MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 plasmid pSaa6159

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017339	AAT	2	6	4	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551480
2	NC_017339	ATT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
3	NC_017339	TTA	2	6	62	67	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
4	NC_017339	TAT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
5	NC_017339	ACA	2	6	122	127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551480
6	NC_017339	ATG	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551480
7	NC_017339	TTA	2	6	300	305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
8	NC_017339	TAT	2	6	2282	2287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
9	NC_017339	GTT	2	6	2298	2303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551481
10	NC_017339	GCT	3	9	2304	2312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551481
11	NC_017339	CAG	2	6	2329	2334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551481
12	NC_017339	TTA	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
13	NC_017339	TTA	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
14	NC_017339	TAT	2	6	2426	2431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
15	NC_017339	ATG	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551481
16	NC_017339	ATA	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551481
17	NC_017339	TCT	2	6	2740	2745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551481
18	NC_017339	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551481
19	NC_017339	TTA	3	9	2851	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
20	NC_017339	AGA	2	6	2993	2998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
21	NC_017339	TGA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551482
22	NC_017339	GAA	2	6	3047	3052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
23	NC_017339	AGA	2	6	3080	3085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
24	NC_017339	CAT	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551482
25	NC_017339	ATT	2	6	3208	3213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551482
26	NC_017339	TTA	2	6	3214	3219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551482
27	NC_017339	AGG	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384551482
28	NC_017339	TCA	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551483
29	NC_017339	AGA	2	6	3801	3806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
30	NC_017339	AGT	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
31	NC_017339	TAA	2	6	3840	3845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
32	NC_017339	CAG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551483
33	NC_017339	AGT	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
34	NC_017339	ATA	2	6	3898	3903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
35	NC_017339	ATT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551483
36	NC_017339	GAA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
37	NC_017339	AGA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
38	NC_017339	TGA	2	6	4377	4382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
39	NC_017339	AAT	2	6	4426	4431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
40	NC_017339	ATA	2	6	4673	4678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
41	NC_017339	TAT	2	6	4834	4839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551484
42	NC_017339	TAA	2	6	4976	4981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551484
43	NC_017339	TCG	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551484
44	NC_017339	TCA	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551484
45	NC_017339	CTA	2	6	5249	5254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551484
46	NC_017339	ACA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551484
47	NC_017339	CTG	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551484
48	NC_017339	ATA	3	9	6519	6527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551485
49	NC_017339	TGA	2	6	6672	6677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551485
50	NC_017339	TAA	2	6	6709	6714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551485
51	NC_017339	ATT	2	6	6749	6754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551485
52	NC_017339	TCA	2	6	6834	6839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551485
53	NC_017339	TCC	2	6	7096	7101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384551486
54	NC_017339	TTG	2	6	7124	7129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551486
55	NC_017339	TGC	2	6	7257	7262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551486
56	NC_017339	GAA	2	6	7276	7281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551486
57	NC_017339	TGC	2	6	7317	7322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551486
58	NC_017339	ATA	2	6	7334	7339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551486
59	NC_017339	TCT	2	6	7378	7383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551486
60	NC_017339	TCC	2	6	7438	7443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384551486
61	NC_017339	ACA	2	6	7474	7479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551486
62	NC_017339	TCC	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384551486
63	NC_017339	TTC	2	6	7952	7957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
64	NC_017339	TTC	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
65	NC_017339	TTA	2	6	8031	8036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551487
66	NC_017339	TCT	2	6	8070	8075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
67	NC_017339	TGA	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551487
68	NC_017339	CTT	2	6	8179	8184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
69	NC_017339	TTA	2	6	8330	8335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
70	NC_017339	ATA	2	6	8385	8390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
71	NC_017339	ACC	2	6	8423	8428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384551488
72	NC_017339	ATT	2	6	8430	8435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
73	NC_017339	AAT	2	6	8503	8508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
74	NC_017339	GAA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551488
75	NC_017339	CAT	2	6	8559	8564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551488
76	NC_017339	CTT	2	6	9143	9148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551488
77	NC_017339	TTG	2	6	9214	9219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551488
78	NC_017339	ATA	2	6	9247	9252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
79	NC_017339	ATT	2	6	9288	9293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
80	NC_017339	ATA	3	9	9373	9381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
81	NC_017339	TAT	2	6	9447	9452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
82	NC_017339	ATA	2	6	9505	9510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
83	NC_017339	ATA	2	6	9665	9670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
84	NC_017339	ATA	2	6	9697	9702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
85	NC_017339	TGG	2	6	9791	9796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384551488
86	NC_017339	ATT	2	6	9849	9854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
87	NC_017339	ATT	2	6	9858	9863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
88	NC_017339	TAC	2	6	10014	10019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551488
89	NC_017339	ATT	2	6	10024	10029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
90	NC_017339	CTT	2	6	10052	10057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551488
91	NC_017339	TAA	2	6	10069	10074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
92	NC_017339	TAA	2	6	10386	10391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551489
93	NC_017339	GAT	2	6	10420	10425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551489
94	NC_017339	ATA	2	6	10514	10519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551489
95	NC_017339	AAC	2	6	10568	10573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551489
96	NC_017339	CTG	2	6	10670	10675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551489
97	NC_017339	TAA	3	9	10758	10766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551489
98	NC_017339	ATG	2	6	10856	10861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551489
99	NC_017339	TTG	2	6	11368	11373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551490
100	NC_017339	ATC	2	6	11387	11392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551490
101	NC_017339	AAG	2	6	11503	11508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551490
102	NC_017339	GTA	2	6	11541	11546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551490
103	NC_017339	ATG	2	6	11575	11580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551490
104	NC_017339	ATT	2	6	11599	11604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551490
105	NC_017339	AAG	2	6	11614	11619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551490
106	NC_017339	ATG	2	6	11646	11651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551490
107	NC_017339	ATT	2	6	11700	11705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551490
108	NC_017339	TAT	2	6	11849	11854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551490
109	NC_017339	ATC	2	6	11857	11862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551490
110	NC_017339	AGA	2	6	11879	11884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551490
111	NC_017339	AAG	2	6	11911	11916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551490
112	NC_017339	TAA	2	6	11970	11975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551490
113	NC_017339	TTA	2	6	12440	12445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551491
114	NC_017339	TGG	2	6	12487	12492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384551491
115	NC_017339	TTA	2	6	12532	12537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551491
116	NC_017339	CAG	2	6	12567	12572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551491
117	NC_017339	GTG	2	6	12594	12599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384551491
118	NC_017339	ATT	2	6	12768	12773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551492
119	NC_017339	TAT	2	6	12791	12796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551492
120	NC_017339	TAT	2	6	12809	12814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551492
121	NC_017339	TTC	2	6	12823	12828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551492
122	NC_017339	GAA	2	6	12838	12843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551492
123	NC_017339	AAT	2	6	12954	12959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551492
124	NC_017339	ATA	2	6	12980	12985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551492
125	NC_017339	AAT	2	6	13018	13023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551492
126	NC_017339	TAA	2	6	13038	13043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551492
127	NC_017339	TTA	2	6	13069	13074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551492
128	NC_017339	TAT	2	6	13096	13101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551492
129	NC_017339	ATT	2	6	13102	13107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551492
130	NC_017339	AGA	2	6	13125	13130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551492
131	NC_017339	ATT	2	6	13194	13199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551492
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.