2	8	7016	7023	25 %	25 %	50 %	0 %	384860688
27	NC_017341	TAAG	2	8	7081	7088	50 %	25 %	25 %	0 %	384860688
28	NC_017341	ACAA	2	8	7453	7460	75 %	0 %	0 %	25 %	384860688
29	NC_017341	AGTT	2	8	7888	7895	25 %	50 %	25 %	0 %	384860688
30	NC_017341	GTCA	2	8	8124	8131	25 %	25 %	25 %	25 %	384860688
31	NC_017341	AATA	2	8	8390	8397	75 %	25 %	0 %	0 %	384860688
32	NC_017341	TGTA	2	8	8750	8757	25 %	50 %	25 %	0 %	384860688
33	NC_017341	TGAT	2	8	9040	9047	25 %	50 %	25 %	0 %	384860688
34	NC_017341	GTCA	2	8	9780	9787	25 %	25 %	25 %	25 %	384860689
35	NC_017341	AATG	2	8	11286	11293	50 %	25 %	25 %	0 %	384860690
36	NC_017341	CCAT	2	8	11794	11801	25 %	25 %	0 %	50 %	384860690
37	NC_017341	CAAT	2	8	11857	11864	50 %	25 %	0 %	25 %	384860690
38	NC_017341	TGAT	2	8	11897	11904	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017341	CTAC	2	8	12052	12059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017341	ATTA	2	8	12386	12393	50 %	50 %	0 %	0 %	384860691
41	NC_017341	ATTT	2	8	12916	12923	25 %	75 %	0 %	0 %	384860691
42	NC_017341	GCAA	2	8	13257	13264	50 %	0 %	25 %	25 %	384860691
43	NC_017341	TAAA	2	8	13547	13554	75 %	25 %	0 %	0 %	384860691
44	NC_017341	TAAA	2	8	14012	14019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017341	ATTT	2	8	14612	14619	25 %	75 %	0 %	0 %	384860692
46	NC_017341	GCAA	2	8	15984	15991	50 %	0 %	25 %	25 %	384860694
47	NC_017341	AAGG	2	8	16117	16124	50 %	0 %	50 %	0 %	384860694
48	NC_017341	AAAG	2	8	17126	17133	75 %	0 %	25 %	0 %	384860695
49	NC_017341	AAAG	2	8	17141	17148	75 %	0 %	25 %	0 %	384860695
50	NC_017341	TTAA	2	8	17390	17397	50 %	50 %	0 %	0 %	384860695
51	NC_017341	TAGA	2	8	18173	18180	50 %	25 %	25 %	0 %	384860696
52	NC_017341	ACAA	2	8	18279	18286	75 %	0 %	0 %	25 %	384860696
53	NC_017341	ATGA	2	8	18361	18368	50 %	25 %	25 %	0 %	384860696
54	NC_017341	TAAA	2	8	19085	19092	75 %	25 %	0 %	0 %	384860696
55	NC_017341	CAAC	2	8	19219	19226	50 %	0 %	0 %	50 %	384860696
56	NC_017341	AATT	2	8	19418	19425	50 %	50 %	0 %	0 %	384860696
57	NC_017341	ATTC	2	8	20118	20125	25 %	50 %	0 %	25 %	384860697
58	NC_017341	GTCT	2	8	20289	20296	0 %	50 %	25 %	25 %	384860698
59	NC_017341	TGAA	2	8	20474	20481	50 %	25 %	25 %	0 %	384860698
60	NC_017341	GCAT	2	8	20568	20575	25 %	25 %	25 %	25 %	384860698
61	NC_017341	GGTA	2	8	21075	21082	25 %	25 %	50 %	0 %	384860698
62	NC_017341	GGTT	2	8	22833	22840	0 %	50 %	50 %	0 %	384860699
63	NC_017341	AACA	2	8	23167	23174	75 %	0 %	0 %	25 %	384860699
64	NC_017341	ATCT	2	8	23607	23614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017341	GCCT	2	8	23735	23742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017341	TATT	2	8	24042	24049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017341	GTAC	2	8	24970	24977	25 %	25 %	25 %	25 %	384860700
68	NC_017341	AATC	2	8	25437	25444	50 %	25 %	0 %	25 %	384860701
69	NC_017341	ATCT	2	8	26871	26878	25 %	50 %	0 %	25 %	384860701
70	NC_017341	ACAA	2	8	27530	27537	75 %	0 %	0 %	25 %	384860702
71	NC_017341	AATG	2	8	27634	27641	50 %	25 %	25 %	0 %	384860702
72	NC_017341	TCGT	2	8	27666	27673	0 %	50 %	25 %	25 %	384860702
73	NC_017341	AACA	2	8	28111	28118	75 %	0 %	0 %	25 %	384860702
74	NC_017341	TAAA	2	8	28425	28432	75 %	25 %	0 %	0 %	384860703
75	NC_017341	CAAT	2	8	28763	28770	50 %	25 %	0 %	25 %	384860703
76	NC_017341	GATG	2	8	28771	28778	25 %	25 %	50 %	0 %	384860703
77	NC_017341	TACT	2	8	28993	29000	25 %	50 %	0 %	25 %	384860703
78	NC_017341	CATT	2	8	29252	29259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017341	GGCA	2	8	29691	29698	25 %	0 %	50 %	25 %	384860704
80	NC_017341	AAAG	2	8	29704	29711	75 %	0 %	25 %	0 %	384860704
81	NC_017341	GAAC	2	8	30148	30155	50 %	0 %	25 %	25 %	384860704
82	NC_017341	ATCA	2	8	30393	30400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017341	CAAC	2	8	30658	30665	50 %	0 %	0 %	50 %	384860705
84	NC_017341	ACAA	2	8	30699	30706	75 %	0 %	0 %	25 %	384860705
85	NC_017341	TACA	2	8	30913	30920	50 %	25 %	0 %	25 %	384860705
86	NC_017341	GATT	2	8	31778	31785	25 %	50 %	25 %	0 %	384860705
87	NC_017341	GACT	2	8	31886	31893	25 %	25 %	25 %	25 %	384860705
88	NC_017341	TAAA	2	8	32182	32189	75 %	25 %	0 %	0 %	384860705
89	NC_017341	ATGA	2	8	32241	32248	50 %	25 %	25 %	0 %	384860705
90	NC_017341	GGAA	2	8	32591	32598	50 %	0 %	50 %	0 %	384860705
91	NC_017341	AGCT	2	8	32768	32775	25 %	25 %	25 %	25 %	384860705
92	NC_017341	AAGC	2	8	33193	33200	50 %	0 %	25 %	25 %	384860707
93	NC_017341	TTCT	2	8	33743	33750	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017341	ATAA	2	8	33781	33788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017341	ATTA	2	8	33873	33880	50 %	50 %	0 %	0 %	384860708
96	NC_017341	GGAT	2	8	34089	34096	25 %	25 %	50 %	0 %	384860708
97	NC_017341	AATA	2	8	34237	34244	75 %	25 %	0 %	0 %	384860708
98	NC_017341	TGAA	2	8	34373	34380	50 %	25 %	25 %	0 %	384860708
99	NC_017341	AAGA	2	8	34735	34742	75 %	0 %	25 %	0 %	384860708
100	NC_017341	ACAT	2	8	35414	35421	50 %	25 %	0 %	25 %	384860709
101	NC_017341	AAGA	2	8	35648	35655	75 %	0 %	25 %	0 %	384860709
102	NC_017341	ATTT	2	8	35874	35881	25 %	75 %	0 %	0 %	384860710
103	NC_017341	TAAA	2	8	35976	35983	75 %	25 %	0 %	0 %	384860710
104	NC_017341	TTTA	2	8	36419	36426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017341	TCTT	2	8	36727	36734	0 %	75 %	0 %	25 %	384860711
106	NC_017341	ATGT	2	8	36961	36968	25 %	50 %	25 %	0 %	384860711
107	NC_017341	CATG	2	8	37798	37805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017341	CAAC	2	8	37985	37992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017341	CTTT	2	8	38117	38124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017341	ACAT	2	8	38443	38450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017341	AAGA	2	8	38518	38525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017341	AGTT	2	8	38631	38638	25 %	50 %	25 %	0 %	384860712
113	NC_017341	TGGT	2	8	39059	39066	0 %	50 %	50 %	0 %	384860712
114	NC_017341	AATC	2	8	39236	39243	50 %	25 %	0 %	25 %	384860712
115	NC_017341	GTTT	2	8	39256	39263	0 %	75 %	25 %	0 %	384860712
116	NC_017341	TTGC	2	8	39489	39496	0 %	50 %	25 %	25 %	384860712
117	NC_017341	CGTT	2	8	39670	39677	0 %	50 %	25 %	25 %	384860712
118	NC_017341	CTTT	2	8	40001	40008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017341	TAAT	2	8	40815	40822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017341	GAAG	2	8	41121	41128	50 %	0 %	50 %	0 %	384860714
121	NC_017341	TTCT	2	8	41692	41699	0 %	75 %	0 %	25 %	384860714
122	NC_017341	TCTT	2	8	42073	42080	0 %	75 %	0 %	25 %	384860715
123	NC_017341	ATGT	2	8	42307	42314	25 %	50 %	25 %	0 %	384860715
124	NC_017341	AAAT	2	8	43079	43086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017341	TTAA	2	8	43791	43798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017341	TCAT	2	8	43968	43975	25 %	50 %	0 %	25 %	384860717
127	NC_017341	AAAC	2	8	44476	44483	75 %	0 %	0 %	25 %	384860717
128	NC_017341	AAGA	2	8	44649	44656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017341	GCAT	2	8	44829	44836	25 %	25 %	25 %	25 %	384860718
130	NC_017341	TAGC	2	8	45216	45223	25 %	25 %	25 %	25 %	384860719
131	NC_017341	TTTA	2	8	45404	45411	25 %	75 %	0 %	0 %	384860719
132	NC_017341	TTTG	2	8	45629	45636	0 %	75 %	25 %	0 %	384860719
133	NC_017341	CATA	2	8	46027	46034	50 %	25 %	0 %	25 %	384860719
134	NC_017341	TAGT	2	8	46165	46172	25 %	50 %	25 %	0 %	384860719
135	NC_017341	ATGT	2	8	46210	46217	25 %	50 %	25 %	0 %	384860719
136	NC_017341	GTTT	2	8	46835	46842	0 %	75 %	25 %	0 %	384860719
137	NC_017341	ATGA	2	8	47822	47829	50 %	25 %	25 %	0 %	384860720
138	NC_017341	ATAA	2	8	48080	48087	75 %	25 %	0 %	0 %	384860720
139	NC_017341	TGTA	2	8	48205	48212	25 %	50 %	25 %	0 %	384860720
140	NC_017341	ATTT	2	8	48428	48435	25 %	75 %	0 %	0 %	384860720
141	NC_017341	AAAC	2	8	48586	48593	75 %	0 %	0 %	25 %	384860720
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143	NC_017341	ATGG	2	8	48864	48871	25 %	25 %	50 %	0 %	384860720
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