MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 2533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017338	CAAAT	2	10	929	938	60 %	20 %	0 %	20 %	384548924
2	NC_017338	AATTT	2	10	1977	1986	40 %	60 %	0 %	0 %	384548925
3	NC_017338	CAATT	2	10	2043	2052	40 %	40 %	0 %	20 %	384548925
4	NC_017338	AAATT	2	10	2421	2430	60 %	40 %	0 %	0 %	384548925
5	NC_017338	CAAAT	2	10	4708	4717	60 %	20 %	0 %	20 %	384548928
6	NC_017338	TGAAT	2	10	6218	6227	40 %	40 %	20 %	0 %	384548928
7	NC_017338	TGAAC	2	10	6459	6468	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017338	TTCAA	2	10	7205	7214	40 %	40 %	0 %	20 %	384548929
9	NC_017338	ATCGC	2	10	9661	9670	20 %	20 %	20 %	40 %	384548930
10	NC_017338	ACAAT	2	10	10578	10587	60 %	20 %	0 %	20 %	384548931
11	NC_017338	CTTTG	2	10	11373	11382	0 %	60 %	20 %	20 %	384548931
12	NC_017338	AGGAA	2	10	13817	13826	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017338	GTAGG	2	10	13875	13884	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017338	TTATT	2	10	14914	14923	20 %	80 %	0 %	0 %	384548934
15	NC_017338	GCAAG	2	10	16088	16097	40 %	0 %	40 %	20 %	384548935
16	NC_017338	TTTGA	2	10	16247	16256	20 %	60 %	20 %	0 %	384548935
17	NC_017338	AGTTA	2	10	21562	21571	40 %	40 %	20 %	0 %	384548939
18	NC_017338	ACAAT	2	10	21583	21592	60 %	20 %	0 %	20 %	384548939
19	NC_017338	ATGTA	2	10	23121	23130	40 %	40 %	20 %	0 %	384548940
20	NC_017338	TCGAT	2	10	23285	23294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017338	ACCAA	2	10	25718	25727	60 %	0 %	0 %	40 %	384548942
22	NC_017338	ATCAA	2	10	26430	26439	60 %	20 %	0 %	20 %	384548942
23	NC_017338	GAAAC	2	10	27051	27060	60 %	0 %	20 %	20 %	384548943
24	NC_017338	GAAGT	2	10	27201	27210	40 %	20 %	40 %	0 %	384548943
25	NC_017338	ATTAT	2	10	28844	28853	40 %	60 %	0 %	0 %	384548944
26	NC_017338	AACGA	2	10	28917	28926	60 %	0 %	20 %	20 %	384548944
27	NC_017338	AAACG	2	10	30763	30772	60 %	0 %	20 %	20 %	384548946
28	NC_017338	TGGCG	2	10	31448	31457	0 %	20 %	60 %	20 %	384548946
29	NC_017338	TATGA	2	10	32132	32141	40 %	40 %	20 %	0 %	384548946
30	NC_017338	GTTGT	2	10	32525	32534	0 %	60 %	40 %	0 %	384548946
31	NC_017338	CATTA	2	10	33362	33371	40 %	40 %	0 %	20 %	384548947
32	NC_017338	TTTCA	2	10	33765	33774	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017338	AAATG	2	10	35006	35015	60 %	20 %	20 %	0 %	384548948
34	NC_017338	ATTTT	2	10	35087	35096	20 %	80 %	0 %	0 %	384548948
35	NC_017338	TAAAA	2	10	35218	35227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017338	AGATA	2	10	35376	35385	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017338	ATGAG	2	10	37710	37719	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017338	TGAAT	2	10	38057	38066	40 %	40 %	20 %	0 %	384548952
39	NC_017338	TTGGT	2	10	38099	38108	0 %	60 %	40 %	0 %	384548952
40	NC_017338	AATAT	2	10	38167	38176	60 %	40 %	0 %	0 %	384548952
41	NC_017338	TTCGT	2	10	38378	38387	0 %	60 %	20 %	20 %	384548952
42	NC_017338	CAAAA	2	10	38738	38747	80 %	0 %	0 %	20 %	384548953
43	NC_017338	AAATT	2	10	40837	40846	60 %	40 %	0 %	0 %	384548954
44	NC_017338	TTGAA	2	10	42866	42875	40 %	40 %	20 %	0 %	384548956
45	NC_017338	TTGAA	2	10	43212	43221	40 %	40 %	20 %	0 %	384548956
46	NC_017338	TTTGT	2	10	44116	44125	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017338	TTTGA	2	10	47466	47475	20 %	60 %	20 %	0 %	384548960
48	NC_017338	GTTTT	2	10	47549	47558	0 %	80 %	20 %	0 %	384548960
49	NC_017338	GTTTG	2	10	48179	48188	0 %	60 %	40 %	0 %	384548961
50	NC_017338	TTGCT	2	10	48507	48516	0 %	60 %	20 %	20 %	384548961
51	NC_017338	TATTT	2	10	52001	52010	20 %	80 %	0 %	0 %	384548964
52	NC_017338	TATGT	2	10	55262	55271	20 %	60 %	20 %	0 %	384548967
53	NC_017338	GATTT	2	10	56583	56592	20 %	60 %	20 %	0 %	384548969
54	NC_017338	AAAGA	2	10	57224	57233	80 %	0 %	20 %	0 %	384548970
55	NC_017338	ATTAT	2	10	59124	59133	40 %	60 %	0 %	0 %	384548971
56	NC_017338	TCTAC	2	10	60884	60893	20 %	40 %	0 %	40 %	384548972
57	NC_017338	CTAAA	2	10	62753	62762	60 %	20 %	0 %	20 %	384548973
58	NC_017338	AAATC	2	10	62875	62884	60 %	20 %	0 %	20 %	384548973
59	NC_017338	ATTTT	2	10	63080	63089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017338	CTATT	2	10	64234	64243	20 %	60 %	0 %	20 %	384548974
61	NC_017338	ATTTA	2	10	64684	64693	40 %	60 %	0 %	0 %	384548975
62	NC_017338	ATTTT	2	10	65023	65032	20 %	80 %	0 %	0 %	384548975
63	NC_017338	GGTAG	2	10	65516	65525	20 %	20 %	60 %	0 %	384548975
64	NC_017338	TTTTG	2	10	66641	66650	0 %	80 %	20 %	0 %	384548976
65	NC_017338	TATGA	2	10	67305	67314	40 %	40 %	20 %	0 %	384548976
66	NC_017338	CTTTT	2	10	69240	69249	0 %	80 %	0 %	20 %	384548977
67	NC_017338	TAGTA	2	10	69567	69576	40 %	40 %	20 %	0 %	384548977
68	NC_017338	GAAAA	2	10	69661	69670	80 %	0 %	20 %	0 %	384548977
69	NC_017338	AGACG	2	10	69756	69765	40 %	0 %	40 %	20 %	384548977
70	NC_017338	AAAGT	2	10	71346	71355	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017338	ATTGC	2	10	71450	71459	20 %	40 %	20 %	20 %	384548980
72	NC_017338	TGTAA	2	10	71801	71810	40 %	40 %	20 %	0 %	384548980
73	NC_017338	GTTGT	2	10	73139	73148	0 %	60 %	40 %	0 %	384548982
74	NC_017338	TGCCA	2	10	74758	74767	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017338	ATTTA	2	10	75120	75129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017338	AACAA	2	10	75712	75721	80 %	0 %	0 %	20 %	384548983
77	NC_017338	TTTTA	2	10	76073	76082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017338	TATGA	2	10	77577	77586	40 %	40 %	20 %	0 %	384548985
79	NC_017338	ATTTT	2	10	79804	79813	20 %	80 %	0 %	0 %	384548989
80	NC_017338	TATGG	2	10	81817	81826	20 %	40 %	40 %	0 %	384548991
81	NC_017338	TAACT	2	10	82122	82131	40 %	40 %	0 %	20 %	384548991
82	NC_017338	ATTCA	2	10	83095	83104	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017338	TATAT	2	10	83356	83365	40 %	60 %	0 %	0 %	384548992
84	NC_017338	GTAAA	2	10	83869	83878	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017338	CTAAT	2	10	83944	83953	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017338	GTTCT	2	10	84575	84584	0 %	60 %	20 %	20 %	384548993
87	NC_017338	TGATG	2	10	84748	84757	20 %	40 %	40 %	0 %	384548993
88	NC_017338	CAATT	2	10	85051	85060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017338	ATTTA	2	10	85676	85685	40 %	60 %	0 %	0 %	384548994
90	NC_017338	TATCA	2	10	86122	86131	40 %	40 %	0 %	20 %	384548995
91	NC_017338	GAATG	2	10	86420	86429	40 %	20 %	40 %	0 %	384548995
92	NC_017338	TTAAA	2	10	86563	86572	60 %	40 %	0 %	0 %	384548995
93	NC_017338	TACTA	2	10	89012	89021	40 %	40 %	0 %	20 %	384548998
94	NC_017338	GATAT	2	10	89298	89307	40 %	40 %	20 %	0 %	384548998
95	NC_017338	TTTAC	2	10	89421	89430	20 %	60 %	0 %	20 %	384548998
96	NC_017338	AAATC	2	10	90413	90422	60 %	20 %	0 %	20 %	384548999
97	NC_017338	ATTGC	2	10	92414	92423	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017338	TCATT	2	10	92602	92611	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017338	TGAAA	2	10	94486	94495	60 %	20 %	20 %	0 %	384549002
100	NC_017338	TCAAT	2	10	94858	94867	40 %	40 %	0 %	20 %	384549002
101	NC_017338	GTATT	2	10	95347	95356	20 %	60 %	20 %	0 %	384549003
102	NC_017338	TATAG	2	10	96877	96886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017338	ATTAT	2	10	103301	103310	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017338	GTAAT	2	10	103337	103346	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017338	ATGTT	2	10	104603	104612	20 %	60 %	20 %	0 %	384549009
106	NC_017338	TTGCG	2	10	105174	105183	0 %	40 %	40 %	20 %	384549009
107	NC_017338	AGTTA	2	10	106656	106665	40 %	40 %	20 %	0 %	384549010
108	NC_017338	TTGCG	2	10	107164	107173	0 %	40 %	40 %	20 %	384549010
109	NC_017338	AGATG	2	10	110029	110038	40 %	20 %	40 %	0 %	384549012
110	NC_017338	GAAAA	2	10	114062	114071	80 %	0 %	20 %	0 %	384549016
111	NC_017338	TGTAT	2	10	114394	114403	20 %	60 %	20 %	0 %	384549017
112	NC_017338	AATCA	2	10	117251	117260	60 %	20 %	0 %	20 %	384549018
113	NC_017338	ATTTT	2	10	117949	117958	20 %	80 %	0 %	0 %	384549019
114	NC_017338	ATCAA	2	10	117976	117985	60 %	20 %	0 %	20 %	384549019
115	NC_017338	ATCAC	2	10	119209	119218	40 %	20 %	0 %	40 %	384549020
116	NC_017338	AACGA	2	10	119886	119895	60 %	0 %	20 %	20 %	384549020
117	NC_017338	ACACA	2	10	121942	121951	60 %	0 %	0 %	40 %	384549022
118	NC_017338	GACAA	2	10	123093	123102	60 %	0 %	20 %	20 %	384549023
119	NC_017338	TCTTA	2	10	123876	123885	20 %	60 %	0 %	20 %	384549024
120	NC_017338	ATTAC	2	10	125923	125932	40 %	40 %	0 %	20 %	384549026
121	NC_017338	ATTTT	2	10	126227	126236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017338	TATCT	2	10	126583	126592	20 %	60 %	0 %	20 %	384549027
123	NC_017338	ATACG	2	10	129016	129025	40 %	20 %	20 %	20 %	384549029
124	NC_017338	TTATA	2	10	129674	129683	40 %	60 %	0 %	0 %	384549030
125	NC_017338	TTTTA	2	10	130472	130481	20 %	80 %	0 %	0 %	384549030
126	NC_017338	AATAA	2	10	131578	131587	80 %	20 %	0 %	0 %	384549031
127	NC_017338	TACGC	2	10	131845	131854	20 %	20 %	20 %	40 %	384549031
128	NC_017338	TCCCT	2	10	134654	134663	0 %	40 %	0 %	60 %	384549034
129	NC_017338	GCTTT	2	10	136888	136897	0 %	60 %	20 %	20 %	384549036
130	NC_017338	TAATT	2	10	136973	136982	40 %	60 %	0 %	0 %	384549036
131	NC_017338	ATACT	2	10	138154	138163	40 %	40 %	0 %	20 %	384549038
132	NC_017338	TAATA	2	10	139320	139329	60 %	40 %	0 %	0 %	384549039
133	NC_017338	ATTTT	2	10	140311	140320	20 %	80 %	0 %	0 %	384549040
134	NC_017338	TAAAA	2	10	140510	140519	80 %	20 %	0 %	0 %	384549040
135	NC_017338	TTGTA	2	10	142535	142544	20 %	60 %	20 %	0 %	384549042
136	NC_017338	TGCAA	2	10	143540	143549	40 %	20 %	20 %	20 %	384549043
137	NC_017338	ATATG	2	10	145513	145522	40 %	40 %	20 %	0 %	384549044
138	NC_017338	TATGA	2	10	147190	147199	40 %	40 %	20 %	0 %	384549045
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263	NC_017338	ATAAA	2	10	284639	284648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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