MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 plasmid pSaa6159

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017339	GGTTG	2	10	265	274	0 %	40 %	60 %	0 %	384551480
2	NC_017339	AATAT	2	10	751	760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017339	TTAAA	2	10	1292	1301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017339	TGTGA	2	10	2940	2949	20 %	40 %	40 %	0 %	384551482
5	NC_017339	GCTGT	2	10	3481	3490	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017339	AAAGT	2	10	4163	4172	60 %	20 %	20 %	0 %	384551483
7	NC_017339	AACTA	2	10	4851	4860	60 %	20 %	0 %	20 %	384551484
8	NC_017339	AAATC	2	10	5023	5032	60 %	20 %	0 %	20 %	384551484
9	NC_017339	AAATT	2	10	7289	7298	60 %	40 %	0 %	0 %	384551486
10	NC_017339	ATATT	2	10	8239	8248	40 %	60 %	0 %	0 %	384551487
11	NC_017339	TAATT	2	10	8656	8665	40 %	60 %	0 %	0 %	384551488
12	NC_017339	TTGAG	2	10	8668	8677	20 %	40 %	40 %	0 %	384551488
13	NC_017339	GTATC	2	10	9596	9605	20 %	40 %	20 %	20 %	384551488
14	NC_017339	TATTT	2	10	9606	9615	20 %	80 %	0 %	0 %	384551488
15	NC_017339	TTATG	2	10	9800	9809	20 %	60 %	20 %	0 %	384551488
16	NC_017339	AATTA	2	10	10625	10634	60 %	40 %	0 %	0 %	384551489
17	NC_017339	TGATT	2	10	11960	11969	20 %	60 %	20 %	0 %	384551490
18	NC_017339	AACAA	2	10	12276	12285	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017339	TATTT	2	10	12332	12341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017339	AAACA	2	10	12652	12661	80 %	0 %	0 %	20 %	384551491
21	NC_017339	ATAAA	2	10	13976	13985	80 %	20 %	0 %	0 %	384551492
22	NC_017339	TACTT	2	10	15137	15146	20 %	60 %	0 %	20 %	384551494
23	NC_017339	ATGAA	2	10	17559	17568	60 %	20 %	20 %	0 %	384551498
24	NC_017339	TAACG	2	10	19070	19079	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.