MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 plasmid pSaa6159

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017339	ATTT	2	8	292	299	25 %	75 %	0 %	0 %	384551480
2	NC_017339	AAAG	2	8	363	370	75 %	0 %	25 %	0 %	384551480
3	NC_017339	AAGA	2	8	399	406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017339	TTTA	2	8	432	439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017339	AAAT	2	8	602	609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017339	ATGA	2	8	613	620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017339	AATC	2	8	765	772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017339	TAAA	2	8	926	933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017339	TAAT	2	8	976	983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017339	TGTA	2	8	1144	1151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017339	CATT	2	8	1241	1248	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017339	TTTC	2	8	1612	1619	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017339	AATT	2	8	1708	1715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017339	TTAT	2	8	1931	1938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017339	TTAG	2	8	2439	2446	25 %	50 %	25 %	0 %	384551481
16	NC_017339	TGAA	2	8	2584	2591	50 %	25 %	25 %	0 %	384551481
17	NC_017339	TTAC	2	8	2706	2713	25 %	50 %	0 %	25 %	384551481
18	NC_017339	TTTA	2	8	2846	2853	25 %	75 %	0 %	0 %	384551481
19	NC_017339	TATC	2	8	3348	3355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017339	TAAT	2	8	3528	3535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017339	TGGA	2	8	4221	4228	25 %	25 %	50 %	0 %	384551483
22	NC_017339	ATGT	2	8	4339	4346	25 %	50 %	25 %	0 %	384551483
23	NC_017339	TCAT	2	8	4441	4448	25 %	50 %	0 %	25 %	384551483
24	NC_017339	TTAA	2	8	4507	4514	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
25	NC_017339	TAAA	2	8	4694	4701	75 %	25 %	0 %	0 %	384551483
26	NC_017339	ATGA	2	8	4709	4716	50 %	25 %	25 %	0 %	384551483
27	NC_017339	CATA	2	8	4734	4741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017339	AATA	2	8	5166	5173	75 %	25 %	0 %	0 %	384551484
29	NC_017339	GTTT	2	8	5386	5393	0 %	75 %	25 %	0 %	384551484
30	NC_017339	TTAA	2	8	5723	5730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017339	AATG	2	8	5970	5977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017339	TGAA	2	8	5983	5990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017339	TTAG	2	8	7059	7066	25 %	50 %	25 %	0 %	384551485
34	NC_017339	TAAG	2	8	7193	7200	50 %	25 %	25 %	0 %	384551486
35	NC_017339	TCGT	2	8	7404	7411	0 %	50 %	25 %	25 %	384551486
36	NC_017339	ATCT	2	8	7457	7464	25 %	50 %	0 %	25 %	384551486
37	NC_017339	CTTA	2	8	7760	7767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017339	AAAT	2	8	8094	8101	75 %	25 %	0 %	0 %	384551487
39	NC_017339	TCCA	2	8	8614	8621	25 %	25 %	0 %	50 %	384551488
40	NC_017339	TAAA	2	8	8859	8866	75 %	25 %	0 %	0 %	384551488
41	NC_017339	CTTT	2	8	8902	8909	0 %	75 %	0 %	25 %	384551488
42	NC_017339	TCTT	2	8	8932	8939	0 %	75 %	0 %	25 %	384551488
43	NC_017339	AATT	2	8	9114	9121	50 %	50 %	0 %	0 %	384551488
44	NC_017339	ATTA	2	8	9153	9160	50 %	50 %	0 %	0 %	384551488
45	NC_017339	AATG	2	8	9193	9200	50 %	25 %	25 %	0 %	384551488
46	NC_017339	TCTT	2	8	9335	9342	0 %	75 %	0 %	25 %	384551488
47	NC_017339	ACTT	2	8	9824	9831	25 %	50 %	0 %	25 %	384551488
48	NC_017339	AGCA	2	8	9909	9916	50 %	0 %	25 %	25 %	384551488
49	NC_017339	TAAA	2	8	10394	10401	75 %	25 %	0 %	0 %	384551489
50	NC_017339	TAAA	2	8	10691	10698	75 %	25 %	0 %	0 %	384551489
51	NC_017339	TTAA	2	8	10780	10787	50 %	50 %	0 %	0 %	384551489
52	NC_017339	ATTT	2	8	11113	11120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017339	ATAA	2	8	11168	11175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017339	ATTA	2	8	11342	11349	50 %	50 %	0 %	0 %	384551490
55	NC_017339	ATTG	2	8	11553	11560	25 %	50 %	25 %	0 %	384551490
56	NC_017339	CAAT	2	8	11889	11896	50 %	25 %	0 %	25 %	384551490
57	NC_017339	TATT	2	8	12199	12206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017339	TCAT	2	8	13421	13428	25 %	50 %	0 %	25 %	384551492
59	NC_017339	TTAA	2	8	13801	13808	50 %	50 %	0 %	0 %	384551492
60	NC_017339	GGAT	2	8	14044	14051	25 %	25 %	50 %	0 %	384551492
61	NC_017339	AAAG	2	8	15347	15354	75 %	0 %	25 %	0 %	384551494
62	NC_017339	CATA	2	8	15662	15669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017339	TAAG	2	8	15991	15998	50 %	25 %	25 %	0 %	384551495
64	NC_017339	ATTA	2	8	16127	16134	50 %	50 %	0 %	0 %	384551495
65	NC_017339	AGAT	2	8	16367	16374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017339	AAAG	2	8	16898	16905	75 %	0 %	25 %	0 %	384551496
67	NC_017339	TCAA	2	8	16936	16943	50 %	25 %	0 %	25 %	384551496
68	NC_017339	GATA	2	8	17048	17055	50 %	25 %	25 %	0 %	384551496
69	NC_017339	TTTG	2	8	17167	17174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017339	ATTT	2	8	17607	17614	25 %	75 %	0 %	0 %	384551498
71	NC_017339	AGAT	2	8	18237	18244	50 %	25 %	25 %	0 %	384551498
72	NC_017339	AGAA	2	8	18342	18349	75 %	0 %	25 %	0 %	384551498
73	NC_017339	TCCT	2	8	18600	18607	0 %	50 %	0 %	50 %	384551499
74	NC_017339	TTAA	2	8	18658	18665	50 %	50 %	0 %	0 %	384551499
75	NC_017339	TTTC	2	8	18765	18772	0 %	75 %	0 %	25 %	384551499
76	NC_017339	CATT	2	8	18798	18805	25 %	50 %	0 %	25 %	384551499
77	NC_017339	TCAT	2	8	19122	19129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017339	ATAA	2	8	19250	19257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017339	ATTT	2	8	19338	19345	25 %	75 %	0 %	0 %	384551500
80	NC_017339	TTTG	2	8	19587	19594	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017339	TTAA	2	8	19672	19679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017339	TCTT	2	8	20063	20070	0 %	75 %	0 %	25 %	384551501
83	NC_017339	TTTA	2	8	20696	20703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.