MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 plasmid pSaa6159

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017339	ATTT	2	8	292	299	25 %	75 %	0 %	0 %	384551480
2	NC_017339	AAAG	2	8	363	370	75 %	0 %	25 %	0 %	384551480
3	NC_017339	TTAG	2	8	2439	2446	25 %	50 %	25 %	0 %	384551481
4	NC_017339	TGAA	2	8	2584	2591	50 %	25 %	25 %	0 %	384551481
5	NC_017339	TTAC	2	8	2706	2713	25 %	50 %	0 %	25 %	384551481
6	NC_017339	TTTA	2	8	2846	2853	25 %	75 %	0 %	0 %	384551481
7	NC_017339	TGGA	2	8	4221	4228	25 %	25 %	50 %	0 %	384551483
8	NC_017339	ATGT	2	8	4339	4346	25 %	50 %	25 %	0 %	384551483
9	NC_017339	TCAT	2	8	4441	4448	25 %	50 %	0 %	25 %	384551483
10	NC_017339	TTAA	2	8	4507	4514	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
11	NC_017339	TAAA	2	8	4694	4701	75 %	25 %	0 %	0 %	384551483
12	NC_017339	ATGA	2	8	4709	4716	50 %	25 %	25 %	0 %	384551483
13	NC_017339	AATA	2	8	5166	5173	75 %	25 %	0 %	0 %	384551484
14	NC_017339	GTTT	2	8	5386	5393	0 %	75 %	25 %	0 %	384551484
15	NC_017339	TTAG	2	8	7059	7066	25 %	50 %	25 %	0 %	384551485
16	NC_017339	TAAG	2	8	7193	7200	50 %	25 %	25 %	0 %	384551486
17	NC_017339	TCGT	2	8	7404	7411	0 %	50 %	25 %	25 %	384551486
18	NC_017339	ATCT	2	8	7457	7464	25 %	50 %	0 %	25 %	384551486
19	NC_017339	AAAT	2	8	8094	8101	75 %	25 %	0 %	0 %	384551487
20	NC_017339	TCCA	2	8	8614	8621	25 %	25 %	0 %	50 %	384551488
21	NC_017339	TAAA	2	8	8859	8866	75 %	25 %	0 %	0 %	384551488
22	NC_017339	CTTT	2	8	8902	8909	0 %	75 %	0 %	25 %	384551488
23	NC_017339	TCTT	2	8	8932	8939	0 %	75 %	0 %	25 %	384551488
24	NC_017339	AATT	2	8	9114	9121	50 %	50 %	0 %	0 %	384551488
25	NC_017339	ATTA	2	8	9153	9160	50 %	50 %	0 %	0 %	384551488
26	NC_017339	AATG	2	8	9193	9200	50 %	25 %	25 %	0 %	384551488
27	NC_017339	TCTT	2	8	9335	9342	0 %	75 %	0 %	25 %	384551488
28	NC_017339	ACTT	2	8	9824	9831	25 %	50 %	0 %	25 %	384551488
29	NC_017339	AGCA	2	8	9909	9916	50 %	0 %	25 %	25 %	384551488
30	NC_017339	TAAA	2	8	10394	10401	75 %	25 %	0 %	0 %	384551489
31	NC_017339	TAAA	2	8	10691	10698	75 %	25 %	0 %	0 %	384551489
32	NC_017339	TTAA	2	8	10780	10787	50 %	50 %	0 %	0 %	384551489
33	NC_017339	ATTA	2	8	11342	11349	50 %	50 %	0 %	0 %	384551490
34	NC_017339	ATTG	2	8	11553	11560	25 %	50 %	25 %	0 %	384551490
35	NC_017339	CAAT	2	8	11889	11896	50 %	25 %	0 %	25 %	384551490
36	NC_017339	TCAT	2	8	13421	13428	25 %	50 %	0 %	25 %	384551492
37	NC_017339	TTAA	2	8	13801	13808	50 %	50 %	0 %	0 %	384551492
38	NC_017339	GGAT	2	8	14044	14051	25 %	25 %	50 %	0 %	384551492
39	NC_017339	AAAG	2	8	15347	15354	75 %	0 %	25 %	0 %	384551494
40	NC_017339	TAAG	2	8	15991	15998	50 %	25 %	25 %	0 %	384551495
41	NC_017339	ATTA	2	8	16127	16134	50 %	50 %	0 %	0 %	384551495
42	NC_017339	AAAG	2	8	16898	16905	75 %	0 %	25 %	0 %	384551496
43	NC_017339	TCAA	2	8	16936	16943	50 %	25 %	0 %	25 %	384551496
44	NC_017339	GATA	2	8	17048	17055	50 %	25 %	25 %	0 %	384551496
45	NC_017339	ATTT	2	8	17607	17614	25 %	75 %	0 %	0 %	384551498
46	NC_017339	AGAT	2	8	18237	18244	50 %	25 %	25 %	0 %	384551498
47	NC_017339	AGAA	2	8	18342	18349	75 %	0 %	25 %	0 %	384551498
48	NC_017339	TCCT	2	8	18600	18607	0 %	50 %	0 %	50 %	384551499
49	NC_017339	TTAA	2	8	18658	18665	50 %	50 %	0 %	0 %	384551499
50	NC_017339	TTTC	2	8	18765	18772	0 %	75 %	0 %	25 %	384551499
51	NC_017339	CATT	2	8	18798	18805	25 %	50 %	0 %	25 %	384551499
52	NC_017339	ATTT	2	8	19338	19345	25 %	75 %	0 %	0 %	384551500
53	NC_017339	TCTT	2	8	20063	20070	0 %	75 %	0 %	25 %	384551501

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.