MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 plasmid pSaa6159

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017339	AT	3	6	189	194	50 %	50 %	0 %	0 %	384551480
2	NC_017339	AT	3	6	326	331	50 %	50 %	0 %	0 %	384551480
3	NC_017339	AG	3	6	2566	2571	50 %	0 %	50 %	0 %	384551481
4	NC_017339	TA	3	6	2832	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	384551481
5	NC_017339	TG	3	6	3091	3096	0 %	50 %	50 %	0 %	384551482
6	NC_017339	TA	3	6	3160	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	384551482
7	NC_017339	AG	3	6	3234	3239	50 %	0 %	50 %	0 %	384551482
8	NC_017339	AT	3	6	3738	3743	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
9	NC_017339	TA	3	6	4032	4037	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
10	NC_017339	CA	3	6	4366	4371	50 %	0 %	0 %	50 %	384551483
11	NC_017339	AT	3	6	5057	5062	50 %	50 %	0 %	0 %	384551484
12	NC_017339	AT	3	6	5266	5271	50 %	50 %	0 %	0 %	384551484
13	NC_017339	TA	3	6	5363	5368	50 %	50 %	0 %	0 %	384551484
14	NC_017339	GA	3	6	6676	6681	50 %	0 %	50 %	0 %	384551485
15	NC_017339	AT	3	6	9206	9211	50 %	50 %	0 %	0 %	384551488
16	NC_017339	AT	3	6	9451	9456	50 %	50 %	0 %	0 %	384551488
17	NC_017339	AG	3	6	11732	11737	50 %	0 %	50 %	0 %	384551490
18	NC_017339	TA	3	6	11794	11799	50 %	50 %	0 %	0 %	384551490
19	NC_017339	AG	3	6	13078	13083	50 %	0 %	50 %	0 %	384551492
20	NC_017339	AT	3	6	13412	13417	50 %	50 %	0 %	0 %	384551492
21	NC_017339	AT	4	8	13685	13692	50 %	50 %	0 %	0 %	384551492
22	NC_017339	AT	3	6	13790	13795	50 %	50 %	0 %	0 %	384551492
23	NC_017339	AT	4	8	15186	15193	50 %	50 %	0 %	0 %	384551494
24	NC_017339	AT	3	6	17227	17232	50 %	50 %	0 %	0 %	384551497
25	NC_017339	GA	3	6	17538	17543	50 %	0 %	50 %	0 %	384551498
26	NC_017339	TA	3	6	17550	17555	50 %	50 %	0 %	0 %	384551498
27	NC_017339	AG	3	6	18506	18511	50 %	0 %	50 %	0 %	384551499
28	NC_017339	AT	3	6	18545	18550	50 %	50 %	0 %	0 %	384551499
29	NC_017339	AG	4	8	18709	18716	50 %	0 %	50 %	0 %	384551499
30	NC_017339	AT	3	6	19834	19839	50 %	50 %	0 %	0 %	384551501
31	NC_017339	CT	3	6	20022	20027	0 %	50 %	0 %	50 %	384551501

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.