MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 plasmid pSaa6159

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017339	AT	3	6	189	194	50 %	50 %	0 %	0 %	384551480
2	NC_017339	AT	3	6	326	331	50 %	50 %	0 %	0 %	384551480
3	NC_017339	CA	3	6	1190	1195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017339	AT	3	6	1457	1462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017339	TA	3	6	1494	1499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017339	AG	3	6	2566	2571	50 %	0 %	50 %	0 %	384551481
7	NC_017339	TA	3	6	2832	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	384551481
8	NC_017339	TG	3	6	3091	3096	0 %	50 %	50 %	0 %	384551482
9	NC_017339	TA	3	6	3160	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	384551482
10	NC_017339	AG	3	6	3234	3239	50 %	0 %	50 %	0 %	384551482
11	NC_017339	TA	3	6	3319	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017339	TC	3	6	3395	3400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017339	AG	3	6	3419	3424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017339	AT	3	6	3702	3707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017339	AT	3	6	3738	3743	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
16	NC_017339	TA	3	6	4032	4037	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
17	NC_017339	CA	3	6	4366	4371	50 %	0 %	0 %	50 %	384551483
18	NC_017339	TA	3	6	4740	4745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017339	AT	3	6	4765	4770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017339	AT	3	6	5057	5062	50 %	50 %	0 %	0 %	384551484
21	NC_017339	AT	3	6	5266	5271	50 %	50 %	0 %	0 %	384551484
22	NC_017339	TA	3	6	5363	5368	50 %	50 %	0 %	0 %	384551484
23	NC_017339	AC	3	6	5871	5876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017339	TA	3	6	6205	6210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017339	CA	3	6	6393	6398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017339	GA	3	6	6676	6681	50 %	0 %	50 %	0 %	384551485
27	NC_017339	AT	3	6	9206	9211	50 %	50 %	0 %	0 %	384551488
28	NC_017339	AT	3	6	9451	9456	50 %	50 %	0 %	0 %	384551488
29	NC_017339	TA	3	6	11153	11158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017339	AT	3	6	11277	11282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017339	AG	3	6	11732	11737	50 %	0 %	50 %	0 %	384551490
32	NC_017339	TA	3	6	11794	11799	50 %	50 %	0 %	0 %	384551490
33	NC_017339	AG	3	6	12066	12071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017339	CT	4	8	12082	12089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017339	TA	3	6	12167	12172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017339	TA	4	8	12264	12271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017339	AT	3	6	12684	12689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017339	AG	3	6	13078	13083	50 %	0 %	50 %	0 %	384551492
39	NC_017339	AT	3	6	13412	13417	50 %	50 %	0 %	0 %	384551492
40	NC_017339	AT	4	8	13685	13692	50 %	50 %	0 %	0 %	384551492
41	NC_017339	AT	3	6	13790	13795	50 %	50 %	0 %	0 %	384551492
42	NC_017339	AT	4	8	15186	15193	50 %	50 %	0 %	0 %	384551494
43	NC_017339	AT	3	6	17227	17232	50 %	50 %	0 %	0 %	384551497
44	NC_017339	GA	3	6	17538	17543	50 %	0 %	50 %	0 %	384551498
45	NC_017339	TA	3	6	17550	17555	50 %	50 %	0 %	0 %	384551498
46	NC_017339	AG	3	6	18506	18511	50 %	0 %	50 %	0 %	384551499
47	NC_017339	AT	3	6	18545	18550	50 %	50 %	0 %	0 %	384551499
48	NC_017339	AG	4	8	18709	18716	50 %	0 %	50 %	0 %	384551499
49	NC_017339	AT	3	6	18931	18936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017339	CT	3	6	19142	19147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017339	GA	3	6	19165	19170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017339	TC	3	6	19196	19201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017339	TA	3	6	19238	19243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017339	AT	3	6	19834	19839	50 %	50 %	0 %	0 %	384551501
55	NC_017339	CT	3	6	20022	20027	0 %	50 %	0 %	50 %	384551501
56	NC_017339	TA	3	6	20702	20707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017339	TA	3	6	20725	20730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.