MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 1553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017338	GTTGAA	2	12	2675	2686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548925
2	NC_017338	ATAAAT	2	12	2776	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017338	TTTAAA	2	12	2953	2964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017338	GTTATC	2	12	6781	6792	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384548929
5	NC_017338	CAGATA	2	12	7690	7701	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384548929
6	NC_017338	CAAGCT	2	12	7749	7760	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384548929
7	NC_017338	GTAATG	2	12	8737	8748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548929
8	NC_017338	AGATGA	2	12	9131	9142	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384548929
9	NC_017338	ACAATT	2	12	10728	10739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384548931
10	NC_017338	TAGCAT	2	12	10823	10834	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384548931
11	NC_017338	TAAATC	2	12	16636	16647	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017338	GCTTTA	2	12	16914	16925	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384548936
13	NC_017338	TTTGAA	2	12	17735	17746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384548936
14	NC_017338	TAAAGG	2	12	19782	19793	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384548938
15	NC_017338	TTGAAG	2	12	19979	19990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548938
16	NC_017338	TGAAAT	2	12	21514	21525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384548939
17	NC_017338	AAGGAA	2	12	21953	21964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548940
18	NC_017338	TGAATT	2	12	24868	24879	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384548941
19	NC_017338	ATTTCA	2	12	27352	27363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384548943
20	NC_017338	GTTCTG	2	12	28651	28662	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384548944
21	NC_017338	ATCAGC	2	12	30667	30678	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384548946
22	NC_017338	AAAAGA	2	12	33308	33319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384548947
23	NC_017338	ACATCT	2	12	34962	34973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548948
24	NC_017338	GTTTAA	2	12	36105	36116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384548950
25	NC_017338	AAAAAT	2	12	37836	37847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017338	AATGAA	2	12	39072	39083	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384548953
27	NC_017338	ACAACT	2	12	41137	41148	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384548954
28	NC_017338	GCTAAA	2	12	42376	42387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017338	GTATGA	2	12	49662	49673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548962
30	NC_017338	AATTAA	2	12	52468	52479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017338	GAAGGT	2	12	54438	54449	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384548965
32	NC_017338	TATTAA	2	12	57501	57512	50 %	50 %	0 %	0 %	384548970
33	NC_017338	ATGATT	2	12	58888	58899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017338	ATTTAA	2	12	59140	59151	50 %	50 %	0 %	0 %	384548971
35	NC_017338	TGGTAC	2	12	64744	64755	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384548975
36	NC_017338	AAGAAA	2	12	68701	68712	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384548976
37	NC_017338	CCAAAC	2	12	70688	70699	50 %	0 %	0 %	50 %	384548979
38	NC_017338	GGGCTT	2	12	72027	72038	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384548980
39	NC_017338	ACCCTT	2	12	78517	78528	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384548986
40	NC_017338	TTTAGC	2	12	83642	83653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384548992
41	NC_017338	AAATAA	2	12	83693	83704	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384548992
42	NC_017338	TACAAG	2	12	88172	88183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384548997
43	NC_017338	AATGAA	2	12	89405	89416	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384548998
44	NC_017338	ACGGCA	2	12	89689	89700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548999
45	NC_017338	GTAGAA	2	12	94271	94282	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384549002
46	NC_017338	AACCAC	2	12	95106	95117	50 %	0 %	0 %	50 %	384549002
47	NC_017338	ATATGA	2	12	98024	98035	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384549004
48	NC_017338	AACCGA	2	12	100526	100537	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384549006
49	NC_017338	TATCAT	2	12	103801	103812	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384549008
50	NC_017338	TTTATT	2	12	104209	104220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384549009
51	NC_017338	TATTTG	2	12	104295	104306	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384549009
52	NC_017338	TAAATA	2	12	105728	105739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384549009
53	NC_017338	TTTTTC	2	12	107518	107529	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384549010
54	NC_017338	TTAAAT	2	12	107613	107624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017338	TAAGCC	2	12	109379	109390	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384549012
56	NC_017338	ATCGCA	2	12	110594	110605	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384549013
57	NC_017338	TTTGAA	2	12	111625	111636	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384549014
58	NC_017338	ACTTAG	2	12	113212	113223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384549015
59	NC_017338	TGAAGA	2	12	121417	121428	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384549021
60	NC_017338	TTTCAT	2	12	122098	122109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384549022
61	NC_017338	CATGAA	2	12	123714	123725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384549024
62	NC_017338	ATTTTT	2	12	124312	124323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384549025
63	NC_017338	TGTATA	2	12	126964	126975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384549027
64	NC_017338	AATTAT	2	12	127323	127334	50 %	50 %	0 %	0 %	384549028
65	NC_017338	TCGAAA	2	12	128465	128476	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384549029
66	NC_017338	CTATTG	2	12	131051	131062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384549031
67	NC_017338	CATATG	2	12	132254	132265	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384549032
68	NC_017338	AATGTA	2	12	133157	133168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017338	CAGATT	2	12	137898	137909	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384549037
70	NC_017338	GTTTTT	2	12	146161	146172	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017338	TGAAAG	2	12	147028	147039	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017338	GATATG	2	12	154533	154544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384549050
73	NC_017338	ATTTGA	2	12	158439	158450	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384549053
74	NC_017338	TATAAA	2	12	158970	158981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384549054
75	NC_017338	GATTTT	2	12	163132	163143	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384549058
76	NC_017338	ACAAAG	2	12	167652	167663	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384549062
77	NC_017338	TGTAAT	2	12	168676	168687	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384549063
78	NC_017338	AAAGAT	2	12	169665	169676	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384549065
79	NC_017338	ATTAAT	2	12	171572	171583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017338	CAATAT	2	12	172137	172148	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384549066
81	NC_017338	AATTAG	2	12	174874	174885	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384549070
82	NC_017338	TTGGTA	2	12	176001	176012	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384549071
83	NC_017338	GCGATT	2	12	176021	176032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384549071
84	NC_017338	AAATTT	2	12	176119	176130	50 %	50 %	0 %	0 %	384549071
85	NC_017338	CTATTA	2	12	182149	182160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384549074
86	NC_017338	TATGAT	2	12	183683	183694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384549074
87	NC_017338	ATTGAA	2	12	184134	184145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384549074
88	NC_017338	AGCAAC	2	12	190087	190098	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384549078
89	NC_017338	CACCTT	2	12	192139	192150	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384549080
90	NC_017338	ACCTTT	2	12	192644	192655	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384549080
91	NC_017338	TTTATA	2	12	192740	192751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017338	ATTAAT	2	12	192763	192774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017338	GTAAAT	2	12	196377	196388	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384549083
94	NC_017338	CACCAA	2	12	196644	196655	50 %	0 %	0 %	50 %	384549083
95	NC_017338	ATTTTA	2	12	197969	197980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384549085
96	NC_017338	TATCTT	2	12	202584	202595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384549088
97	NC_017338	ATTTGG	2	12	203597	203608	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384549089
98	NC_017338	TCCTGA	2	12	212335	212346	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384549094
99	NC_017338	TCAATT	2	12	214486	214497	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384549096
100	NC_017338	AATATG	2	12	215786	215797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384549097
101	NC_017338	AAAAAT	2	12	219278	219289	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384549099
102	NC_017338	AAAGGA	2	12	221137	221148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384549101
103	NC_017338	ACATTT	2	12	221475	221486	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384549101
104	NC_017338	TTCTTG	2	12	226403	226414	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384549105
105	NC_017338	TGGACG	2	12	236902	236913	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384549114
106	NC_017338	ATATGA	2	12	239639	239650	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017338	CAAAAC	2	12	240642	240653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384549116
108	NC_017338	TGGTAT	2	12	268528	268539	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384549137
109	NC_017338	TATAGA	2	12	271882	271893	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384549141
110	NC_017338	ATATAG	2	12	278372	278383	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017338	TTTAGA	2	12	278475	278486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384549146
112	NC_017338	ACGATG	2	12	278708	278719	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384549146
113	NC_017338	ATAATT	2	12	284650	284661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017338	GCAATT	2	12	290154	290165	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384549155
115	NC_017338	CAATTG	2	12	290716	290727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384549155
116	NC_017338	AATTAT	2	12	292072	292083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017338	AAGTAA	2	12	292449	292460	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384549157
118	NC_017338	ATAAAG	2	12	293430	293441	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384549158
119	NC_017338	AACGAT	2	12	294797	294808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017338	GACATT	2	12	295150	295161	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384549160
121	NC_017338	GATTTC	2	12	296968	296979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384549162
122	NC_017338	TTCATA	2	12	297538	297549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384549163
123	NC_017338	GATTAT	2	12	301947	301958	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384549167
124	NC_017338	ATGGTG	2	12	302080	302091	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384549167
125	NC_017338	CAGCAA	2	12	302467	302478	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384549167
126	NC_017338	TAACTT	2	12	303173	303184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017338	TCTTCA	2	12	308045	308056	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384549172
128	NC_017338	TTATCT	2	12	308141	308152	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384549172
129	NC_017338	ATTTTA	2	12	308246	308257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384549172
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132	NC_017338	AATCCT	2	12	309920	309931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384549174
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137	NC_017338	TAATTA	2	12	315923	315934	50 %	50 %	0 %	0 %	384549180
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153	NC_017338	AATGAC	2	12	354721	354732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384549215
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158	NC_017338	TTGTAA	2	12	361600	361611	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017338	AATTTT	2	12	362872	362883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384549223
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228	NC_017338	GCAAGA	2	12	511654	511665	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384549363
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235	NC_017338	AGCATT	2	12	526691	526702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384549376
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238	NC_017338	GGTAAA	2	12	531250	531261	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384549381
239	NC_017338	CAAATT	2	12	531295	531306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384549381
240	NC_017338	AATTTT	2	12	539682	539693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_017338	AATCAT	2	12	540451	540462	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384549382
242	NC_017338	CTTCAA	2	12	540622	540633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384549382
243	NC_017338	CAGGTA	2	12	541831	541842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384549383
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282	NC_017338	GATTCA	2	12	591398	591409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384549425
283	NC_017338	CGATTC	2	12	591415	591426	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384549425
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